More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2315 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2315  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 390 aa  793    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2008  FAD dependent oxidoreductase  45.58 
 
 		 373 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1558  FAD dependent oxidoreductase  43.85 
 
 		 386 aa  303  4.0000000000000003e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120445  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5086  FAD dependent oxidoreductase  44.83 
 
 		 385 aa  301  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00135818  normal  0.404785 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2431  FAD dependent oxidoreductase  44.85 
 
 		 379 aa  298  9e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3492  FAD dependent oxidoreductase  42.51 
 
 		 378 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2246  FAD dependent oxidoreductase  42.78 
 
 		 378 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.721245 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1877  FAD dependent oxidoreductase  43.58 
 
 		 378 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1468  FAD dependent oxidoreductase  43.01 
 
 		 375 aa  278  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.998705 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3567  FAD dependent oxidoreductase  41.73 
 
 		 381 aa  277  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.397516 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1242  hypothetical protein  42.05 
 
 		 375 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4053  FAD dependent oxidoreductase  42.42 
 
 		 389 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1837  FAD dependent oxidoreductase  43.28 
 
 		 381 aa  271  2e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1627  FAD dependent oxidoreductase  43.28 
 
 		 375 aa  266  4e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.810827  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2247  FAD dependent oxidoreductase  43.28 
 
 		 375 aa  266  4e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0969  FAD dependent oxidoreductase  41.08 
 
 		 375 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14010  putative amino acid oxidase  40.38 
 
 		 375 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0341908 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0820  FAD dependent oxidoreductase  43.09 
 
 		 384 aa  260  3e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1429  FAD dependent oxidoreductase  41.27 
 
 		 383 aa  256  4e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860523 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0166  FAD dependent oxidoreductase  41.6 
 
 		 385 aa  241  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4871  FAD dependent oxidoreductase  41.64 
 
 		 367 aa  231  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4669  FAD dependent oxidoreductase  37.9 
 
 		 374 aa  228  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020335 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1083  FAD dependent oxidoreductase  40.27 
 
 		 369 aa  218  1e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3007  FAD dependent oxidoreductase  39.54 
 
 		 400 aa  212  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.469036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0490  FAD dependent oxidoreductase  38.6 
 
 		 361 aa  191  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0127123  normal  0.162763 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3225  hypothetical protein  37.94 
 
 		 368 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0926  FAD dependent oxidoreductase  34.5 
 
 		 357 aa  182  7e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1312  FAD dependent oxidoreductase  35.73 
 
 		 375 aa  180  4.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.544438  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1132  FAD dependent oxidoreductase  36.77 
 
 		 376 aa  176  5e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.710335  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3246  FAD dependent oxidoreductase  36.44 
 
 		 368 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.548374  normal  0.597493 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3563  putative FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase protein  36.15 
 
 		 368 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1355  FAD dependent oxidoreductase  33.98 
 
 		 369 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000118707 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0434  FAD dependent oxidoreductase  31.34 
 
 		 382 aa  147  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0852004 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  28.27 
 
 		 378 aa  98.2  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  28.27 
 
 		 378 aa  95.9  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  25.99 
 
 		 385 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  26.27 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0683  FAD dependent oxidoreductase  26.47 
 
 		 496 aa  80.5  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.302039  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  25.56 
 
 		 388 aa  80.1  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  25.33 
 
 		 382 aa  80.1  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  27.65 
 
 		 392 aa  78.2  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  22.25 
 
 		 376 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  23.36 
 
 		 390 aa  77  0.0000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  27.45 
 
 		 393 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  23.91 
 
 		 385 aa  74.3  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  25.34 
 
 		 385 aa  73.6  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0930  FAD dependent oxidoreductase  23.25 
 
 		 479 aa  73.2  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0776869  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0620  FAD dependent oxidoreductase  23.99 
 
 		 478 aa  71.6  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  25.65 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  24.69 
 
 		 402 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2112  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 		 392 aa  70.5  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0850914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  24.69 
 
 		 402 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3229  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267382  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  24.93 
 
 		 394 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1431  FAD dependent oxidoreductase  24.28 
 
 		 394 aa  70.1  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0107924 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2862  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  24.28 
 
 		 394 aa  70.1  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  24.51 
 
 		 386 aa  70.1  0.00000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  27.15 
 
 		 394 aa  69.7  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  27.31 
 
 		 409 aa  68.9  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2875  FAD-dependent oxidoreductase  23.64 
 
 		 476 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08100  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  24.27 
 
 		 503 aa  68.2  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242125  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  23.03 
 
 		 399 aa  68.2  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4896  FAD dependent oxidoreductase  25.9 
 
 		 398 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4985  FAD dependent oxidoreductase  25.9 
 
 		 398 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1490  FAD dependent oxidoreductase  23.22 
 
 		 473 aa  67.4  0.0000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  23.85 
 
 		 823 aa  66.6  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  22.28 
 
 		 374 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2577  putative FAD dependent oxidoreductase  28.71 
 
 		 390 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.119285 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1244  FAD dependent oxidoreductase  22.13 
 
 		 479 aa  65.9  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2197  FAD dependent oxidoreductase  24.71 
 
 		 815 aa  66.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.031847 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5264  FAD dependent oxidoreductase  25.9 
 
 		 398 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  23.02 
 
 		 382 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2558  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  23.37 
 
 		 476 aa  64.3  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  26.18 
 
 		 492 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3311  FAD dependent oxidoreductase  23.99 
 
 		 817 aa  63.5  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  24.32 
 
 		 394 aa  63.2  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1362  FAD dependent oxidoreductase  24.63 
 
 		 479 aa  62.8  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  24.66 
 
 		 395 aa  62.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  24.67 
 
 		 390 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  25.5 
 
 		 395 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1237  FAD dependent oxidoreductase  25.43 
 
 		 965 aa  62  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.18893  normal  0.393596 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  24.11 
 
 		 384 aa  62  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0642  FAD dependent oxidoreductase  25.81 
 
 		 815 aa  61.6  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  25.49 
 
 		 500 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  28.27 
 
 		 400 aa  61.6  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  25.4 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  25.87 
 
 		 389 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0069  aminobutyraldehyde dehydrogenase  25 
 
 		 409 aa  62  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1090  FAD dependent oxidoreductase  28.64 
 
 		 378 aa  62  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.151516  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2040  FAD-dependent oxidoreductase  25 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.985814  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2748  oxidoreductase, FAD-binding family protein  27.85 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.252588  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6595  FAD dependent oxidoreductase  27.6 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.0778916 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  23.7 
 
 		 394 aa  61.2  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  20.4 
 
 		 373 aa  60.5  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4871  FAD dependent oxidoreductase  23.81 
 
 		 825 aa  60.8  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862382  normal  0.731807 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  25.21 
 
 		 500 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  19.89 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  25.89 
 
 		 389 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3133  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 407 aa  60.5  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2454  D-amino acid dehydrogenase small subunit  22.83 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>