277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2562 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2562  glycine oxidase ThiO  100 
 
 		 331 aa  660    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.185136  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5918  glycine oxidase ThiO  59.51 
 
 		 330 aa  381  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6396  glycine oxidase ThiO  58.36 
 
 		 316 aa  368  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4173  glycine oxidase ThiO  61.32 
 
 		 334 aa  364  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.269428 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0284  glycine oxidase ThiO  56.55 
 
 		 334 aa  345  7e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0445  thiamine biosynthesis oxidoreductase  51.6 
 
 		 316 aa  338  9.999999999999999e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0009  glycine oxidase ThiO  54.15 
 
 		 338 aa  334  1e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0208  glycine oxidase ThiO  56.35 
 
 		 334 aa  334  1e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0217  D-amino acid oxidase family protein  56.35 
 
 		 334 aa  333  2e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3650  glycine oxidase ThiO  54.46 
 
 		 324 aa  326  3e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1414  glycine oxidase ThiO  51.65 
 
 		 339 aa  323  3e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0914  glycine oxidase ThiO  53.82 
 
 		 325 aa  317  1e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.173839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2166  glycine oxidase ThiO  51.72 
 
 		 337 aa  311  1e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.232699  normal  0.765835 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0041  FAD dependent oxidoreductase  55.24 
 
 		 325 aa  309  4e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.161257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2166  glycine oxidase ThiO  50 
 
 		 346 aa  288  9e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.402403 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2891  glycine oxidase ThiO  46.48 
 
 		 338 aa  280  2e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.894969  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2464  FAD dependent oxidoreductase  48.21 
 
 		 338 aa  276  3e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.750874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6222  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  47.55 
 
 		 338 aa  276  5e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3428  glycine oxidase ThiO  46.77 
 
 		 369 aa  275  8e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4092  FAD dependent oxidoreductase  46.77 
 
 		 368 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0346042  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1958  glycine oxidase ThiO  48.87 
 
 		 338 aa  272  6e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0655991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0438  glycine oxidase ThiO  36.39 
 
 		 340 aa  215  9e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.017801  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1748  glycine oxidase  36.39 
 
 		 340 aa  215  9e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0452  FAD-dependent oxidoreductase  35.29 
 
 		 354 aa  201  9.999999999999999e-51  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1786  FAD dependent oxidoreductase  39.36 
 
 		 374 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0563944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1932  FAD dependent oxidoreductase  34.02 
 
 		 410 aa  200  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1936  FAD dependent oxidoreductase  39.36 
 
 		 374 aa  199  5e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.969419  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3068  FAD dependent oxidoreductase  40.57 
 
 		 372 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0186757  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1460  hypothetical protein  33.62 
 
 		 356 aa  196  4.0000000000000005e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0947  FAD dependent oxidoreductase  36.73 
 
 		 374 aa  196  7e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0895  FAD dependent oxidoreductase  36.55 
 
 		 365 aa  195  9e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00321446  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0570  FAD dependent oxidoreductase  34.91 
 
 		 353 aa  195  1e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1456  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.81 
 
 		 394 aa  194  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.712312  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1523  hypothetical protein  33.62 
 
 		 356 aa  194  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0112  putative D-amino acid oxidase flavoprotein oxidoreductase  38.79 
 
 		 379 aa  192  6e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.333695  normal  0.56231 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0147  FAD dependent oxidoreductase  35.63 
 
 		 350 aa  192  7e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0163  FAD dependent oxidoreductase  36.39 
 
 		 410 aa  192  7e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.550604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0206  FAD dependent oxidoreductase  36.86 
 
 		 402 aa  192  8e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.573991  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0251  oxidoreductase, FAD-dependent  34.06 
 
 		 393 aa  190  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4314  FAD dependent oxidoreductase  35 
 
 		 378 aa  189  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.274376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0020  glycine oxidase ThiO  36.68 
 
 		 355 aa  189  4e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.504997 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3575  FAD dependent oxidoreductase  37.2 
 
 		 376 aa  188  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.747856  hitchhiker  0.00000218413 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3293  FAD dependent oxidoreductase  37.63 
 
