225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0166 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0166  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 385 aa  760    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2246  FAD dependent oxidoreductase  59.47 
 
 		 378 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.721245 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1877  FAD dependent oxidoreductase  60.53 
 
 		 378 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3492  FAD dependent oxidoreductase  59.21 
 
 		 378 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0820  FAD dependent oxidoreductase  61.3 
 
 		 384 aa  420  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2431  FAD dependent oxidoreductase  58.12 
 
 		 379 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1468  FAD dependent oxidoreductase  60.9 
 
 		 375 aa  408  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.998705 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2008  FAD dependent oxidoreductase  57.55 
 
 		 373 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3567  FAD dependent oxidoreductase  54.33 
 
 		 381 aa  382  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.397516 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5086  FAD dependent oxidoreductase  54.38 
 
 		 385 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00135818  normal  0.404785 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14010  putative amino acid oxidase  51.99 
 
 		 375 aa  364  1e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0341908 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2247  FAD dependent oxidoreductase  53.83 
 
 		 375 aa  360  3e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1627  FAD dependent oxidoreductase  53.83 
 
 		 375 aa  359  5e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.810827  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1558  FAD dependent oxidoreductase  52.12 
 
 		 386 aa  358  9e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120445  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1242  hypothetical protein  51.6 
 
 		 375 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0969  FAD dependent oxidoreductase  50.93 
 
 		 375 aa  353  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4053  FAD dependent oxidoreductase  53.4 
 
 		 389 aa  349  4e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1429  FAD dependent oxidoreductase  46.48 
 
 		 383 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860523 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2315  FAD dependent oxidoreductase  41.6 
 
 		 390 aa  263  4e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1837  FAD dependent oxidoreductase  41.6 
 
 		 381 aa  253  3e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4669  FAD dependent oxidoreductase  42.78 
 
 		 374 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020335 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0490  FAD dependent oxidoreductase  42.98 
 
 		 361 aa  240  4e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0127123  normal  0.162763 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3563  putative FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase protein  44.06 
 
 		 368 aa  234  3e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3246  FAD dependent oxidoreductase  43.8 
 
 		 368 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.548374  normal  0.597493 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3225  hypothetical protein  42.29 
 
 		 368 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4871  FAD dependent oxidoreductase  40.43 
 
 		 367 aa  219  6e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3007  FAD dependent oxidoreductase  40.28 
 
 		 400 aa  213  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.469036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0926  FAD dependent oxidoreductase  39.68 
 
 		 357 aa  211  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1132  FAD dependent oxidoreductase  41.69 
 
 		 376 aa  204  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.710335  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1083  FAD dependent oxidoreductase  41.84 
 
 		 369 aa  193  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1312  FAD dependent oxidoreductase  35.56 
 
 		 375 aa  168  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.544438  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1355  FAD dependent oxidoreductase  33.43 
 
 		 369 aa  144  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000118707 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0434  FAD dependent oxidoreductase  35.44 
 
 		 382 aa  144  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0852004 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  27.18 
 
 		 385 aa  91.3  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 		 378 aa  89.7  9e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  28.02 
 
 		 378 aa  87.4  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  27.18 
 
 		 385 aa  87  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  26.92 
 
 		 385 aa  84  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  27.53 
 
 		 385 aa  80.1  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2875  FAD-dependent oxidoreductase  23.18 
 
 		 476 aa  76.3  0.0000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2558  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  22.7 
 
 		 476 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  23.2 
 
 		 382 aa  72.8  0.000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  25.99 
 
 		 376 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  27.14 
 
 		 392 aa  72.4  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3293  FAD dependent oxidoreductase  29.32 
 
 		 385 aa  72  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2197  FAD dependent oxidoreductase  25.7 
 
 		 815 aa  72  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.031847 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  26.93 
 
 		 388 aa  71.2  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1666  dehydrogenase  25.07 
 
