25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1669 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1669  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 352 aa  695    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1501  FAD dependent oxidoreductase  37.86 
 
 		 362 aa  202  9e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655883 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1216  FAD dependent oxidoreductase  28.78 
 
 		 351 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000550481 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3588  FAD dependent oxidoreductase  28.82 
 
 		 354 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.109296 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1765  hypothetical protein  29.45 
 
 		 372 aa  135  9e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3234  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  26.63 
 
 		 357 aa  125  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00745  hypothetical protein  24.06 
 
 		 347 aa  124  3e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.13799  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1858  FAD dependent oxidoreductase  25.15 
 
 		 357 aa  110  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.20537  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0920  FAD dependent oxidoreductase  27.49 
 
 		 350 aa  109  7.000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0105145  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5749  FAD dependent oxidoreductase  25.75 
 
 		 356 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0121631 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0786  FAD dependent oxidoreductase  27.38 
 
 		 346 aa  96.7  6e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.766531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0783  putative FAD dependent oxidoreductase  21.45 
 
 		 355 aa  90.1  5e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4213  FAD dependent oxidoreductase  26.29 
 
 		 370 aa  67.8  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.1387  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2100  FAD dependent oxidoreductase  28.11 
 
 		 348 aa  56.2  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.258817  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  26.94 
 
 		 379 aa  51.6  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  29.32 
 
 		 361 aa  47  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  25.94 
 
 		 382 aa  46.6  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0743  tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC  25.13 
 
 		 668 aa  45.4  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4841  FAD dependent oxidoreductase  30.23 
 
 		 366 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.388467  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2517  hypothetical protein  38.14 
 
 		 585 aa  43.5  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2715  oxidoreductase, FAD-binding  29.32 
 
 		 361 aa  43.1  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725073  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  32.69 
 
 		 363 aa  43.1  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1956  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  26.67 
 
 		 644 aa  43.5  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243551  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23290  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  24.94 
 
 		 420 aa  43.5  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  28.26 
 
 		 652 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>