More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3563 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3563  putative FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase protein  100 
 
 		 368 aa  712    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3246  FAD dependent oxidoreductase  98.37 
 
 		 368 aa  702    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.548374  normal  0.597493 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3225  hypothetical protein  88.01 
 
 		 368 aa  627  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0926  FAD dependent oxidoreductase  58.94 
 
 		 357 aa  394  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0490  FAD dependent oxidoreductase  56.15 
 
 		 361 aa  354  2e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0127123  normal  0.162763 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5086  FAD dependent oxidoreductase  43.06 
 
 		 385 aa  248  8e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00135818  normal  0.404785 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3567  FAD dependent oxidoreductase  43.01 
 
 		 381 aa  242  9e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.397516 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1558  FAD dependent oxidoreductase  41.95 
 
 		 386 aa  236  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120445  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1877  FAD dependent oxidoreductase  42.93 
 
 		 378 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3492  FAD dependent oxidoreductase  41.85 
 
 		 378 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1468  FAD dependent oxidoreductase  43.58 
 
 		 375 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.998705 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2246  FAD dependent oxidoreductase  41.67 
 
 		 378 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.721245 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14010  putative amino acid oxidase  42.02 
 
 		 375 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0341908 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1242  hypothetical protein  42.34 
 
 		 375 aa  229  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0969  FAD dependent oxidoreductase  41.6 
 
 		 375 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2431  FAD dependent oxidoreductase  42.01 
 
 		 379 aa  227  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0166  FAD dependent oxidoreductase  44.06 
 
 		 385 aa  215  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2247  FAD dependent oxidoreductase  40.06 
 
 		 375 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1312  FAD dependent oxidoreductase  41.33 
 
 		 375 aa  213  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.544438  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1627  FAD dependent oxidoreductase  39.77 
 
 		 375 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.810827  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3007  FAD dependent oxidoreductase  40.3 
 
 		 400 aa  212  7e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.469036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4053  FAD dependent oxidoreductase  40.92 
 
 		 389 aa  210  3e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1429  FAD dependent oxidoreductase  41.03 
 
 		 383 aa  210  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860523 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2008  FAD dependent oxidoreductase  37.85 
 
 		 373 aa  209  5e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0820  FAD dependent oxidoreductase  39.42 
 
 		 384 aa  208  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4669  FAD dependent oxidoreductase  39.2 
 
 		 374 aa  206  4e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020335 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1355  FAD dependent oxidoreductase  41.09 
 
 		 369 aa  206  6e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000118707 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1083  FAD dependent oxidoreductase  41.76 
 
 		 369 aa  202  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1837  FAD dependent oxidoreductase  37.57 
 
 		 381 aa  194  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4871  FAD dependent oxidoreductase  38.04 
 
 		 367 aa  190  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1132  FAD dependent oxidoreductase  40.77 
 
 		 376 aa  182  7e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.710335  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2315  FAD dependent oxidoreductase  36.15 
 
 		 390 aa  181  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0434  FAD dependent oxidoreductase  32.41 
 
 		 382 aa  100  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0852004 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  29.53 
 
 		 388 aa  95.1  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  28.38 
 
 		 376 aa  89  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2112  FAD dependent oxidoreductase  30.39 
 
 		 392 aa  84.3  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0850914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  25.7 
 
 		 390 aa  81.6  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  27.36 
 
 		 386 aa  81.6  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  30.71 
 
 		 500 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  27.47 
 
 		 378 aa  80.5  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  30.08 
 
 		 496 aa  80.1  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  30.71 
 
 		 500 aa  79.7  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  25.33 
 
 		 385 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  26.46 
 
 		 385 aa  78.2  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  24.2 
 
 		 382 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0683  FAD dependent oxidoreductase  28.81 
 
 		 496 aa  77.4  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.302039  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  25.33 
 
 		 385 aa  76.3  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  27.66 
 
 		 378 aa  74.7  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02147  hypothetical protein  30.35 
 
 		 398 aa  73.2  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  25.78 
 
 		 382 aa  72  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  25.53 
 
 		 378 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  24.32 
 
 		 373 aa  71.2  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  28.72 
 
 		 382 aa  70.9  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0320  FAD dependent oxidoreductase  24.01 
 
 		 485 aa  70.5  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3293  FAD dependent oxidoreductase  27.98 
 
 		 385 aa  69.7  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  27.45 
 
 		 392 aa  68.9  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1830  SoxB protein  28.8 
 
 		 377 aa  68.9  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.260331 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  29.2 
 
 		 400 aa  68.2  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3393  sarcosine oxidase, beta subunit family  24.94 
 
 		 417 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0208125  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  25.82 
 
 		 395 aa  68.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3229  FAD dependent oxidoreductase  24.25 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267382  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6595  FAD dependent oxidoreductase  26.8 
 
 		 390 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.0778916 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 		 385 aa  67  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1324  FAD dependent oxidoreductase  23.7 
 
 		 375 aa  67  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  25.88 
 
 		 402 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  25.67 
 
 		 823 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  24.01 
 
 		 385 aa  66.2  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1431  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 		 394 aa  66.2  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0107924 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  25.68 
 
 		 402 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  30.6 
 
 		 388 aa  65.9  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  28.72 
 
 		 492 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 		 378 aa  65.1  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08100  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  25 
 
 		 503 aa  65.1  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242125  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1021  FAD dependent oxidoreductase  24.86 
 
 		 500 aa  64.7  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  25.45 
 
 		 394 aa  64.3  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2862  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  24.87 
 
 		 394 aa  64.3  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2577  putative FAD dependent oxidoreductase  29.49 
 
 		 390 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.119285 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2558  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  25 
 
 		 476 aa  64.3  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04101  putative sarcosine oxidase  24.28 
 
 		 394 aa  63.5  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0903484  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2875  FAD-dependent oxidoreductase  25 
 
 		 476 aa  63.5  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4985  FAD dependent oxidoreductase  28.66 
 
 		 831 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0450258 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  27.34 
 
 		 388 aa  63.2  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  24.79 
 
 		 394 aa  63.2  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2063  FAD dependent oxidoreductase  24.29 
 
 		 806 aa  63.2  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  22.94 
 
 		 381 aa  62  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2197  FAD dependent oxidoreductase  27.35 
 
 		 815 aa  62.4  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.031847 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  26.56 
 
 		 394 aa  62.4  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0992  sarcosine oxidase beta subunit family protein  26.32 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.23749  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3311  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 		 817 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1760  oxidoreductase, FAD-binding family protein  30.05 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3661  sarcosine oxidase, beta subunit family  25.17 
 
 		 417 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.616865  normal  0.13922 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0930  FAD dependent oxidoreductase  23.94 
 
 		 479 aa  60.8  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0776869  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6585  FAD dependent oxidoreductase  29.36 
 
 		 389 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  26.68 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3423  FAD dependent oxidoreductase  28.45 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  25.47 
 
 		 383 aa  60.8  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1666  dehydrogenase  28.01 
 
 		 831 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0839495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  24.43 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4916  FAD dependent oxidoreductase  26.69 
 
 		 815 aa  60.5  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>