More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2192 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2192  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
375 aa  761    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1426  FAD dependent oxidoreductase  71.58 
 
 
374 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0313349  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1848  FAD dependent oxidoreductase  65.14 
 
 
373 aa  508  1e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.344381  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2430  FAD dependent oxidoreductase  64.32 
 
 
371 aa  501  1e-141  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0834847  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2742  DadA family oxidoreductase  64.05 
 
 
371 aa  498  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00153462  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2529  DadA family oxidoreductase  64.05 
 
 
371 aa  499  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0933493  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2489  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  64.32 
 
 
371 aa  500  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000926626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2454  D-amino acid dehydrogenase small subunit  64.05 
 
 
371 aa  500  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2728  oxidoreductase, DadA family  64.32 
 
 
371 aa  501  1e-140  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000981681 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2715  DadA family oxidoreductase  64.05 
 
 
371 aa  499  1e-140  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2777  oxidoreductase, DadA family  63.78 
 
 
371 aa  499  1e-140  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.848486  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2732  oxidoreductase, DadA family  63.51 
 
 
371 aa  496  1e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2569  oxidoreductase, DadA family  63.51 
 
 
371 aa  496  1e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0599885 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1828  FAD dependent oxidoreductase  48.89 
 
 
371 aa  330  3e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10140  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  44.57 
 
 
371 aa  278  8e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.502087 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3977  FAD dependent oxidoreductase  36.69 
 
 
377 aa  248  2e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1201  iminodiacetate oxidase, putative  36.7 
 
 
367 aa  246  4e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1225  oxidoreductase, DadA family protein/D-amino acid oxidase  39.44 
 
 
363 aa  238  9e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1324  FAD dependent oxidoreductase  36.54 
 
 
375 aa  220  3e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0188  FAD dependent oxidoreductase  45.83 
 
 
380 aa  213  5.999999999999999e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.887396  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2067  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  37.29 
 
 
370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2101  FAD dependent oxidoreductase  38.44 
 
 
372 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  30.73 
 
 
363 aa  134  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60270  putative glycine/D-amino acid oxidases  30.83 
 
 
364 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000302001 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  30.75 
 
 
365 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4841  FAD dependent oxidoreductase  29.44 
 
 
366 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.388467  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5188  glycine oxidase ThiO  30.25 
 
 
404 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0721  FAD dependent oxidoreductase  29.89 
 
 
367 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  28.85 
 
 
365 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0817  oxidoreductase, FAD-binding protein  30.08 
 
 
367 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  29.76 
 
 
382 aa  124  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  27.73 
 
 
365 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4550  glycine oxidase ThiO  29.09 
 
 
365 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2483  glycine oxidase ThiO  32.15 
 
 
385 aa  122  8e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  28.57 
 
 
375 aa  122  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  29.03 
 
 
361 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  28.03 
 
 
367 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  29.55 
 
 
376 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  29.59 
 
 
368 aa  110  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  30.17 
 
 
375 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  29.84 
 
 
378 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3051  FAD dependent oxidoreductase  27.39 
 
 
366 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0899897 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5037  FAD dependent oxidoreductase  27.68 
 
 
360 aa  107  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.484973 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  26.23 
 
 
395 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  29.05 
 
 
374 aa  104  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  30.71 
 
 
392 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  27.34 
 
 
394 aa  102  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0094  glycine oxidase ThiO  31.87 
 
 
368 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.883041  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  31.16 
 
 
388 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2715  oxidoreductase, FAD-binding  27.7 
 
 
361 aa  99  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725073  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1624  FAD dependent oxidoreductase  26.85 
 
 
363 aa  98.6  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.909673  hitchhiker  0.0000164974 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1956  oxidoreductase, FAD-binding  26.85 
 
 
363 aa  98.6  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.034563  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3277  FAD dependent oxidoreductase  26.98 
 
 
367 aa  99  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.403037 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  26.49 
 
 
376 aa  98.2  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0157  glycine oxidase ThiO  29.82 
 
 
376 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0146  glycine oxidase ThiO  29.82 
 
 
376 aa  97.1  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473112  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  26.8 
 
 
419 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 
394 aa  95.9  9e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  27.88 
 
 
382 aa  95.9  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  26.17 
 
 
417 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  30.7 
 
 
372 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  25.94 
 
 
417 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  28.57 
 
 
405 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  27.05 
 
 
404 aa  94.7  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1783  FAD dependent oxidoreductase  24.87 
 
 
381 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.359042  normal  0.766074 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  29.81 
 
 
375 aa  93.2  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  25.13 
 
 
368 aa  92.4  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  25.98 
 
 
394 aa  89.7  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  27.82 
 
 
391 aa  89  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5036  glycine oxidase ThiO  27.12 
 
 
360 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0136  FAD dependent oxidoreductase  28.23 
 
 
361 aa  89  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3116  glycine oxidase ThiO  27.4 
 
 
393 aa  88.6  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248059  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3234  glycine oxidase ThiO  26.49 
 
 
372 aa  88.2  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  26.75 
 
 
376 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3748  glycine oxidase ThiO  27.13 
 
 
342 aa  87  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  25.49 
 
 
379 aa  87  5e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  26.11 
 
 
390 aa  86.7  6e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  27.87 
 
 
440 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1415  glycine oxidase ThiO  27.38 
 
 
377 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  26.45 
 
 
367 aa  85.9  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  24.67 
 
 
378 aa  85.5  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4123  hypothetical protein  28.5 
 
 
371 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00603105  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  24.74 
 
 
819 aa  84.3  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  27.87 
 
 
411 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0725  D-amino-acid dehydrogenase  25.47 
 
 
414 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0605876  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4885  glycine oxidase ThiO  27.66 
 
 
384 aa  83.6  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0868  FAD dependent oxidoreductase  26.41 
 
 
446 aa  83.2  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.585687  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0720  FAD-dependent oxidoreductase  25.97 
 
 
416 aa  83.2  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3940  D-amino-acid dehydrogenase  24.88 
 
 
414 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401149  hitchhiker  0.00412438 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0742  FAD dependent oxidoreductase  25.23 
 
 
414 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0018802 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0900  FAD dependent oxidoreductase  23.13 
 
 
417 aa  82.4  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1152  glycine oxidase ThiO  26.58 
 
 
360 aa  80.9  0.00000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2176  FAD dependent oxidoreductase  25.06 
 
 
414 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0832957  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3596  FAD dependent oxidoreductase  24.64 
 
 
414 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.953552  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  21.79 
 
 
372 aa  79  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2537  FAD dependent oxidoreductase  28.99 
 
 
414 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.654937  normal  0.300039 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2320  FAD dependent oxidoreductase  26.32 
 
 
414 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.63288  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  25.94 
 
 
382 aa  78.6  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1686  FAD dependent oxidoreductase  22.59 
 
 
401 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.470832  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01740  glycine oxidase ThiO  27.13 
 
 
388 aa  78.6  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>