 		 398 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204133 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2464  FAD dependent oxidoreductase  37.87 
 
 		 358 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.112989  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0383  putative D-amino acid oxidase flavoprotein  40.67 
 
 		 376 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3643  FAD dependent oxidoreductase  37.88 
 
 		 381 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2398  FAD dependent oxidoreductase  40.06 
 
 		 363 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2697  FAD dependent oxidoreductase  40.37 
 
 		 378 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0410  FAD dependent oxidoreductase  40.37 
 
 		 378 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.533271  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3319  FAD dependent oxidoreductase  37.58 
 
 		 381 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0038  FAD dependent oxidoreductase  35.82 
 
 		 353 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2774  FAD dependent oxidoreductase  36.59 
 
 		 386 aa  179  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3508  FAD dependent oxidoreductase  40.25 
 
 		 378 aa  180  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.544782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3008  oxidoreductase, FAD-binding  38.3 
 
 		 377 aa  180  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0328  FAD dependent oxidoreductase  41.61 
 
 		 378 aa  179  8e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0337  FAD dependent oxidoreductase  41.3 
 
 		 378 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.832252  normal  0.324335 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0389  FAD dependent oxidoreductase  40.85 
 
 		 378 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2730  oxidoreductase, FAD-binding  37.58 
 
 		 377 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3710  oxidoreductase, FAD-binding  37.58 
 
 		 377 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1773  glycine oxidase ThiO  37.58 
 
 		 377 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3224  glycine oxidase ThiO  37.58 
 
 		 377 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2780  glycine oxidase ThiO  37.58 
 
 		 377 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3739  glycine oxidase ThiO  37.58 
 
 		 377 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3681  glycine oxidase ThiO  37.58 
 
 		 377 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0313  FAD dependent oxidoreductase  40.31 
 
 		 378 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2431  FAD dependent oxidoreductase  35.9 
 
 		 367 aa  158  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.779457 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1609  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO, putative  33.63 
 
 		 360 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.575711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10420  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  35.98 
 
 		 340 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.219353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0708  glycine oxidase ThiO  36.75 
 
 		 338 aa  132  9e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3748  glycine oxidase ThiO  32.26 
 
 		 342 aa  125  8.000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  32.94 
 
 		 375 aa  124  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0535  glycine oxidase ThiO  34.73 
 
 		 338 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0545  glycine oxidase ThiO  34.73 
 
 		 338 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0557  glycine oxidase ThiO  34.73 
 
 		 338 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.959703  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0197  glycine oxidase ThiO  37.39 
 
 		 342 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  32.39 
 
 		 382 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  32.08 
 
 		 404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  29.94 
 
 		 374 aa  108  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  33.24 
 
 		 385 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  34.2 
 
 		 375 aa  106  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  33.81 
 
 		 392 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1152  glycine oxidase ThiO  31.53 
 
 		 360 aa  104  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  32.3 
 
 		 349 aa  99  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0408  glycine oxidase ThiO  31.66 
 
 		 335 aa  98.6  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0882665  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  30.73 
 
 		 440 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  29.89 
 
 		 411 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  31.64 
 
 		 372 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4390  glycine oxidase ThiO  30.84 
 
 		 361 aa  90.9  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3405  glycine oxidase ThiO  31.03 
 
 		 371 aa  91.3  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289575  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  27.97 
 
 		 405 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  29.67 
 
 		 376 aa  89.7  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  30.64 
 
 		 388 aa  89  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  31 
 
 		 391 aa  86.3  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  31.87 
 
 		 398 aa  85.5  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  27.64 
 
 		 368 aa  83.6  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  27.78 
 
 		 652 aa  82.8  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0580  glycine oxidase ThiO  29.74 
 
 		 406 aa  82.8  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590429  decreased coverage  0.00474558 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0964  glycine oxidase ThiO  29.2 
 
 		 373 aa  82  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  28.25 
 
 		 368 aa  81.6  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4885  glycine oxidase ThiO  27.27 
 
 		 384 aa  81.3  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>