 		 831 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0839495 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1431  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 		 394 aa  69.3  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0107924 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0683  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 		 496 aa  69.3  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.302039  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3311  FAD dependent oxidoreductase  25.06 
 
 		 817 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4871  FAD dependent oxidoreductase  26.12 
 
 		 825 aa  68.9  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862382  normal  0.731807 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3866  FAD dependent oxidoreductase  27.08 
 
 		 843 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  23.43 
 
 		 390 aa  68.6  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4985  FAD dependent oxidoreductase  24.46 
 
 		 831 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0450258 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0930  FAD dependent oxidoreductase  23.47 
 
 		 479 aa  68.2  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0776869  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2862  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  26.96 
 
 		 394 aa  67.4  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3310  FAD dependent oxidoreductase  26.73 
 
 		 816 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2198  FAD dependent oxidoreductase  26.45 
 
 		 815 aa  63.9  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138151  normal  0.0335767 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 		 378 aa  63.9  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 500 aa  63.5  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  25.71 
 
 		 823 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1021  FAD dependent oxidoreductase  21.91 
 
 		 500 aa  62.4  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 500 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2849  FAD dependent oxidoreductase  24.27 
 
 		 812 aa  62  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  26.99 
 
 		 492 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2063  FAD dependent oxidoreductase  23.14 
 
 		 806 aa  60.8  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4916  FAD dependent oxidoreductase  24.48 
 
 		 815 aa  60.8  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2112  FAD dependent oxidoreductase  26.44 
 
 		 392 aa  60.5  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0850914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  26.99 
 
 		 496 aa  60.5  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  25.99 
 
 		 402 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  25.74 
 
 		 395 aa  59.7  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  25.99 
 
 		 402 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  27.79 
 
 		 388 aa  59.3  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02147  hypothetical protein  26.39 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1596  FAD dependent oxidoreductase  25.25 
 
 		 821 aa  57.8  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.26338 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08100  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  23.18 
 
 		 503 aa  57.8  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242125  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  24.37 
 
 		 799 aa  57.4  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2805  FAD dependent oxidoreductase  24.12 
 
 		 802 aa  57  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.898682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3161  FAD dependent oxidoreductase  23.89 
 
 		 827 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2591  FAD dependent oxidoreductase  27.21 
 
 		 826 aa  56.2  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5112  FAD dependent oxidoreductase  23.28 
 
 		 806 aa  56.2  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0323529 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2742  DadA family oxidoreductase  24.56 
 
 		 371 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00153462  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3229  FAD dependent oxidoreductase  24.2 
 
 		 391 aa  55.8  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267382  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0708  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 362 aa  55.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440314  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  25.98 
 
 		 376 aa  54.7  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2529  DadA family oxidoreductase  24.31 
 
 		 371 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0933493  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2454  D-amino acid dehydrogenase small subunit  24.06 
 
 		 371 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295637  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6396  FAD dependent oxidoreductase  26.13 
 
 		 482 aa  54.3  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0152469  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2715  DadA family oxidoreductase  24.31 
 
 		 371 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2488  FAD dependent oxidoreductase  24.18 
 
 		 806 aa  54.3  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.255163  normal  0.0203493 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_41947  predicted protein  26.18 
 
 		 383 aa  54.7  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.856013  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2728  oxidoreductase, DadA family  24.31 
 
 		 371 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000981681 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  22.83 
 
 		 382 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2577  putative FAD dependent oxidoreductase  24.55 
 
 		 390 aa  54.3  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.119285 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  25.62 
 
 		 374 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2777  oxidoreductase, DadA family  24.81 
 
 		 371 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.848486  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3423  FAD dependent oxidoreductase  25.33 
 
 		 400 aa  54.3  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2192  FAD dependent oxidoreductase  24.5 
 
 		 375 aa  53.9  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1757  oxidoreductase, FAD-binding family protein  28.81 
 
 		 390 aa  53.9  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>