235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1242 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1242  hypothetical protein  100 
 
 		 375 aa  765    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14010  putative amino acid oxidase  93.83 
 
 		 375 aa  718    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0341908 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3567  FAD dependent oxidoreductase  70.4 
 
 		 381 aa  526  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.397516 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0969  FAD dependent oxidoreductase  68.72 
 
 		 375 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5086  FAD dependent oxidoreductase  60.59 
 
 		 385 aa  448  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00135818  normal  0.404785 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1558  FAD dependent oxidoreductase  58.6 
 
 		 386 aa  436  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120445  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4053  FAD dependent oxidoreductase  57.41 
 
 		 389 aa  424  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2246  FAD dependent oxidoreductase  53.49 
 
 		 378 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.721245 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1877  FAD dependent oxidoreductase  54.72 
 
 		 378 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3492  FAD dependent oxidoreductase  53.49 
 
 		 378 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2008  FAD dependent oxidoreductase  52.83 
 
 		 373 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2431  FAD dependent oxidoreductase  52.27 
 
 		 379 aa  371  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1468  FAD dependent oxidoreductase  50.93 
 
 		 375 aa  360  2e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.998705 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2247  FAD dependent oxidoreductase  50.67 
 
 		 375 aa  339  4e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1627  FAD dependent oxidoreductase  50.4 
 
 		 375 aa  337  9.999999999999999e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.810827  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0166  FAD dependent oxidoreductase  51.6 
 
 		 385 aa  329  5.0000000000000004e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0820  FAD dependent oxidoreductase  49.74 
 
 		 384 aa  329  5.0000000000000004e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4669  FAD dependent oxidoreductase  41.9 
 
 		 374 aa  277  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020335 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2315  FAD dependent oxidoreductase  42.05 
 
 		 390 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1429  FAD dependent oxidoreductase  43.01 
 
 		 383 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860523 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1837  FAD dependent oxidoreductase  40.48 
 
 		 381 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0490  FAD dependent oxidoreductase  40.54 
 
 		 361 aa  231  1e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0127123  normal  0.162763 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3563  putative FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase protein  42.34 
 
 		 368 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3246  FAD dependent oxidoreductase  42.34 
 
 		 368 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.548374  normal  0.597493 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3225  hypothetical protein  41.85 
 
 		 368 aa  219  5e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3007  FAD dependent oxidoreductase  41.31 
 
 		 400 aa  218  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.469036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4871  FAD dependent oxidoreductase  38.17 
 
 		 367 aa  209  5e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0926  FAD dependent oxidoreductase  36.83 
 
 		 357 aa  199  9e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1083  FAD dependent oxidoreductase  37.67 
 
 		 369 aa  174  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1132  FAD dependent oxidoreductase  35.03 
 
 		 376 aa  169  7e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.710335  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1312  FAD dependent oxidoreductase  33.42 
 
 		 375 aa  162  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.544438  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1355  FAD dependent oxidoreductase  31.48 
 
 		 369 aa  158  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000118707 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0434  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 382 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0852004 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  27.01 
 
 		 385 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  28.29 
 
 		 378 aa  96.7  6e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  28.69 
 
 		 378 aa  95.1  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  27.42 
 
 		 385 aa  94.7  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  28.24 
 
 		 385 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  29.27 
 
 		 388 aa  86.7  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  25.63 
 
 		 386 aa  85.9  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  26.21 
 
 		 385 aa  83.2  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1244  FAD dependent oxidoreductase  23.84 
 
 		 479 aa  82.4  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  26.03 
 
 		 394 aa  78.6  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2063  FAD dependent oxidoreductase  25.58 
 
 		 806 aa  74.3  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  24.68 
 
 		 382 aa  73.9  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  26.12 
 
 		 392 aa  72.4  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2488  FAD dependent oxidoreductase  25.39 
 
 		 806 aa  72.4  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.255163  normal  0.0203493 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  25.32 
 
 		 823 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  24.14 
 
 		 382 aa  70.9  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  24.57 
 
 		 378 aa  69.7  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  25 
 
 		 402 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  26.81 
 
 		 389 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0320  FAD dependent oxidoreductase  23.53 
 
 		 485 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  25 
 
 		 402 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2558  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  22.48 
 
 		 476 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  22.58 
 
 		 390 aa  68.2  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3293  FAD dependent oxidoreductase  26.5 
 
 		 385 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2112  FAD dependent oxidoreductase  26.26 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0850914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3229  FAD dependent oxidoreductase  24.54 
 
 		 391 aa  66.6  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267382  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2875  FAD-dependent oxidoreductase  22.48 
 
 		 476 aa  66.2  0.0000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3884  FAD dependent oxidoreductase  27.72 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  23.38 
 
 		 381 aa  65.9  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2070  FAD dependent oxidoreductase  26.1 
 
 		 392 aa  65.9  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5112  FAD dependent oxidoreductase  25.28 
 
 		 806 aa  65.1  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0323529 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  24.4 
 
 		 816 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  26.06 
 
 		 389 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  23.83 
 
 		 395 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  24.31 
 
 		 394 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2643  oxidoreductase, FAD-dependent  21.72 
 
 		 489 aa  62.8  0.000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.292986  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6585  FAD dependent oxidoreductase  24.73 
 
 		 389 aa  62  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3866  FAD dependent oxidoreductase  26.33 
 
 		 843 aa  62  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2577  putative FAD dependent oxidoreductase  26.24 
 
 		 390 aa  62  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.119285 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6595  FAD dependent oxidoreductase  24.72 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.0778916 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  24.31 
 
 		 385 aa  60.5  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2849  FAD dependent oxidoreductase  26.33 
 
 		 812 aa  59.7  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  26.85 
 
 		 409 aa  59.3  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3496  FAD dependent oxidoreductase  23.1 
 
 		 405 aa  58.9  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177627 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5151  FAD dependent oxidoreductase  24.53 
 
 		 390 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.836539  normal  0.719535 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4046  FAD dependent oxidoreductase  23.4 
 
 		 390 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1426  FAD dependent oxidoreductase  24.76 
 
 		 805 aa  58.9  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0785769 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  24.66 
 
 		 376 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3310  FAD dependent oxidoreductase  25.09 
 
 		 816 aa  58.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5914  FAD dependent oxidoreductase  24.23 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3311  FAD dependent oxidoreductase  25.19 
 
 		 817 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08100  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  23.25 
 
 		 503 aa  57.8  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242125  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1628  FAD dependent oxidoreductase  20.72 
 
 		 478 aa  57.8  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.855011  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  23.95 
 
 		 394 aa  57.8  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2677  FAD dependent oxidoreductase  22.64 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3475  FAD dependent oxidoreductase  23.4 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0683  FAD dependent oxidoreductase  24.62 
 
 		 496 aa  57.4  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.302039  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2198  FAD dependent oxidoreductase  24.63 
 
 		 815 aa  57  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138151  normal  0.0335767 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0620  FAD dependent oxidoreductase  21.73 
 
 		 478 aa  57  0.0000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  24.23 
 
 		 492 aa  56.2  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2862  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  24.6 
 
 		 394 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4833  FAD dependent oxidoreductase  22.58 
 
 		 385 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.866256 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0939  FAD dependent oxidoreductase  27.24 
 
 		 797 aa  55.8  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6842  FAD dependent oxidoreductase  26.89 
 
 		 465 aa  55.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.133179 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1490  FAD dependent oxidoreductase  21.31 
 
 		 473 aa  55.1  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2805  FAD dependent oxidoreductase  26.19 
 
 		 802 aa  54.7  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.898682  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>