282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1132 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1132  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 376 aa  734    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.710335  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4871  FAD dependent oxidoreductase  54.11 
 
 		 367 aa  343  4e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1083  FAD dependent oxidoreductase  54.08 
 
 		 369 aa  315  7e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1429  FAD dependent oxidoreductase  45.05 
 
 		 383 aa  253  5.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860523 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1558  FAD dependent oxidoreductase  40.05 
 
 		 386 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120445  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3492  FAD dependent oxidoreductase  42.42 
 
 		 378 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2246  FAD dependent oxidoreductase  42.13 
 
 		 378 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.721245 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2008  FAD dependent oxidoreductase  42.98 
 
 		 373 aa  226  7e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5086  FAD dependent oxidoreductase  40.57 
 
 		 385 aa  226  7e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00135818  normal  0.404785 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1877  FAD dependent oxidoreductase  41.57 
 
 		 378 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2431  FAD dependent oxidoreductase  41.76 
 
 		 379 aa  223  4e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2247  FAD dependent oxidoreductase  42.98 
 
 		 375 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1468  FAD dependent oxidoreductase  41.49 
 
 		 375 aa  222  8e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.998705 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1627  FAD dependent oxidoreductase  42.69 
 
 		 375 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.810827  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3225  hypothetical protein  37.8 
 
 		 368 aa  209  9e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2315  FAD dependent oxidoreductase  39.61 
 
 		 390 aa  208  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3567  FAD dependent oxidoreductase  38.34 
 
 		 381 aa  204  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.397516 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3563  putative FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase protein  40.7 
 
 		 368 aa  203  5e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3246  FAD dependent oxidoreductase  40.96 
 
 		 368 aa  203  5e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.548374  normal  0.597493 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0490  FAD dependent oxidoreductase  37.19 
 
 		 361 aa  203  5e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0127123  normal  0.162763 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0166  FAD dependent oxidoreductase  41.38 
 
 		 385 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0969  FAD dependent oxidoreductase  36.31 
 
 		 375 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3007  FAD dependent oxidoreductase  42.69 
 
 		 400 aa  197  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.469036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0926  FAD dependent oxidoreductase  39.57 
 
 		 357 aa  197  3e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4669  FAD dependent oxidoreductase  38.27 
 
 		 374 aa  197  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020335 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4053  FAD dependent oxidoreductase  39.66 
 
 		 389 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14010  putative amino acid oxidase  36.02 
 
 		 375 aa  193  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0341908 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1242  hypothetical protein  37.97 
 
 		 375 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1355  FAD dependent oxidoreductase  37.18 
 
 		 369 aa  189  9e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000118707 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1837  FAD dependent oxidoreductase  35.88 
 
 		 381 aa  187  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0820  FAD dependent oxidoreductase  38.95 
 
 		 384 aa  186  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1312  FAD dependent oxidoreductase  37.13 
 
 		 375 aa  179  5.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.544438  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0434  FAD dependent oxidoreductase  32.61 
 
 		 382 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0852004 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  30.56 
 
 		 392 aa  99  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  28.23 
 
 		 385 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  27.97 
 
 		 385 aa  93.6  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  27.97 
 
 		 385 aa  87.8  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  26.4 
 
 		 385 aa  88.6  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  28.46 
 
 		 388 aa  85.5  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 378 aa  82.4  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4434  FAD dependent oxidoreductase  30.29 
 
 		 378 aa  81.3  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862237  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  29.14 
 
 		 378 aa  79.3  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  28.13 
 
 		 378 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  26.82 
 
 		 377 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  29.23 
 
 		 383 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  29.23 
 
 		 383 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 		 383 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1830  SoxB protein  30.33 
 
 		 377 aa  71.2  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.260331 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  29.25 
 
 		 492 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  27.5 
 
 		 385 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2198  FAD dependent oxidoreductase  25.86 
 
 		 815 aa  67.4  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138151  normal  0.0335767 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  28.31 
 
 		 382 aa  66.6  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  25.59 
 
 		 394 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  31.17 
 
 		 388 aa  66.2  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  32.18 
 
 		 380 aa  66.2  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0822  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 414 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193909  normal  0.0469773 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  27.84 
 
 		 500 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3310  FAD dependent oxidoreductase  25.99 
 
 		 816 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  27.57 
 
 		 500 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  25.48 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2063  FAD dependent oxidoreductase  24.87 
 
 		 806 aa  64.7  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  28.96 
 
 		 394 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3340  FAD dependent oxidoreductase  28.04 
 
 		 387 aa  62.4  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0285888  normal  0.210627 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  26.43 
 
 		 376 aa  62.4  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  27.94 
 
 		 388 aa  62  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  28.34 
 
 		 496 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0725  D-amino-acid dehydrogenase  28.2 
 
 		 414 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0605876  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0367  D-amino-acid dehydrogenase  28.2 
 
 		 414 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0850  D-amino-acid dehydrogenase  28.2 
 
 		 414 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2862  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  25.82 
 
 		 394 aa  60.8  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  25.13 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  25.62 
 
 		 395 aa  60.5  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  24.17 
 
 		 382 aa  60.5  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  22.4 
 
 		 390 aa  60.5  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  22.84 
 
 		 394 aa  60.5  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  27.04 
 
 		 386 aa  60.5  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3929  FAD dependent oxidoreductase  26.29 
 
 		 386 aa  60.1  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.371488  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6008  SoxB2  33.17 
 
 		 379 aa  59.7  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00127478  normal  0.130354 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1431  FAD dependent oxidoreductase  24.53 
 
 		 394 aa  59.7  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0107924 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4426  FAD dependent oxidoreductase  28.09 
 
 		 375 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.767277 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  26.57 
 
 		 349 aa  59.7  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0742  FAD dependent oxidoreductase  27.82 
 
 		 414 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0018802 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3293  FAD dependent oxidoreductase  29.81 
 
 		 385 aa  59.7  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08100  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  23.73 
 
 		 503 aa  59.7  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242125  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0069  aminobutyraldehyde dehydrogenase  27.91 
 
 		 409 aa  58.9  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2537  FAD dependent oxidoreductase  27.11 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.654937  normal  0.300039 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2040  FAD-dependent oxidoreductase  27.91 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.985814  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  26.29 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  25.14 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1244  FAD dependent oxidoreductase  21.76 
 
 		 479 aa  58.2  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  27.39 
 
 		 368 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5371  FAD dependent oxidoreductase  29.21 
 
 		 382 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  25.81 
 
 		 393 aa  57  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2112  FAD dependent oxidoreductase  28.24 
 
 		 392 aa  57  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0850914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0753  FAD dependent oxidoreductase  29.28 
 
 		 384 aa  56.6  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1426  FAD dependent oxidoreductase  23.99 
 
 		 805 aa  56.6  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0785769 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  26.59 
 
 		 376 aa  56.2  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  25.14 
 
 		 384 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4757  FAD dependent oxidoreductase  25.85 
 
 		 390 aa  55.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.293951 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>