288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3567 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3567  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 381 aa  766    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.397516 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14010  putative amino acid oxidase  72.65 
 
 		 375 aa  541  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0341908 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1242  hypothetical protein  70.4 
 
 		 375 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0969  FAD dependent oxidoreductase  67.91 
 
 		 375 aa  514  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5086  FAD dependent oxidoreductase  64.32 
 
 		 385 aa  465  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00135818  normal  0.404785 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1558  FAD dependent oxidoreductase  60.11 
 
 		 386 aa  438  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120445  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4053  FAD dependent oxidoreductase  58.82 
 
 		 389 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1468  FAD dependent oxidoreductase  57.22 
 
 		 375 aa  409  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.998705 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2246  FAD dependent oxidoreductase  56.84 
 
 		 378 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.721245 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1877  FAD dependent oxidoreductase  57.37 
 
 		 378 aa  401  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3492  FAD dependent oxidoreductase  55.76 
 
 		 378 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2008  FAD dependent oxidoreductase  55.61 
 
 		 373 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2431  FAD dependent oxidoreductase  55.05 
 
 		 379 aa  392  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2247  FAD dependent oxidoreductase  54.81 
 
 		 375 aa  369  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1627  FAD dependent oxidoreductase  54.81 
 
 		 375 aa  367  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.810827  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0820  FAD dependent oxidoreductase  55.61 
 
 		 384 aa  365  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0166  FAD dependent oxidoreductase  54.33 
 
 		 385 aa  357  1.9999999999999998e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2315  FAD dependent oxidoreductase  41.73 
 
 		 390 aa  277  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1429  FAD dependent oxidoreductase  44.32 
 
 		 383 aa  273  3e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860523 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4669  FAD dependent oxidoreductase  42.36 
 
 		 374 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020335 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1837  FAD dependent oxidoreductase  41.07 
 
 		 381 aa  268  1e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0490  FAD dependent oxidoreductase  42.21 
 
 		 361 aa  241  1e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0127123  normal  0.162763 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3225  hypothetical protein  42.32 
 
 		 368 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3246  FAD dependent oxidoreductase  43.28 
 
 		 368 aa  235  9e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.548374  normal  0.597493 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3563  putative FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase protein  43.01 
 
 		 368 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0926  FAD dependent oxidoreductase  39.54 
 
 		 357 aa  228  2e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4871  FAD dependent oxidoreductase  40.43 
 
 		 367 aa  220  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3007  FAD dependent oxidoreductase  38.35 
 
 		 400 aa  209  7e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.469036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1132  FAD dependent oxidoreductase  37.38 
 
 		 376 aa  179  4.999999999999999e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.710335  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1355  FAD dependent oxidoreductase  34.85 
 
 		 369 aa  174  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000118707 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1083  FAD dependent oxidoreductase  37.82 
 
 		 369 aa  172  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1312  FAD dependent oxidoreductase  33.79 
 
 		 375 aa  170  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.544438  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0434  FAD dependent oxidoreductase  34.97 
 
 		 382 aa  149  7e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0852004 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  30.9 
 
 		 378 aa  106  6e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  30.36 
 
 		 378 aa  105  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  25.14 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  28.49 
 
 		 385 aa  83.2  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  28.21 
 
 		 385 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2112  FAD dependent oxidoreductase  28.07 
 
 		 392 aa  82  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0850914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 388 aa  80.5  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  28.39 
 
 		 394 aa  78.6  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  27.05 
 
 		 823 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2558  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  22.34 
 
 		 476 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  22.51 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  23.53 
 
 		 376 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  26.29 
 
 		 392 aa  69.7  0.00000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  25.07 
 
 		 385 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2875  FAD-dependent oxidoreductase  22.34 
 
 		 476 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  24.93 
 
 		 394 aa  68.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  22.92 
 
 		 389 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0930  FAD dependent oxidoreductase  23.26 
 
 		 479 aa  67.8  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0776869  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  24.88 
 
 		 388 aa  67.8  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3311  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 		 817 aa  67.4  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  26.13 
 
 		 384 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  26.39 
 
 		 394 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  26.05 
 
 		 389 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1596  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 821 aa  66.2  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.26338 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2198  FAD dependent oxidoreductase  24.41 
 
 		 815 aa  65.1  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138151  normal  0.0335767 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  23.85 
 
 		 382 aa  63.9  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3229  FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267382  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  23.02 
 
 		 382 aa  64.3  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2197  FAD dependent oxidoreductase  25.47 
 
 		 815 aa  63.9  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.031847 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5112  FAD dependent oxidoreductase  24.38 
 
 		 806 aa  63.5  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0323529 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2063  FAD dependent oxidoreductase  24.76 
 
 		 806 aa  63.5  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  24.55 
 
 		 816 aa  63.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  25.92 
 
 		 376 aa  63.2  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  26.84 
 
 		 378 aa  63.2  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0620  FAD dependent oxidoreductase  23.39 
 
 		 478 aa  62.8  0.000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04101  putative sarcosine oxidase  25.11 
 
 		 394 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0903484  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  24.23 
 
 		 816 aa  62.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  24.27 
 
 		 386 aa  62  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  25.37 
 
 		 417 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  25.9 
 
 		 394 aa  60.8  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2070  FAD dependent oxidoreductase  26.61 
 
 		 392 aa  60.5  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  23.18 
 
 		 389 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2643  oxidoreductase, FAD-dependent  21.08 
 
 		 489 aa  59.7  0.00000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.292986  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  22.36 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3423  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 400 aa  58.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  22.98 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  24.63 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2488  FAD dependent oxidoreductase  25.82 
 
 		 806 aa  57.8  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.255163  normal  0.0203493 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  24.89 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3340  FAD dependent oxidoreductase  25.98 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0285888  normal  0.210627 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  25.51 
 
 		 388 aa  57.8  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1148  FAD dependent oxidoreductase  23.77 
 
 		 433 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0510844 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  26.43 
 
 		 402 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0762  FAD dependent oxidoreductase  26.82 
 
 		 812 aa  57  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3310  FAD dependent oxidoreductase  23.05 
 
 		 816 aa  57  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4331  putative FAD dependent oxidoreductase  24.43 
 
 		 436 aa  57  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.588243 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2390  hydroxyglutarate oxidase  29.76 
 
 		 396 aa  57  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0316475  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3475  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 		 390 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5151  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 		 390 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.836539  normal  0.719535 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3866  FAD dependent oxidoreductase  27.74 
 
 		 843 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1037  FAD dependent oxidoreductase  24.44 
 
 		 433 aa  56.6  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3667  FAD dependent oxidoreductase  29.86 
 
 		 405 aa  56.6  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3133  FAD dependent oxidoreductase  25.97 
 
 		 407 aa  56.6  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4590  FAD dependent oxidoreductase  27.75 
 
 		 394 aa  56.6  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1595  hydroxyglutarate oxidase  30.32 
 
 		 397 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325765 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3293  FAD dependent oxidoreductase  23.91 
 
 		 385 aa  55.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4046  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 		 390 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>