More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1225 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1225  oxidoreductase, DadA family protein/D-amino acid oxidase  100 
 
 		 363 aa  735    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1201  iminodiacetate oxidase, putative  60.06 
 
 		 367 aa  449  1e-125  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2489  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  38.78 
 
 		 371 aa  241  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000926626  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2529  DadA family oxidoreductase  38.67 
 
 		 371 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0933493  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2715  DadA family oxidoreductase  38.67 
 
 		 371 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2192  FAD dependent oxidoreductase  39.44 
 
 		 375 aa  238  9e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2728  oxidoreductase, DadA family  38.5 
 
 		 371 aa  238  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000981681 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2777  oxidoreductase, DadA family  38.78 
 
 		 371 aa  237  3e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.848486  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1848  FAD dependent oxidoreductase  37.95 
 
 		 373 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.344381  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2454  D-amino acid dehydrogenase small subunit  38.23 
 
 		 371 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295637  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2742  DadA family oxidoreductase  38.5 
 
 		 371 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00153462  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2732  oxidoreductase, DadA family  37.95 
 
 		 371 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2569  oxidoreductase, DadA family  37.95 
 
 		 371 aa  232  6e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0599885 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2430  FAD dependent oxidoreductase  37.12 
 
 		 371 aa  229  5e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0834847  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1426  FAD dependent oxidoreductase  37.23 
 
 		 374 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0313349  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2067  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  40.43 
 
 		 370 aa  212  7e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1828  FAD dependent oxidoreductase  31.62 
 
 		 371 aa  176  7e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10140  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  29.58 
 
 		 371 aa  142  8e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.502087 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3977  FAD dependent oxidoreductase  29.91 
 
 		 377 aa  129  8.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1324  FAD dependent oxidoreductase  26.83 
 
 		 375 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  28.84 
 
 		 363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0721  FAD dependent oxidoreductase  28.29 
 
 		 367 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0188  FAD dependent oxidoreductase  30.68 
 
 		 380 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.887396  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60270  putative glycine/D-amino acid oxidases  29.48 
 
 		 364 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000302001 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0817  oxidoreductase, FAD-binding protein  27.53 
 
 		 367 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  26.19 
 
 		 361 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5188  glycine oxidase ThiO  27.88 
 
 		 404 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5037  FAD dependent oxidoreductase  26.22 
 
 		 360 aa  90.1  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.484973 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4841  FAD dependent oxidoreductase  26.82 
 
 		 366 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.388467  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  27.55 
 
 		 365 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  26.16 
 
 		 367 aa  89.4  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  27 
 
 		 365 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  27.17 
 
 		 365 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  26.72 
 
 		 368 aa  85.5  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1624  FAD dependent oxidoreductase  27.12 
 
 		 363 aa  85.1  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.909673  hitchhiker  0.0000164974 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1956  oxidoreductase, FAD-binding  27.12 
 
 		 363 aa  85.1  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.034563  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0783  putative FAD dependent oxidoreductase  26.22 
 
 		 355 aa  84  0.000000000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2101  FAD dependent oxidoreductase  26.8 
 
 		 372 aa  83.6  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  24.79 
 
 		 368 aa  82.8  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1461  FAD dependent oxidoreductase  24.55 
 
 		 379 aa  80.5  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942129  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4550  glycine oxidase ThiO  26.89 
 
 		 365 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  25.07 
 
 		 375 aa  78.2  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0813  FAD dependent oxidoreductase  28.17 
 
 		 441 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  24.13 
 
 		 376 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2304  D-amino-acid dehydrogenase  25.18 
 
 		 421 aa  72.8  0.000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.018021 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  23.98 
 
 		 369 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  23.71 
 
 		 369 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3277  FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 		 367 aa  71.2  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.403037 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1415  glycine oxidase ThiO  26.82 
 
 		 377 aa  70.5  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  22.95 
 
 		 369 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  23.04 
 
 		 369 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  23.04 
 
 		 369 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  22.76 
 
 		 369 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2256  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.38 
 
 		 428 aa  68.9  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000681381  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  22.76 
 
 		 369 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0804  D-amino acid dehydrogenase small subunit  24.76 
 
 		 433 aa  68.9  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3174  FAD dependent oxidoreductase  22.86 
 
 		 418 aa  68.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  23.31 
 
 		 369 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  23.31 
 
 		 369 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  22.76 
 
 		 369 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2172  FAD dependent oxidoreductase  23.01 
 
 		 380 aa  66.2  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  24.21 
 
 		 417 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  20.62 
 
 		 369 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5199  FAD dependent oxidoreductase  21.52 
 
 		 440 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494361 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1686  FAD dependent oxidoreductase  22.58 
 
 		 401 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.470832  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  21.83 
 
 		 390 aa  64.7  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1301  D-amino acid dehydrogenase small subunit  24.18 
 
 		 418 aa  64.7  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3551  FAD dependent oxidoreductase  23.24 
 
 		 375 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4821  D-amino-acid dehydrogenase  24.94 
 
 		 419 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052408 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3433  FAD dependent oxidoreductase  26.03 
 
 		 414 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3378  FAD dependent oxidoreductase  23.78 
 
 		 375 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0136  FAD dependent oxidoreductase  23.32 
 
 		 361 aa  63.2  0.000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5073  FAD dependent oxidoreductase  24.93 
 
 		 427 aa  62.8  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4225  FAD dependent oxidoreductase  23.51 
 
 		 375 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211166  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4141  FAD dependent oxidoreductase  23.51 
 
 		 375 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659228  normal  0.0539213 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4032  FAD dependent oxidoreductase  24.52 
 
 		 375 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2715  oxidoreductase, FAD-binding  23.04 
 
 		 361 aa  61.6  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725073  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1957  D-amino acid dehydrogenase small subunit  24.24 
 
 		 417 aa  61.6  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1783  FAD dependent oxidoreductase  23.26 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.359042  normal  0.766074 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0827  D-amino-acid dehydrogenase  29 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.365024  normal  0.0750347 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3051  FAD dependent oxidoreductase  25.84 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0899897 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2483  glycine oxidase ThiO  23.33 
 
 		 385 aa  61.2  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3117  D-amino acid dehydrogenase small subunit  23.9 
 
 		 432 aa  60.8  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1893  FAD dependent oxidoreductase  23.24 
 
 		 375 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4843  FAD dependent oxidoreductase  28.38 
 
 		 416 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570392  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0240  FAD dependent oxidoreductase  26.55 
 
 		 425 aa  61.2  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  24.77 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0200  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.87 
 
 		 433 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229652 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0101  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  28.65 
 
 		 433 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4446  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 375 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.750872 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0235  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.09 
 
 		 433 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  24.39 
 
 		 375 aa  60.5  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1546  FAD dependent oxidoreductase  23.36 
 
 		 419 aa  60.1  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2253  D-amino acid dehydrogenase small subunit  24 
 
 		 417 aa  59.7  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.299864  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  22.47 
 
 		 395 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2517  hypothetical protein  25.49 
 
 		 585 aa  59.3  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5270  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.32 
 
 		 434 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0829502  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2712  FAD dependent oxidoreductase  26.13 
 
 		 415 aa  59.3  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5180  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.32 
 
 		 434 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0763537 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3234  glycine oxidase ThiO  23.27 
 
 		 372 aa  58.9  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>