199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2067 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2067  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  100 
 
 		 370 aa  756    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1201  iminodiacetate oxidase, putative  41.82 
 
 		 367 aa  249  8e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1225  oxidoreductase, DadA family protein/D-amino acid oxidase  40.97 
 
 		 363 aa  233  4.0000000000000004e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2192  FAD dependent oxidoreductase  38.04 
 
 		 375 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1426  FAD dependent oxidoreductase  35.71 
 
 		 374 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0313349  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1848  FAD dependent oxidoreductase  35.23 
 
 		 373 aa  218  1e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.344381  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2742  DadA family oxidoreductase  33.05 
 
 		 371 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00153462  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2454  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.62 
 
 		 371 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295637  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2430  FAD dependent oxidoreductase  33.05 
 
 		 371 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0834847  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2777  oxidoreductase, DadA family  33.33 
 
 		 371 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.848486  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2529  DadA family oxidoreductase  33.62 
 
 		 371 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0933493  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2715  DadA family oxidoreductase  33.62 
 
 		 371 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2728  oxidoreductase, DadA family  33.62 
 
 		 371 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000981681 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2489  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  33.33 
 
 		 371 aa  196  6e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000926626  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2732  oxidoreductase, DadA family  33.05 
 
 		 371 aa  196  6e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2569  oxidoreductase, DadA family  33.05 
 
 		 371 aa  196  7e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0599885 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1828  FAD dependent oxidoreductase  28.69 
 
 		 371 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1324  FAD dependent oxidoreductase  28.26 
 
 		 375 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10140  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  26.92 
 
 		 371 aa  119  7.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.502087 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3977  FAD dependent oxidoreductase  23.55 
 
 		 377 aa  104  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2101  FAD dependent oxidoreductase  24.37 
 
 		 372 aa  82.8  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  26.68 
 
 		 363 aa  81.6  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0188  FAD dependent oxidoreductase  30.22 
 
 		 380 aa  82  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.887396  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4457  nopaline dehydrogenase, putative  23.66 
 
 		 375 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000050216 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0920  FAD dependent oxidoreductase  24.86 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0105145  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0783  putative FAD dependent oxidoreductase  24.48 
 
 		 355 aa  70.1  0.00000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  24.37 
 
 		 365 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4173  glycine oxidase ThiO  25.17 
 
 		 334 aa  68.9  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.269428 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  25.71 
 
 		 376 aa  68.2  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  23.43 
 
 		 375 aa  68.2  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3588  FAD dependent oxidoreductase  23.25 
 
 		 354 aa  67.8  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.109296 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  24.37 
 
 		 365 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3277  FAD dependent oxidoreductase  25.22 
 
 		 367 aa  66.6  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.403037 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60270  putative glycine/D-amino acid oxidases  24.64 
 
 		 364 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000302001 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5188  glycine oxidase ThiO  25.14 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  24.09 
 
 		 365 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4550  glycine oxidase ThiO  24.58 
 
 		 365 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4032  FAD dependent oxidoreductase  23.62 
 
 		 375 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6396  glycine oxidase ThiO  24.83 
 
 		 316 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  24.36 
 
 		 375 aa  62  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3051  FAD dependent oxidoreductase  25.07 
 
 		 366 aa  62.8  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0899897 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  24.86 
 
 		 392 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3551  FAD dependent oxidoreductase  23.62 
 
 		 375 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0817  oxidoreductase, FAD-binding protein  25 
 
 		 367 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  24.09 
 
 		 382 aa  60.8  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  24.46 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4446  FAD dependent oxidoreductase  23.87 
 
 		 375 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.750872 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0198  FAD dependent oxidoreductase  24 
 
 		 408 aa  59.7  0.00000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.777626  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0721  FAD dependent oxidoreductase  23.66 
 
 		 367 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18391  NAD binding site:D-amino acid oxidase  22.4 
 
 		 371 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.299081  normal  0.626898 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4841  FAD dependent oxidoreductase  25.07 
 
 		 366 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.388467  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2673  D-amino acid oxidase  23.72 
 
