More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2862 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2862  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  100 
 
 		 394 aa  793    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1431  FAD dependent oxidoreductase  98.48 
 
 		 394 aa  786    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0107924 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4757  FAD dependent oxidoreductase  49.87 
 
 		 390 aa  347  2e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2070  FAD dependent oxidoreductase  51.5 
 
 		 392 aa  333  2e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3496  FAD dependent oxidoreductase  43.73 
 
 		 405 aa  331  2e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177627 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3229  FAD dependent oxidoreductase  43.4 
 
 		 391 aa  318  2e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267382  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2577  putative FAD dependent oxidoreductase  48.14 
 
 		 390 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.119285 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2808  oxidoreductase, FAD-binding family protein  48.43 
 
 		 390 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2867  oxidoreductase, FAD-binding family protein  48.43 
 
 		 418 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6595  FAD dependent oxidoreductase  47.61 
 
 		 390 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.0778916 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2748  oxidoreductase, FAD-binding family protein  48.42 
 
 		 390 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.252588  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1760  oxidoreductase, FAD-binding family protein  48.16 
 
 		 390 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2435  oxidoreductase, FAD-binding family protein  48.16 
 
 		 390 aa  309  4e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0467125  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0571  oxidoreductase, FAD-binding family protein  48.16 
 
 		 418 aa  310  4e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1757  oxidoreductase, FAD-binding family protein  48.16 
 
 		 390 aa  309  4e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283784  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2845  oxidoreductase, FAD-binding family protein  48.16 
 
 		 433 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3884  FAD dependent oxidoreductase  47.61 
 
 		 390 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303875  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02147  hypothetical protein  44.71 
 
 		 398 aa  294  2e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3417  FAD dependent oxidoreductase  45.21 
 
 		 390 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5250  FAD dependent oxidoreductase  45.48 
 
 		 390 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2677  FAD dependent oxidoreductase  45.21 
 
 		 390 aa  286  5e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5151  FAD dependent oxidoreductase  44.41 
 
 		 390 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.836539  normal  0.719535 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4046  FAD dependent oxidoreductase  44.68 
 
 		 390 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3475  FAD dependent oxidoreductase  44.68 
 
 		 390 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2994  FAD dependent oxidoreductase  42.31 
 
 		 390 aa  280  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  36.18 
 
 		 385 aa  191  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 		 385 aa  183  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  34.87 
 
 		 385 aa  179  7e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 385 aa  176  9e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3293  FAD dependent oxidoreductase  33.88 
 
 		 385 aa  156  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  27.47 
 
 		 390 aa  155  2e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  32.11 
 
 		 392 aa  142  8e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  27.73 
 
 		 373 aa  139  1e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  32.82 
 
 		 378 aa  137  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  27.57 
 
 		 382 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  29.92 
 
 		 388 aa  133  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  31.77 
 
 		 378 aa  133  5e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  27.14 
 
 		 382 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  32.16 
 
 		 378 aa  122  9e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 		 394 aa  118  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  28.26 
 
 		 394 aa  116  6.9999999999999995e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  28.94 
 
 		 394 aa  114  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  30.46 
 
 		 383 aa  113  5e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  28.14 
 
 		 395 aa  113  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  27.97 
 
 		 386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  27.56 
 
 		 385 aa  109  9.000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 		 395 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  28.07 
 
 		 500 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  27.05 
 
 		 816 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  27.82 
 
 		 500 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  28.94 
 
 		 492 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4871  FAD dependent oxidoreductase  30.12 
 
 		 825 aa  103  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862382  normal  0.731807 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  28.1 
 
 		 496 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  26.6 
 
 		 816 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  27.06 
 
 		 823 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1296  FAD dependent oxidoreductase  28.89 
 
 		 401 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43026  normal  0.445947 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  28.94 
 
 		 376 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0935  FAD dependent oxidoreductase  27.3 
 
 		 376 aa  101  3e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.311284  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1527  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 		 416 aa  101  3e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.246642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  25.79 
 
 		 381 aa  100  4e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1024  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 		 403 aa  100  6e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000324501  unclonable  1.04901e-22 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1461  FAD dependent oxidoreductase  27.34 
 
 		 416 aa  94.7  3e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.719786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1848  FAD dependent oxidoreductase  28.82 
 
 		 378 aa  94  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.287144  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  28.75 
 
 		 399 aa  94  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0486  FAD dependent oxidoreductase  26.49 
 
 		 835 aa  93.6  6e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0493808  normal  0.0384194 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0919  FAD dependent oxidoreductase  27.07 
 
 		 837 aa  92.4  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1655  FAD dependent oxidoreductase  26.56 
 
 		 415 aa  91.7  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.347417 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0434  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 		 382 aa  90.1  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0852004 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1985  FAD dependent oxidoreductase  25.07 
 
 		 387 aa  89.7  8e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.886969  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4985  FAD dependent oxidoreductase  26.58 
 
 		 398 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 388 aa  88.6  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0798  glycine cleavage system T protein  28.53 
 
 		 822 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2198  FAD dependent oxidoreductase  27.37 
 
 		 815 aa  88.2  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138151  normal  0.0335767 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4896  FAD dependent oxidoreductase  26.58 
 
 		 398 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1666  dehydrogenase  28.66 
 
 		 831 aa  87.4  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0839495 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5264  FAD dependent oxidoreductase  26.3 
 
 		 398 aa  86.7  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  26.21 
 
 		 819 aa  86.3  9e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2112  FAD dependent oxidoreductase  27.6 
 
 		 392 aa  85.1  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0850914  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1558  FAD dependent oxidoreductase  26.63 
 
 		 386 aa  84.3  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120445  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  26.92 
 
 		 378 aa  84  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2431  FAD dependent oxidoreductase  27.81 
 
 		 379 aa  84  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1837  FAD dependent oxidoreductase  27.71 
 
 		 381 aa  84  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4985  FAD dependent oxidoreductase  26.98 
 
 		 831 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0450258 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31544  predicted protein  27.58 
 
 		 1033 aa  82  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0939  FAD dependent oxidoreductase  30.24 
 
 		 797 aa  81.3  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2727  dimethylglycine dehydrogenase  24.6 
 
 		 879 aa  81.3  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3310  FAD dependent oxidoreductase  26.1 
 
 		 816 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3566  dimethylglycine dehydrogenase  26.04 
 
 		 831 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  26.23 
 
 		 374 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3155  hypothetical protein  26.04 
 
 		 831 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3838  FAD dependent oxidoreductase  27.3 
 
 		 827 aa  77.4  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761233  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3929  FAD dependent oxidoreductase  26.65 
 
 		 386 aa  77.4  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.371488  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4841  FAD dependent oxidoreductase  25.52 
 
 		 400 aa  76.3  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0222  FAD dependent oxidoreductase  22.9 
 
 		 365 aa  75.5  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000376254  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1481  FAD dependent oxidoreductase  25.88 
 
 		 801 aa  75.9  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0926  FAD dependent oxidoreductase  24.42 
 
 		 393 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3249  FAD dependent oxidoreductase  25.78 
 
 		 831 aa  75.5  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0784832  normal  0.220016 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2488  FAD dependent oxidoreductase  27.49 
 
 		 806 aa  75.1  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.255163  normal  0.0203493 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  25.9 
 
 		 385 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  29.25 
 
 		 960 aa  75.1  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>