More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5073 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5073  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 427 aa  845    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1686  FAD dependent oxidoreductase  31.79 
 
 		 401 aa  130  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.470832  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2446  putative glycine oxidase  27.73 
 
 		 391 aa  125  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.602268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3378  FAD dependent oxidoreductase  31.68 
 
 		 375 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  30.43 
 
 		 378 aa  124  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4225  FAD dependent oxidoreductase  31.41 
 
 		 375 aa  124  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211166  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4141  FAD dependent oxidoreductase  31.41 
 
 		 375 aa  124  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659228  normal  0.0539213 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2638  FAD dependent oxidoreductase  26.93 
 
 		 391 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.071101  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4446  FAD dependent oxidoreductase  32.12 
 
 		 375 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.750872 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4107  FAD dependent oxidoreductase  31.07 
 
 		 393 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0968917  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2560  sarcosine oxidase, beta subunit  26.67 
 
 		 391 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1893  FAD dependent oxidoreductase  30.65 
 
 		 375 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2841  putative glycine oxidase  26.67 
 
 		 391 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111292 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4032  FAD dependent oxidoreductase  31.41 
 
 		 375 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2886  putative glycine oxidase  26.67 
 
 		 391 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8732  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3551  FAD dependent oxidoreductase  31.41 
 
 		 375 aa  120  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5919  FAD dependent oxidoreductase  30.13 
 
 		 398 aa  119  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000776638  normal  0.0692698 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31600  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  30.39 
 
 		 389 aa  119  7.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2595  sarcosine oxidase, beta subunit  26.4 
 
 		 391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2644  glycine oxidase  26.4 
 
 		 391 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.746701  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5219  FAD dependent oxidoreductase  31.37 
 
 		 368 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0233742  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2835  glycine oxidase  26.4 
 
 		 391 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0387982  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2847  putative glycine oxidase  30.03 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0255303  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0082  FAD dependent oxidoreductase  31.38 
 
 		 393 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2500  FAD dependent oxidoreductase  28.99 
 
 		 370 aa  113  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.50654  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2864  glycine oxidase, putative  26.82 
 
 		 375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 		 382 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47850  hypothetical protein  30.99 
 
 		 371 aa  110  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000392863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2066  oxidoreductase, FAD-binding family protein  31.87 
 
 		 377 aa  109  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4668  FAD dependent oxidoreductase  31.55 
 
 		 379 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0623925  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4123  hypothetical protein  30.34 
 
 		 371 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00603105  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4561  FAD dependent oxidoreductase  31.36 
 
 		 375 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  27.23 
 
 		 368 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1841  FAD dependent oxidoreductase  27.54 
 
 		 374 aa  103  8e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  27.55 
 
 		 361 aa  101  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  25.89 
 
 		 381 aa  99.4  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01436  D-amino acid oxidase  27.86 
 
 		 378 aa  98.6  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.337919  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  31.7 
 
 		 376 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0571  FAD-dependent oxidoreductase  31.87 
 
 		 377 aa  98.2  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.105035  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  26.92 
 
 		 368 aa  97.8  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1888  oxidoreductase, FAD-binding family protein  31.61 
 
 		 377 aa  97.8  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0474  FAD-dependent oxidoreductase  31.61 
 
 		 377 aa  97.8  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  31.55 
 
 		 388 aa  97.1  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  24.11 
 
 		 382 aa  97.1  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6008  SoxB2  29.24 
 
 		 379 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00127478  normal  0.130354 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1418  oxidoreductase, FAD-binding family protein  31.62 
 
 		 380 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0869563  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2196  oxidoreductase, FAD-binding family protein  31.62 
 
 		 380 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270908  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0882  oxidoreductase, FAD-binding family protein  32.56 
 
 		 383 aa  94  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  30.79 
 
 		 375 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0875  putative oxidoreductase  29.23 
 
 		 376 aa  92.8  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.960065  normal  0.263987 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3929  FAD dependent oxidoreductase  29.2 
 
 		 386 aa  91.7  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.371488  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1415  glycine oxidase ThiO  31.19 
 
 		 377 aa  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  26.75 
 
 		 371 aa  91.7  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  27.71 
 
 		 375 aa  92  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  22.25 
 
 		 369 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6437  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 		 441 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6672  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 		 441 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4841  FAD dependent oxidoreductase  28.91 
 
 		 366 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.388467  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  22.52 
 
 		 369 aa  90.1  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6270  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 		 441 aa  90.1  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119616 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  22.87 
 
 		 369 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  22.25 
 
 		 369 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  22.61 
 
 		 369 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  29 
 
 		 365 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1324  FAD dependent oxidoreductase  26.88 
 
 		 375 aa  89.7  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  22.79 
 
 		 369 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  22.79 
 
 		 369 aa  88.6  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1649  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 		 441 aa  89  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.756737  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  29 
 
 		 365 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  27.78 
 
 		 417 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  26.82 
 
 		 363 aa  87.8  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0928  FAD dependent oxidoreductase  28.05 
 
 		 383 aa  87.4  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  24.64 
 
 		 419 aa  87  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  22.52 
 
 		 369 aa  86.7  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  22.52 
 
 		 369 aa  86.7  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  27.51 
 
 		 500 aa  86.3  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  24.54 
 
 		 367 aa  85.9  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  29.71 
 
 		 401 aa  85.9  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  26.47 
 
 		 428 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 		 500 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  22.52 
 
 		 369 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  28.25 
 
 		 417 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6064  FAD dependent oxidoreductase  27.91 
 
 		 441 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0688  FAD dependent oxidoreductase  29.01 
 
 		 382 aa  84.7  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.148887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  28.14 
 
 		 365 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  21.72 
 
 		 369 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0813  FAD dependent oxidoreductase  24.51 
 
 		 441 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  25.14 
 
 		 367 aa  83.6  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6383  FAD dependent oxidoreductase  28.02 
 
 		 389 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6616  FAD dependent oxidoreductase  28.02 
 
 		 389 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  27.14 
 
 		 390 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6361  FAD dependent oxidoreductase  27.52 
 
 		 441 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0721  FAD dependent oxidoreductase  28.39 
 
 		 367 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  26.99 
 
 		 496 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6214  FAD dependent oxidoreductase  29.53 
 
 		 389 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5907  FAD dependent oxidoreductase  27.73 
 
 		 441 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  28.41 
 
 		 652 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60270  putative glycine/D-amino acid oxidases  31.5 
 
 		 364 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000302001 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5188  glycine oxidase ThiO  31.5 
 
 		 404 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  23.68 
 
 		 390 aa  80.1  0.00000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>