 		 350 aa  58.5  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0452  FAD-dependent oxidoreductase  21.78 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  24.52 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2748  oxidoreductase, FAD-binding family protein  23.57 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.252588  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3378  FAD dependent oxidoreductase  23.64 
 
 		 375 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0210  FAD dependent oxidoreductase  23.2 
 
 		 401 aa  57  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.853953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  22.25 
 
 		 367 aa  57  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0571  oxidoreductase, FAD-binding family protein  23.57 
 
 		 418 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2867  oxidoreductase, FAD-binding family protein  23.57 
 
 		 418 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1760  oxidoreductase, FAD-binding family protein  23.23 
 
 		 390 aa  57  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2435  oxidoreductase, FAD-binding family protein  23.57 
 
 		 390 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0467125  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2845  oxidoreductase, FAD-binding family protein  23.57 
 
 		 433 aa  57  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2808  oxidoreductase, FAD-binding family protein  23.57 
 
 		 390 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1757  oxidoreductase, FAD-binding family protein  23.57 
 
 		 390 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283784  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1624  FAD dependent oxidoreductase  21.58 
 
 		 363 aa  56.6  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.909673  hitchhiker  0.0000164974 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4343  FAD dependent oxidoreductase  23.81 
 
 		 375 aa  56.6  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290425  normal  0.660783 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1956  oxidoreductase, FAD-binding  21.58 
 
 		 363 aa  56.6  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.034563  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  24.27 
 
 		 378 aa  56.2  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0928  FAD dependent oxidoreductase  22.81 
 
 		 383 aa  56.2  0.0000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  22.04 
 
 		 368 aa  55.8  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4757  FAD dependent oxidoreductase  22.89 
 
 		 390 aa  55.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1841  FAD dependent oxidoreductase  24.59 
 
 		 374 aa  54.7  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8303  D-nopaline dehydrogenase  24.34 
 
 		 356 aa  54.7  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.039629  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4916  FAD dependent oxidoreductase  22.94 
 
 		 815 aa  55.5  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  27.05 
 
 		 375 aa  54.3  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0136  FAD dependent oxidoreductase  20.51 
 
 		 361 aa  54.3  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1628  FAD dependent oxidoreductase  23.03 
 
 		 478 aa  54.3  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.855011  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0094  glycine oxidase ThiO  25.55 
 
 		 368 aa  54.3  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.883041  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1893  FAD dependent oxidoreductase  21.78 
 
 		 375 aa  53.9  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  24.68 
 
 		 349 aa  54.3  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1501  FAD dependent oxidoreductase  23.42 
 
 		 362 aa  53.9  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655883 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  21.53 
 
 		 372 aa  53.5  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1418  FAD dependent oxidoreductase  22.85 
 
 		 381 aa  53.5  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1765  hypothetical protein  22.29 
 
 		 372 aa  53.5  0.000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3496  FAD dependent oxidoreductase  21.88 
 
 		 405 aa  53.1  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177627 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3229  FAD dependent oxidoreductase  22.28 
 
 		 391 aa  52.4  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267382  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1390  hypothetical protein  22.81 
 
 		 622 aa  52.4  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.909333 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4225  FAD dependent oxidoreductase  21.78 
 
 		 375 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211166  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4141  FAD dependent oxidoreductase  21.78 
 
 		 375 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659228  normal  0.0539213 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21851  NAD binding site:D-amino acid oxidase  22.96 
 
 		 370 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.594182 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3234  glycine oxidase ThiO  22.22 
 
 		 372 aa  52.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4211  FAD dependent oxidoreductase  24.86 
 
 		 401 aa  51.6  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1312  FAD dependent oxidoreductase  24.47 
 
 		 368 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  22.01 
 
 		 404 aa  51.2  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0041  FAD dependent oxidoreductase  20.89 
 
 		 325 aa  51.6  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.161257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3847  FAD dependent oxidoreductase  20 
 
 		 411 aa  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0914  glycine oxidase ThiO  20.2 
 
 		 325 aa  51.2  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.173839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  22.95 
 
 		 371 aa  51.2  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1989  FAD dependent oxidoreductase  27.88 
 
 		 382 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00570868  normal  0.118525 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>