More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5250 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2677  FAD dependent oxidoreductase  95.13 
 
 		 390 aa  676    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3475  FAD dependent oxidoreductase  94.62 
 
 		 390 aa  671    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5151  FAD dependent oxidoreductase  92.05 
 
 		 390 aa  668    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.836539  normal  0.719535 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4046  FAD dependent oxidoreductase  94.62 
 
 		 390 aa  673    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3417  FAD dependent oxidoreductase  99.49 
 
 		 390 aa  793    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5250  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 390 aa  795    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2577  putative FAD dependent oxidoreductase  81.28 
 
 		 390 aa  600  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.119285 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6595  FAD dependent oxidoreductase  81.28 
 
 		 390 aa  600  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.0778916 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3884  FAD dependent oxidoreductase  79.62 
 
 		 390 aa  578  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2867  oxidoreductase, FAD-binding family protein  75.13 
 
 		 418 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2808  oxidoreductase, FAD-binding family protein  75.13 
 
 		 390 aa  569  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2748  oxidoreductase, FAD-binding family protein  74.73 
 
 		 390 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.252588  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0571  oxidoreductase, FAD-binding family protein  74.73 
 
 		 418 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1760  oxidoreductase, FAD-binding family protein  73.59 
 
 		 390 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2435  oxidoreductase, FAD-binding family protein  74.73 
 
 		 390 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0467125  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1757  oxidoreductase, FAD-binding family protein  74.73 
 
 		 390 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283784  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2845  oxidoreductase, FAD-binding family protein  74.73 
 
 		 433 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3229  FAD dependent oxidoreductase  52.71 
 
 		 391 aa  436  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267382  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2994  FAD dependent oxidoreductase  57.18 
 
 		 390 aa  423  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02147  hypothetical protein  56.38 
 
 		 398 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4757  FAD dependent oxidoreductase  55.24 
 
 		 390 aa  412  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2070  FAD dependent oxidoreductase  50.26 
 
 		 392 aa  367  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2862  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  45.69 
 
 		 394 aa  333  3e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1431  FAD dependent oxidoreductase  44.92 
 
 		 394 aa  330  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0107924 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3496  FAD dependent oxidoreductase  41.21 
 
 		 405 aa  296  4e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177627 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  34.01 
 
 		 385 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  36.03 
 
 		 385 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  36.2 
 
 		 385 aa  179  8e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  34.17 
 
 		 385 aa  168  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  33.79 
 
 		 386 aa  162  6e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3293  FAD dependent oxidoreductase  34.32 
 
 		 385 aa  154  4e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  31.9 
 
 		 378 aa  150  4e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  29.53 
 
 		 390 aa  148  1.0000000000000001e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  31.08 
 
 		 378 aa  132  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  30.71 
 
 		 378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  26.72 
 
 		 373 aa  125  1e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  28.72 
 
 		 383 aa  122  9e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  31.32 
 
 		 392 aa  122  9e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  30.51 
 
 		 388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  30.03 
 
 		 395 aa  120  6e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  30.4 
 
 		 388 aa  117  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2112  FAD dependent oxidoreductase  30.15 
 
 		 392 aa  116  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0850914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  26.4 
 
 		 382 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  28.18 
 
 		 399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  27.33 
 
 		 385 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  27.02 
 
 		 382 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1461  FAD dependent oxidoreductase  27.14 
 
 		 416 aa  108  2e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.719786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1024  FAD dependent oxidoreductase  27.85 
 
 		 403 aa  107  3e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000324501  unclonable  1.04901e-22 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1296  FAD dependent oxidoreductase  27.17 
 
 		 401 aa  104  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43026  normal  0.445947 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5513  FAD dependent oxidoreductase  28.3 
 
 		 398 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225549 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5264  FAD dependent oxidoreductase  26.88 
 
 		 398 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4985  FAD dependent oxidoreductase  26.88 
 
 		 398 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4896  FAD dependent oxidoreductase  26.88 
 
 		 398 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  26.32 
 
 		 394 aa  101  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  28.23 
 
 		 394 aa  98.6  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  25.57 
 
 		 394 aa  97.8  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  27.39 
 
 		 500 aa  97.4  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  27.13 
 
 		 500 aa  96.3  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  27.39 
 
 		 496 aa  96.7  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  25.2 
 
 		 816 aa  96.3  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1655  FAD dependent oxidoreductase  27.41 
 
 		 415 aa  96.3  9e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.347417 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  24.41 
 
 		 381 aa  94.7  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  26.52 
 
 		 376 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1527  FAD dependent oxidoreductase  26.55 
 
 		 416 aa  94.4  3e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.246642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  24.93 
 
 		 816 aa  94  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  27.1 
 
 		 492 aa  91.3  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1985  FAD dependent oxidoreductase  29.23 
 
 		 387 aa  88.6  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.886969  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  26.01 
 
 		 389 aa  87.8  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  28 
 
 		 823 aa  87  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3469  FAD dependent oxidoreductase  25.82 
 
 		 835 aa  85.5  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 		 378 aa  84.7  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6585  FAD dependent oxidoreductase  27.75 
 
 		 389 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1877  FAD dependent oxidoreductase  26.23 
 
 		 378 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  23.88 
 
 		 395 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4871  FAD dependent oxidoreductase  32.1 
 
 		 825 aa  83.2  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862382  normal  0.731807 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1837  FAD dependent oxidoreductase  27.79 
 
 		 381 aa  82.8  0.000000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2591  FAD dependent oxidoreductase  29.55 
 
 		 826 aa  82.8  0.000000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  26.13 
 
 		 385 aa  82.4  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2431  FAD dependent oxidoreductase  25.36 
 
 		 379 aa  82  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0926  FAD dependent oxidoreductase  26.68 
 
 		 357 aa  82  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  24.68 
 
 		 378 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0926  FAD dependent oxidoreductase  24.62 
 
 		 393 aa  81.3  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3311  FAD dependent oxidoreductase  24.87 
 
 		 817 aa  81.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  25.47 
 
 		 389 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1168  FAD dependent oxidoreductase  21.88 
 
 		 372 aa  80.5  0.00000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.754644  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3492  FAD dependent oxidoreductase  25.41 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  26.72 
 
 		 394 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4053  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 		 389 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1558  FAD dependent oxidoreductase  25.82 
 
 		 386 aa  79.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120445  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3849  FAD dependent oxidoreductase  28.77 
 
 		 404 aa  79  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.121432  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3718  FAD dependent oxidoreductase  25.32 
 
 		 835 aa  77.8  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1429  FAD dependent oxidoreductase  26.76 
 
 		 383 aa  77.8  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860523 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0222  FAD dependent oxidoreductase  25.38 
 
 		 365 aa  77.8  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000376254  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2246  FAD dependent oxidoreductase  25.14 
 
 		 378 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.721245 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  25.79 
 
 		 369 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  26.49 
 
 		 369 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  25.86 
 
 		 369 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3340  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 		 387 aa  76.6  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0285888  normal  0.210627 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2197  FAD dependent oxidoreductase  24.47 
 
 		 815 aa  75.9  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.031847 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  26.78 
 
 		 394 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>