More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1083 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1083  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 369 aa  732    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4871  FAD dependent oxidoreductase  57.65 
 
 		 367 aa  375  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1132  FAD dependent oxidoreductase  52.46 
 
 		 376 aa  296  5e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.710335  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1429  FAD dependent oxidoreductase  44.5 
 
 		 383 aa  247  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860523 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2315  FAD dependent oxidoreductase  40.27 
 
 		 390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2246  FAD dependent oxidoreductase  41.94 
 
 		 378 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.721245 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3492  FAD dependent oxidoreductase  41.18 
 
 		 378 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5086  FAD dependent oxidoreductase  41.62 
 
 		 385 aa  238  9e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00135818  normal  0.404785 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1558  FAD dependent oxidoreductase  41.87 
 
 		 386 aa  235  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120445  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1877  FAD dependent oxidoreductase  41.18 
 
 		 378 aa  232  6e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3246  FAD dependent oxidoreductase  41.33 
 
 		 368 aa  232  9e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.548374  normal  0.597493 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3225  hypothetical protein  40 
 
 		 368 aa  229  5e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3563  putative FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase protein  41.76 
 
 		 368 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2008  FAD dependent oxidoreductase  42.18 
 
 		 373 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1468  FAD dependent oxidoreductase  40.65 
 
 		 375 aa  223  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.998705 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2431  FAD dependent oxidoreductase  42.52 
 
 		 379 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2247  FAD dependent oxidoreductase  43.03 
 
 		 375 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1627  FAD dependent oxidoreductase  42.73 
 
 		 375 aa  219  8.999999999999998e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.810827  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4053  FAD dependent oxidoreductase  40.11 
 
 		 389 aa  216  4e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3007  FAD dependent oxidoreductase  40.34 
 
 		 400 aa  213  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.469036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14010  putative amino acid oxidase  38.11 
 
 		 375 aa  206  5e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0341908 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1242  hypothetical protein  37.67 
 
 		 375 aa  206  6e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4669  FAD dependent oxidoreductase  39.84 
 
 		 374 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020335 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3567  FAD dependent oxidoreductase  37.82 
 
 		 381 aa  203  4e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.397516 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1837  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 		 381 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0490  FAD dependent oxidoreductase  38.18 
 
 		 361 aa  199  5e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0127123  normal  0.162763 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0969  FAD dependent oxidoreductase  37.11 
 
 		 375 aa  199  9e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0166  FAD dependent oxidoreductase  41.84 
 
 		 385 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0926  FAD dependent oxidoreductase  36.07 
 
 		 357 aa  191  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0820  FAD dependent oxidoreductase  40.6 
 
 		 384 aa  188  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1312  FAD dependent oxidoreductase  32.96 
 
 		 375 aa  168  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.544438  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1355  FAD dependent oxidoreductase  34 
 
 		 369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000118707 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0434  FAD dependent oxidoreductase  31.08 
 
 		 382 aa  103  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0852004 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  28.98 
 
 		 385 aa  99.4  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  28.53 
 
 		 378 aa  92  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  28.46 
 
 		 385 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  26.53 
 
 		 378 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  27.51 
 
 		 385 aa  84.7  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  29.09 
 
 		 392 aa  76.3  0.0000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2112  FAD dependent oxidoreductase  27.5 
 
 		 392 aa  75.5  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0850914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  27.76 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0683  FAD dependent oxidoreductase  27.1 
 
 		 496 aa  73.6  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.302039  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 		 394 aa  73.6  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  25.84 
 
 		 388 aa  72.8  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  25.71 
 
 		 388 aa  72.4  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2577  putative FAD dependent oxidoreductase  27.92 
 
 		 390 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.119285 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  27.15 
 
 		 386 aa  70.1  0.00000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  23.47 
 
 		 395 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  26.02 
 
 		 374 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1431  FAD dependent oxidoreductase  25.41 
 
 		 394 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0107924 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  27.72 
 
 		 393 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2862  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  25.68 
 
 		 394 aa  67.8  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3293  FAD dependent oxidoreductase  31.9 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  28.09 
 
 		 386 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  25.35 
 
 		 373 aa  67.4  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  22.62 
 
 		 390 aa  66.6  0.0000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0868  FAD dependent oxidoreductase  29.05 
 
 		 446 aa  66.2  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.585687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0720  FAD-dependent oxidoreductase  29.05 
 
 		 416 aa  66.2  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4434  FAD dependent oxidoreductase  32.3 
 
 		 378 aa  65.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862237  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4107  FAD dependent oxidoreductase  26.93 
 
 		 393 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0968917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  24.33 
 
 		 382 aa  65.1  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  26.65 
 
 		 385 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  24.36 
 
 		 394 aa  64.7  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  25.72 
 
 		 417 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2070  FAD dependent oxidoreductase  28.1 
 
 		 392 aa  64.3  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  25.94 
 
 		 417 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 385 aa  63.9  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  24.72 
 
 		 394 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  22.61 
 
 		 402 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  26.97 
 
 		 394 aa  63.5  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  27.1 
 
 		 395 aa  63.5  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  29.58 
 
 		 392 aa  63.2  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  25.41 
 
 		 376 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  22.61 
 
 		 402 aa  63.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  26.91 
 
 		 376 aa  62.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  24.06 
 
 		 394 aa  62.8  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6585  FAD dependent oxidoreductase  25.77 
 
 		 389 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  29.07 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6595  FAD dependent oxidoreductase  25.52 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.0778916 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  23.84 
 
 		 376 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5919  FAD dependent oxidoreductase  29.39 
 
 		 398 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000776638  normal  0.0692698 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  25.65 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4295  FAD dependent oxidoreductase  28.29 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269255  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1324  FAD dependent oxidoreductase  24.36 
 
 		 375 aa  60.5  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  26.67 
 
 		 382 aa  60.8  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  25.97 
 
 		 381 aa  60.5  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4141  FAD dependent oxidoreductase  46.05 
 
 		 375 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659228  normal  0.0539213 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4225  FAD dependent oxidoreductase  46.05 
 
 		 375 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211166  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1624  FAD dependent oxidoreductase  27.73 
 
 		 363 aa  60.5  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.909673  hitchhiker  0.0000164974 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3378  FAD dependent oxidoreductase  46.05 
 
 		 375 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1956  oxidoreductase, FAD-binding  27.73 
 
 		 363 aa  60.5  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.034563  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1893  FAD dependent oxidoreductase  46.05 
 
 		 375 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3229  FAD dependent oxidoreductase  24.13 
 
 		 391 aa  60.1  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267382  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1418  FAD dependent oxidoreductase  28.21 
 
 		 381 aa  60.1  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4032  FAD dependent oxidoreductase  44.59 
 
 		 375 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3551  FAD dependent oxidoreductase  45.95 
 
 		 375 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  26.32 
 
 		 652 aa  59.7  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2849  FAD dependent oxidoreductase  25.79 
 
 		 812 aa  59.3  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0990  D-amino-acid dehydrogenase  27.07 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  24.07 
 
 		 377 aa  59.3  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>