89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1858 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1858  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
357 aa  729    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.20537  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0920  FAD dependent oxidoreductase  44.09 
 
 
350 aa  324  2e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0105145  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00745  hypothetical protein  43.15 
 
 
347 aa  303  2.0000000000000002e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.13799  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1765  hypothetical protein  34.87 
 
 
372 aa  213  3.9999999999999995e-54  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3588  FAD dependent oxidoreductase  30.95 
 
 
354 aa  204  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.109296 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5749  FAD dependent oxidoreductase  33.24 
 
 
356 aa  201  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0121631 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1216  FAD dependent oxidoreductase  32.76 
 
 
351 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000550481 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3234  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  32.87 
 
 
357 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0783  putative FAD dependent oxidoreductase  27.38 
 
 
355 aa  161  2e-38  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1501  FAD dependent oxidoreductase  26.61 
 
 
362 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.655883 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4213  FAD dependent oxidoreductase  25.54 
 
 
370 aa  112  8.000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.1387  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1669  FAD dependent oxidoreductase  25.15 
 
 
352 aa  100  5e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0786  FAD dependent oxidoreductase  23.62 
 
 
346 aa  91.7  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.766531  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2100  FAD dependent oxidoreductase  23.12 
 
 
348 aa  72.4  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.258817  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1170  hypothetical protein  26.42 
 
 
631 aa  62.8  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.285143  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  21.94 
 
 
376 aa  60.8  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2715  oxidoreductase, FAD-binding  20.67 
 
 
361 aa  59.3  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725073  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5037  FAD dependent oxidoreductase  24.53 
 
 
360 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.484973 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2192  FAD dependent oxidoreductase  22.32 
 
 
375 aa  54.3  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  24.23 
 
 
372 aa  54.3  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  23.36 
 
 
379 aa  52.8  0.000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  27.94 
 
 
375 aa  52.4  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  20.33 
 
 
385 aa  51.6  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4841  FAD dependent oxidoreductase  21.79 
 
 
366 aa  52  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.388467  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  21.94 
 
 
361 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  27.5 
 
 
367 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  21.33 
 
 
368 aa  51.6  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00501  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  25.54 
 
 
369 aa  50.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2315  FAD dependent oxidoreductase  22.89 
 
 
390 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  24.71 
 
 
367 aa  49.7  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60270  putative glycine/D-amino acid oxidases  21.61 
 
 
364 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000302001 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2335  FAD dependent oxidoreductase  27.61 
 
 
338 aa  49.7  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0387808  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2431  FAD dependent oxidoreductase  29.03 
 
 
367 aa  48.9  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.779457 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0708  glycine oxidase ThiO  21.16 
 
 
338 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1460  hypothetical protein  23.43 
 
 
356 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0855  FAD dependent oxidoreductase  24.59 
 
 
385 aa  49.3  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.817782  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5036  glycine oxidase ThiO  28.24 
 
 
360 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0048  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  24.46 
 
 
369 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0251  oxidoreductase, FAD-dependent  29.01 
 
 
393 aa  48.1  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1489  hypothetical protein  27.91 
 
 
666 aa  47.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1225  oxidoreductase, DadA family protein/D-amino acid oxidase  22.41 
 
 
363 aa  47.8  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  21.93 
 
 
382 aa  47.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0445  thiamine biosynthesis oxidoreductase  21.51 
 
 
316 aa  47.8  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  26.77 
 
 
369 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6396  glycine oxidase ThiO  20.58 
 
 
316 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  26.77 
 
 
369 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  26.77 
 
 
369 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00481  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  23.11 
 
 
369 aa  47.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.254103  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3358  oxidoreductase  27.07 
 
 
417 aa  47  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3650  glycine oxidase ThiO  22.51 
 
 
324 aa  47  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1494  hypothetical protein  22.64 
 
 
666 aa  47  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1415  glycine oxidase ThiO  24.41 
 
 
377 aa  47  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  26.77 
 
 
369 aa  47  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  21.25 
 
 
369 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  26.71 
 
 
398 aa  46.6  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  23.04 
 
 
369 aa  47  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  26.77 
 
 
369 aa  46.6  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3847  FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 
411 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  27.56 
 
 
369 aa  46.2  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  26.19 
 
 
369 aa  46.2  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0147  FAD dependent oxidoreductase  23.8 
 
 
350 aa  46.2  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0139  FAD dependent oxidoreductase  24.37 
 
 
348 aa  45.8  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.297271  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1414  glycine oxidase ThiO  30.5 
 
 
339 aa  45.8  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1927  hypothetical protein  25.43 
 
 
617 aa  45.8  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.224364  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1021  FAD dependent oxidoreductase  24.18 
 
 
500 aa  44.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1523  hypothetical protein  27.07 
 
 
356 aa  45.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  21.31 
 
 
363 aa  44.7  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  22.16 
 
 
369 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  21.1 
 
 
374 aa  44.3  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5188  glycine oxidase ThiO  21.88 
 
 
404 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4550  glycine oxidase ThiO  26.81 
 
 
365 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1793  FAD dependent oxidoreductase  31.19 
 
 
389 aa  44.3  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.075637  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  26.56 
 
 
369 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  26.62 
 
 
365 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  20.39 
 
 
368 aa  44.3  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2316  D-amino acid dehydrogenase  25.17 
 
 
413 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.944178  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0990  D-amino-acid dehydrogenase  25.17 
 
 
413 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3234  glycine oxidase ThiO  19.83 
 
 
372 aa  43.5  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3433  FAD dependent oxidoreductase  23.91 
 
 
414 aa  43.9  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3384  hypothetical protein  22.55 
 
 
705 aa  43.5  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1613  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
414 aa  43.9  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4314  FAD dependent oxidoreductase  27.21 
 
 
378 aa  43.9  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.274376  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3219  thiazole synthase  25.57 
 
 
652 aa  43.9  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  21.43 
 
 
385 aa  43.5  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0284  glycine oxidase ThiO  22.65 
 
 
334 aa  43.5  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  26.12 
 
 
378 aa  43.1  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2166  glycine oxidase ThiO  27.27 
 
 
346 aa  43.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.402403 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2082  FAD dependent oxidoreductase  20.05 
 
 
411 aa  43.1  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.574106  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1655  D-amino-acid dehydrogenase  27.93 
 
 
414 aa  42.7  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0719166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>