More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0320 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0320  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 485 aa  996    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1244  FAD dependent oxidoreductase  54.04 
 
 		 479 aa  533  1e-150  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1021  FAD dependent oxidoreductase  51.95 
 
 		 500 aa  498  1e-140  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0411  oxidoreductase, FAD-binding  49.9 
 
 		 473 aa  485  1e-136  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0546468  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1490  FAD dependent oxidoreductase  49.07 
 
 		 473 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2643  oxidoreductase, FAD-dependent  49.58 
 
 		 489 aa  455  1.0000000000000001e-126  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.292986  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1628  FAD dependent oxidoreductase  49.16 
 
 		 478 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.855011  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2875  FAD-dependent oxidoreductase  47.93 
 
 		 476 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2558  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  47.3 
 
 		 476 aa  440  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0930  FAD dependent oxidoreductase  45.93 
 
 		 479 aa  431  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0776869  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0683  FAD dependent oxidoreductase  45.25 
 
 		 496 aa  427  1e-118  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.302039  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08100  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  45.51 
 
 		 503 aa  421  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242125  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1552  FAD dependent oxidoreductase  44.12 
 
 		 494 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.374477  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1237  FAD dependent oxidoreductase  42.28 
 
 		 965 aa  404  1e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.18893  normal  0.393596 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06270  predicted dehydrogenase  44.13 
 
 		 511 aa  397  1e-109  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0021  FAD dependent oxidoreductase  44.26 
 
 		 484 aa  386  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0147629  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0620  FAD dependent oxidoreductase  42.27 
 
 		 478 aa  367  1e-100  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1362  FAD dependent oxidoreductase  42.15 
 
 		 479 aa  353  4e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1324  FAD dependent oxidoreductase  41.53 
 
 		 479 aa  350  2e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00260762  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0697  FAD dependent oxidoreductase  41.36 
 
 		 480 aa  347  2e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1532  FAD dependent oxidoreductase  40.04 
 
 		 493 aa  333  4e-90  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0293  FAD dependent oxidoreductase  39.45 
 
 		 491 aa  327  4.0000000000000003e-88  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000524606  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3394  FAD dependent oxidoreductase  40.09 
 
 		 576 aa  325  9e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.513559  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0134  oxidoreductase, FAD-dependent  35.63 
 
 		 508 aa  309  5.9999999999999995e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00168414  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7847  oxidoreductase, FAD-binding protein  36.11 
 
 		 472 aa  309  8e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0283  FAD dependent oxidoreductase  35.27 
 
 		 475 aa  281  2e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3539  FAD dependent oxidoreductase  33.55 
 
 		 470 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3534  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 473 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0951864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3607  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 473 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3930  FAD dependent oxidoreductase  33.26 
 
 		 461 aa  272  8.000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.130124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2649  FAD dependent oxidoreductase  33.04 
 
 		 465 aa  266  4e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1678  FAD dependent oxidoreductase  31.95 
 
 		 464 aa  250  5e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0012  FAD-dependent oxidoreductase  29.69 
 
 		 464 aa  226  1e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0012  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  29.48 
 
 		 464 aa  224  2e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2696  FAD dependent oxidoreductase  27.54 
 
 		 465 aa  201  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0111401  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45170  putative oxidoreductase  30.48 
 
 		 396 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.381756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0219  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, putative  33.13 
 
 		 387 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1375  FAD dependent oxidoreductase  28.07 
 
 		 461 aa  162  1e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.575431  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38067  predicted protein  36.56 
 
 		 698 aa  157  4e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00714206  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6841  NAD binding site FAD dependent oxidoreductase  31.02 
 
 		 367 aa  155  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2706  FAD dependent oxidoreductase  31.08 
 
 		 364 aa  150  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0337061  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1005  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 		 368 aa  144  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.179288 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1916  FAD dependent oxidoreductase  28.76 
 
 		 371 aa  144  4e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0872909 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2451  FAD dependent oxidoreductase  30.16 
 
 		 367 aa  143  6e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  31.58 
 
 		 409 aa  140  6e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2136  FAD dependent oxidoreductase  31.46 
 
 		 371 aa  140  7e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.471962  normal  0.0129365 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0628  putative FAD dependent oxidoreductase  27.91 
 
 		 374 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.323528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1646  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  31.18 
 
 		 371 aa  139  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.515375  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1140  FAD dependent oxidoreductase  29.03 
 
