More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0188 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0188  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 380 aa  705    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.887396  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2732  oxidoreductase, DadA family  45.28 
 
 		 371 aa  311  1e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2569  oxidoreductase, DadA family  45.55 
 
 		 371 aa  311  1e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0599885 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2454  D-amino acid dehydrogenase small subunit  45.01 
 
 		 371 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295637  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2529  DadA family oxidoreductase  45.28 
 
 		 371 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0933493  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2728  oxidoreductase, DadA family  45.28 
 
 		 371 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000981681 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2715  DadA family oxidoreductase  45.28 
 
 		 371 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2489  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  45.01 
 
 		 371 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000926626  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2430  FAD dependent oxidoreductase  44.74 
 
 		 371 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0834847  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1848  FAD dependent oxidoreductase  44.74 
 
 		 373 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.344381  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2742  DadA family oxidoreductase  45.28 
 
 		 371 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00153462  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2777  oxidoreductase, DadA family  45.01 
 
 		 371 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.848486  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2192  FAD dependent oxidoreductase  46.15 
 
 		 375 aa  301  9e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1426  FAD dependent oxidoreductase  47.4 
 
 		 374 aa  293  5e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0313349  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10140  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  50.4 
 
 		 371 aa  286  4e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.502087 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1828  FAD dependent oxidoreductase  46.88 
 
 		 371 aa  281  1e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3977  FAD dependent oxidoreductase  42.82 
 
 		 377 aa  228  2e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2101  FAD dependent oxidoreductase  47.67 
 
 		 372 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1324  FAD dependent oxidoreductase  38.36 
 
 		 375 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1201  iminodiacetate oxidase, putative  30.5 
 
 		 367 aa  155  1e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  36.44 
 
 		 382 aa  151  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1225  oxidoreductase, DadA family protein/D-amino acid oxidase  31.97 
 
 		 363 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  34.84 
 
 		 374 aa  145  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  37.04 
 
 		 404 aa  144  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  38.1 
 
 		 375 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  38.2 
 
 		 376 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  35.81 
 
 		 405 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  34.76 
 
 		 378 aa  135  8e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  37.64 
 
 		 372 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  33.95 
 
 		 361 aa  133  6e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  36.51 
 
 		 440 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  36.64 
 
 		 411 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  32.12 
 
 		 378 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  29.27 
 
 		 376 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  36.61 
 
 		 391 aa  125  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  31.68 
 
 		 375 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  33.96 
 
 		 363 aa  125  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0157  glycine oxidase ThiO  38.46 
 
 		 376 aa  123  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3234  glycine oxidase ThiO  31.72 
 
 		 372 aa  122  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0721  FAD dependent oxidoreductase  30.28 
 
 		 367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0146  glycine oxidase ThiO  37.93 
 
 		 376 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473112  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  35.43 
 
 		 388 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  35.99 
 
 		 375 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  29.1 
 
 		 367 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3116  glycine oxidase ThiO  36.31 
 
 		 393 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2067  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  30.45 
 
 		 370 aa  117  3e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  39.52 
 
 		 410 aa  117  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0817  oxidoreductase, FAD-binding protein  29.44 
 
 		 367 aa  116  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  27.91 
 
 		 367 aa  116  7.999999999999999e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  37.21 
 
 		 392 aa  115  8.999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  30.52 
 
 		 365 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4841  FAD dependent oxidoreductase  31.11 
 
 		 366 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.388467  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4550  glycine oxidase ThiO  31.23 
 
 		 365 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60270  putative glycine/D-amino acid oxidases  32.51 
 
 		 364 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000302001 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  29.97 
 
 		 365 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  30.16 
 
 		 365 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  28.95 
 
 		 368 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7518  glycine oxidase ThiO  37.41 
 
 		 402 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316675  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  29.81 
 
 		 419 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31544  predicted protein  30.45 
 
 		 1033 aa  110  5e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  32.89 
 
 		 371 aa  109  8.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  31.2 
 
 		 394 aa  108  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5188  glycine oxidase ThiO  32.07 
 
 		 404 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  30.67 
 
 		 394 aa  108  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1624  FAD dependent oxidoreductase  28.69 
 
 		 363 aa  107  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.909673  hitchhiker  0.0000164974 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1956  oxidoreductase, FAD-binding  28.69 
 
 		 363 aa  107  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.034563  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4885  glycine oxidase ThiO  33.69 
 
 		 384 aa  106  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1018  FAD dependent oxidoreductase  27.9 
 
 		 415 aa  105  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0864419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  28.34 
 
 		 652 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2172  FAD dependent oxidoreductase  28.53 
 
 		 380 aa  105  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  30.93 
 
 		 368 aa  104  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4123  hypothetical protein  33.99 
 
 		 371 aa  103  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00603105  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0580  glycine oxidase ThiO  35.26 
 
 		 406 aa  103  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590429  decreased coverage  0.00474558 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  29.58 
 
 		 394 aa  103  7e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1346  D-amino acid oxidase  27.83 
 
 		 415 aa  102  9e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0584052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0094  glycine oxidase ThiO  34.22 
 
 		 368 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.883041  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2502  glycine oxidase ThiO  31.31 
 
 		 454 aa  102  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131028 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  31.11 
 
 		 349 aa  99.8  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4777  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.51 
 
 		 416 aa  99.8  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565064  normal  0.111911 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4274  FAD dependent oxidoreductase  26.35 
 
 		 418 aa  99.4  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  28.46 
 
 		 379 aa  99.4  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  28.61 
 
 		 417 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  29.69 
 
 		 417 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2483  glycine oxidase ThiO  33.69 
 
 		 385 aa  98.2  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6008  SoxB2  37.44 
 
 		 379 aa  97.8  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00127478  normal  0.130354 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  26.94 
 
 		 666 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  25.55 
 
 		 369 aa  96.7  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0495  glycine oxidase ThiO  34.09 
 
 		 395 aa  95.9  9e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233014 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  31.79 
 
 		 375 aa  94.7  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  32.45 
 
 		 385 aa  95.1  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  28.35 
 
 		 395 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0415  D-amino acid dehydrogenase small subunit  36.49 
 
 		 421 aa  94  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000453609  normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  31.82 
 
 		 401 aa  93.6  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  25.85 
 
 		 382 aa  93.6  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1415  glycine oxidase ThiO  38.86 
 
 		 377 aa  93.6  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  26.67 
 
 		 666 aa  93.2  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  24.73 
 
 		 369 aa  93.2  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  25.27 
 
 		 369 aa  92.8  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  25.27 
 
 		 369 aa  92.8  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2715  oxidoreductase, FAD-binding  31.89 
 
 		 361 aa  92.4  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>