118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3588 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3588  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 354 aa  730    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.109296 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5749  FAD dependent oxidoreductase  49.14 
 
 		 356 aa  340  2e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0121631 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1765  hypothetical protein  42.45 
 
 		 372 aa  276  3e-73  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3234  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  36.96 
 
 		 357 aa  258  2e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1216  FAD dependent oxidoreductase  34.08 
 
 		 351 aa  232  9e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000550481 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1858  FAD dependent oxidoreductase  30.95 
 
 		 357 aa  204  3e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.20537  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0783  putative FAD dependent oxidoreductase  30.03 
 
 		 355 aa  199  7.999999999999999e-50  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0920  FAD dependent oxidoreductase  30.61 
 
 		 350 aa  187  2e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0105145  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00745  hypothetical protein  27.99 
 
 		 347 aa  187  3e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.13799  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1501  FAD dependent oxidoreductase  32.05 
 
 		 362 aa  177  4e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655883 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1669  FAD dependent oxidoreductase  28.82 
 
 		 352 aa  140  3e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0786  FAD dependent oxidoreductase  27.43 
 
 		 346 aa  127  4.0000000000000003e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.766531  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4213  FAD dependent oxidoreductase  25.88 
 
 		 370 aa  110  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.1387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2454  D-amino acid dehydrogenase small subunit  23.25 
 
 		 371 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295637  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2777  oxidoreductase, DadA family  22.97 
 
 		 371 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.848486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2489  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  23.25 
 
 		 371 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000926626  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2529  DadA family oxidoreductase  22.97 
 
 		 371 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0933493  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2715  DadA family oxidoreductase  22.97 
 
 		 371 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2728  oxidoreductase, DadA family  22.97 
 
 		 371 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000981681 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2742  DadA family oxidoreductase  22.97 
 
 		 371 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00153462  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  24.18 
 
 		 374 aa  68.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2430  FAD dependent oxidoreductase  23.25 
 
 		 371 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0834847  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1848  FAD dependent oxidoreductase  23.48 
 
 		 373 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.344381  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2569  oxidoreductase, DadA family  22.41 
 
 		 371 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0599885 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  24.36 
 
 		 371 aa  65.5  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1201  iminodiacetate oxidase, putative  22.5 
 
 		 367 aa  65.1  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1471  hypothetical protein  25.49 
 
 		 707 aa  64.7  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2732  oxidoreductase, DadA family  22.13 
 
 		 371 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  24.09 
 
 		 368 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  25.21 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  23.51 
 
 		 369 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  27.64 
 
 		 363 aa  59.7  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  23.18 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  23.24 
 
 		 369 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3369  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.51 
 
 		 673 aa  58.5  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00235092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  29.27 
 
 		 361 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  28.91 
 
 		 367 aa  57.8  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1426  FAD dependent oxidoreductase  23.82 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0313349  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2498  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  23.36 
 
 		 355 aa  56.2  0.0000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.373577  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  30.99 
 
 		 365 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0139  FAD dependent oxidoreductase  28.99 
 
 		 348 aa  55.1  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.297271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0704  hypothetical protein  23.71 
 
 		 699 aa  55.1  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  33.57 
 
 		 398 aa  55.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  23.94 
 
 		 382 aa  55.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  22.16 
 
 		 369 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2067  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  24.16 
 
 		 370 aa  53.9  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1996  fused 5-methylaminomethyl-2-thiouridine-forming enzyme methyltransferase and FAD-dependent demodification enzyme  20.4 
 
 		 690 aa  54.3  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.155036  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60270  putative glycine/D-amino acid oxidases  30.56 
 
 		 364 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000302001 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  32.17 
 
 		 365 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4841  FAD dependent oxidoreductase  32.84 
 
 		 366 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.388467  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0721  FAD dependent oxidoreductase  32.87 
 
 		 367 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  30.28 
 
 		 365 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  21.89 
 
 		 369 aa  52.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1489  hypothetical protein  22.98 
 
 		 666 aa  52.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1380  glycine/D-amino acid oxidase family protein  27.85 
 
 		 367 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2540  FAD dependent oxidoreductase  29.1 
 
 		 353 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0170113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  23.53 
 
 		 369 aa  52.8  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  21.89 
 
 		 369 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  21.77 
 
 		 369 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  22.43 
 
 		 369 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1494  hypothetical protein  22.33 
 
 		 666 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  30.58 
 
 		 368 aa  51.6  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0880  oxidoreductase  29.1 
 
 		 353 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  22.43 
 
 		 369 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0136  FAD dependent oxidoreductase  22.1 
 
 		 361 aa  51.2  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0146  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 		 346 aa  52  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00168666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2192  FAD dependent oxidoreductase  23.46 
 
 		 375 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00611  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  27.22 
 
 		 367 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.741936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  32.14 
 
 		 385 aa  51.6  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0141  FAD dependent oxidoreductase  29.5 
 
 		 353 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  22.25 
 
 		 369 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  23.66 
 
 		 375 aa  51.2  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1170  hypothetical protein  24.05 
 
 		 631 aa  50.8  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.285143  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0817  oxidoreductase, FAD-binding protein  32.09 
 
 		 367 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  32.35 
 
 		 376 aa  50.8  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5188  glycine oxidase ThiO  29.17 
 
 		 404 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0153  FAD dependent oxidoreductase  32.06 
 
 		 352 aa  50.1  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4550  glycine oxidase ThiO  30.71 
 
 		 365 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1415  glycine oxidase ThiO  29.75 
 
 		 377 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2517  hypothetical protein  23.67 
 
 		 585 aa  49.3  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 		 378 aa  48.1  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0708  glycine oxidase ThiO  30.52 
 
 		 338 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10140  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  21.94 
 
 		 371 aa  47.8  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.502087 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1977  hypothetical protein  23.06 
 
 		 697 aa  47.4  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  29.2 
 
 		 401 aa  47.4  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0496  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  22.9 
 
 		 621 aa  47.4  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  23.1 
 
 		 386 aa  47.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  32.87 
 
 		 375 aa  47.4  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3358  oxidoreductase  33.33 
 
 		 417 aa  47.4  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2715  oxidoreductase, FAD-binding  29.77 
 
 		 361 aa  47  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725073  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0743  tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC  23.42 
 
 		 668 aa  47  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1225  oxidoreductase, DadA family protein/D-amino acid oxidase  22.28 
 
 		 363 aa  47  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2100  FAD dependent oxidoreductase  21.88 
 
 		 348 aa  47  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.258817  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2850  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  22.05 
 
 		 644 aa  46.6  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413253  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3808  hypothetical protein  21.57 
 
 		 682 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.424966  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1390  hypothetical protein  23.16 
 
 		 622 aa  45.8  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.909333 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2335  FAD dependent oxidoreductase  31.06 
 
 		 338 aa  45.4  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0387808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1927  hypothetical protein  22.66 
 
 		 617 aa  45.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.224364  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002869  5-methylaminomethyl-2-thiouridine-forming enzyme MnmC  24.8 
 
 		 672 aa  45.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00103068  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10420  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  27.5 
 
 		 340 aa  44.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.219353  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>