 		 368 aa  138  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0603157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2152  FAD dependent oxidoreductase  30.73 
 
 		 367 aa  137  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6395  FAD dependent oxidoreductase  29.65 
 
 		 366 aa  136  8e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50137  predicted protein  26.56 
 
 		 437 aa  136  8e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.563801  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1259  FAD dependent oxidoreductase  30.16 
 
 		 368 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3067  FAD dependent oxidoreductase  29.19 
 
 		 369 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.41507 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0217  oxidoreductase, FAD-binding family protein  28.27 
 
 		 373 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.655071  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2434  FAD dependent oxidoreductase  29.19 
 
 		 369 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3048  FAD dependent oxidoreductase  29.19 
 
 		 369 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3297  oxidoreductase, FAD-binding family protein  27.96 
 
 		 373 aa  134  5e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0434  oxidoreductase, FAD-binding family protein  27.96 
 
 		 373 aa  134  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0953783  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0239  FAD-dependent oxidoreductase  27.96 
 
 		 373 aa  134  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202342  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3382  oxidoreductase, FAD-binding family protein  27.96 
 
 		 373 aa  134  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0251  FAD-dependent oxidoreductase  27.96 
 
 		 373 aa  134  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2964  oxidoreductase, FAD-binding family protein  27.96 
 
 		 373 aa  134  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2124  oxidoreductase, FAD-binding family protein  27.96 
 
 		 373 aa  134  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.646813  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3043  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 369 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1081  FAD dependent oxidoreductase  29.35 
 
 		 367 aa  133  9e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0868948  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3093  FAD dependent oxidoreductase  28.3 
 
 		 369 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0106  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  30.71 
 
 		 368 aa  131  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1640  FAD dependent oxidoreductase  28.38 
 
 		 366 aa  131  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2959  FAD dependent oxidoreductase  28.3 
 
 		 369 aa  130  6e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1090  FAD dependent oxidoreductase  27.3 
 
 		 378 aa  129  9.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.151516  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2496  FAD dependent oxidoreductase  29.16 
 
 		 369 aa  129  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2799  FAD dependent oxidoreductase  29.82 
 
 		 380 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4590  FAD dependent oxidoreductase  28.14 
 
 		 394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4703  predicted protein  27.72 
 
 		 373 aa  127  3e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.629805  normal  0.0151489 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2518  FAD dependent oxidoreductase  27.93 
 
 		 374 aa  127  5e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.355851  normal  0.0110864 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3423  FAD dependent oxidoreductase  27.03 
 
 		 400 aa  127  5e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2640  FAD dependent oxidoreductase  28.84 
 
 		 366 aa  125  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0387  FAD dependent oxidoreductase  30.48 
 
 		 368 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0430  FAD dependent oxidoreductase  28.31 
 
 		 370 aa  124  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1240  FAD dependent oxidoreductase  28.81 
 
 		 367 aa  124  5e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.241084  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4334  putative FAD dependent oxidoreductase  30.19 
 
 		 368 aa  123  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  27.41 
 
 		 402 aa  123  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5430  FAD dependent oxidoreductase  27.56 
 
 		 364 aa  123  9e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0222  FAD dependent oxidoreductase  28.84 
 
 		 364 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0708  FAD dependent oxidoreductase  28.69 
 
 		 362 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440314  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5882  hypothetical protein  27.32 
 
 		 368 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3992  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  28.21 
 
 		 366 aa  121  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.475329  normal  0.0131881 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3777  FAD dependent oxidoreductase  28.31 
 
 		 371 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.986155 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  26.91 
 
 		 402 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_41947  predicted protein  27.62 
 
 		 383 aa  120  7e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.856013  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2624  FAD dependent oxidoreductase  26.58 
 
 		 442 aa  119  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0119  FAD dependent oxidoreductase  27.18 
 
 		 395 aa  117  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3956  FAD dependent oxidoreductase  28.53 
 
 		 372 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.792256  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0189  FAD dependent oxidoreductase  31.71 
 
 		 405 aa  117  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0530  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 		 375 aa  114  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  29.04 
 
 		 404 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2833  FAD dependent oxidoreductase  28.84 
 
 		 364 aa  114  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0535368 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4647  FAD dependent oxidoreductase  28.02 
 
 		 366 aa  114  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1660  dehydrogenase  25.06 
 
 		 625 aa  113  8.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>