More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3496 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3496  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
405 aa  842    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0177627 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3229  FAD dependent oxidoreductase  44.19 
 
 
391 aa  343  2e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267382  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1431  FAD dependent oxidoreductase  43.99 
 
 
394 aa  333  3e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0107924 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2862  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  43.73 
 
 
394 aa  331  2e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2070  FAD dependent oxidoreductase  44.56 
 
 
392 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4757  FAD dependent oxidoreductase  41.27 
 
 
390 aa  293  4e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2867  oxidoreductase, FAD-binding family protein  39.48 
 
 
418 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2808  oxidoreductase, FAD-binding family protein  39.48 
 
 
390 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2748  oxidoreductase, FAD-binding family protein  39.43 
 
 
390 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.252588  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2435  oxidoreductase, FAD-binding family protein  39.43 
 
 
390 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0467125  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2845  oxidoreductase, FAD-binding family protein  39.43 
 
 
433 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1757  oxidoreductase, FAD-binding family protein  39.43 
 
 
390 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283784  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0571  oxidoreductase, FAD-binding family protein  39.43 
 
 
418 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6595  FAD dependent oxidoreductase  40.11 
 
 
390 aa  281  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.0778916 
 
 
-
 
NC_003296  RS02147  hypothetical protein  42.15 
 
 
398 aa  280  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2577  putative FAD dependent oxidoreductase  39.73 
 
 
390 aa  280  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.119285 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1760  oxidoreductase, FAD-binding family protein  39.16 
 
 
390 aa  275  7e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2994  FAD dependent oxidoreductase  39.54 
 
 
390 aa  273  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2677  FAD dependent oxidoreductase  38.9 
 
 
390 aa  270  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3417  FAD dependent oxidoreductase  38.9 
 
 
390 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5250  FAD dependent oxidoreductase  38.9 
 
 
390 aa  270  5e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3884  FAD dependent oxidoreductase  37.93 
 
 
390 aa  268  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303875  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5151  FAD dependent oxidoreductase  38.63 
 
 
390 aa  266  4e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.836539  normal  0.719535 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4046  FAD dependent oxidoreductase  38.08 
 
 
390 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3475  FAD dependent oxidoreductase  38.08 
 
 
390 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  30.65 
 
 
385 aa  166  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  30.39 
 
 
385 aa  163  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  28.87 
 
 
385 aa  161  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3293  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
385 aa  150  5e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  27.53 
 
 
385 aa  144  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  27.98 
 
 
390 aa  140  3.9999999999999997e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  31.62 
 
 
378 aa  140  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  29.08 
 
 
386 aa  139  8.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  26.3 
 
 
382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  25.57 
 
 
382 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  29.39 
 
 
392 aa  122  9e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 
394 aa  122  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  28.95 
 
 
395 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  25.69 
 
 
373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  27.3 
 
 
378 aa  113  5e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  25.96 
 
 
395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  27.86 
 
 
388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  24.79 
 
 
385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  26.55 
 
 
394 aa  110  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  26.29 
 
 
394 aa  110  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 
378 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  27.88 
 
 
823 aa  105  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  26.47 
 
 
492 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1655  FAD dependent oxidoreductase  26.27 
 
 
415 aa  100  4e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.347417 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  24.73 
 
 
383 aa  100  4e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  25.67 
 
 
381 aa  98.2  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  27.93 
 
 
500 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4871  FAD dependent oxidoreductase  28.66 
 
 
825 aa  97.4  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862382  normal  0.731807 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  28.19 
 
 
496 aa  97.4  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  27.18 
 
 
816 aa  97.4  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  26.13 
 
 
388 aa  97.1  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  27.66 
 
 
500 aa  96.7  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1024  FAD dependent oxidoreductase  25.93 
 
 
403 aa  95.9  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000324501  unclonable  1.04901e-22 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1527  FAD dependent oxidoreductase  26.32 
 
 
416 aa  94.7  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.246642  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1666  dehydrogenase  25.82 
 
 
831 aa  94  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0839495 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4985  FAD dependent oxidoreductase  27.44 
 
 
831 aa  93.6  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0450258 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  26.41 
 
 
816 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2197  FAD dependent oxidoreductase  25.59 
 
 
815 aa  90.9  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.031847 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2452  sarcosine oxidase, beta subunit  26.6 
 
 
413 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00527323  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2224  FAD dependent oxidoreductase  26.4 
 
 
413 aa  89  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.175364  normal  0.288847 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  26.2 
 
 
394 aa  87  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0935  FAD dependent oxidoreductase  22.84 
 
 
376 aa  86.7  7e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.311284  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2104  FAD dependent oxidoreductase  26.97 
 
 
413 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1481  FAD dependent oxidoreductase  26.84 
 
 
801 aa  85.5  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3472  FAD dependent oxidoreductase  27.04 
 
 
413 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4841  FAD dependent oxidoreductase  26.74 
 
 
400 aa  85.9  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2112  FAD dependent oxidoreductase  24.54 
 
 
392 aa  84  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0850914  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2488  FAD dependent oxidoreductase  26.91 
 
 
806 aa  82.8  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.255163  normal  0.0203493 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3161  FAD dependent oxidoreductase  26.79 
 
 
827 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3311  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 
817 aa  81.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1461  FAD dependent oxidoreductase  22.98 
 
 
416 aa  79.7  0.00000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.719786  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2591  FAD dependent oxidoreductase  24.93 
 
 
826 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  25.18 
 
 
389 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  24.14 
 
 
376 aa  77  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1426  FAD dependent oxidoreductase  25.19 
 
 
805 aa  77  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0785769 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0222  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
365 aa  77  0.0000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000376254  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3533  FAD dependent oxidoreductase  25.89 
 
 
394 aa  76.6  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.972727  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  25.37 
 
 
394 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0919  FAD dependent oxidoreductase  25.61 
 
 
837 aa  76.3  0.0000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4916  FAD dependent oxidoreductase  25.07 
 
 
815 aa  76.3  0.0000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2063  FAD dependent oxidoreductase  25.46 
 
 
806 aa  75.1  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2727  dimethylglycine dehydrogenase  27.7 
 
 
879 aa  75.5  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
374 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2967  bifunctional enzyme involved in glycine degradation  26.29 
 
 
831 aa  75.1  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.782343 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0926  FAD dependent oxidoreductase  24.62 
 
 
393 aa  74.3  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0486  FAD dependent oxidoreductase  24.4 
 
 
835 aa  74.7  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0493808  normal  0.0384194 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  27.95 
 
 
960 aa  74.3  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  22.79 
 
 
396 aa  73.9  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3249  FAD dependent oxidoreductase  25.27 
 
 
831 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0784832  normal  0.220016 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  22.98 
 
 
819 aa  72  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0642  FAD dependent oxidoreductase  24.1 
 
 
815 aa  70.9  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1985  FAD dependent oxidoreductase  23.81 
 
 
387 aa  70.9  0.00000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.886969  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3866  FAD dependent oxidoreductase  24.73 
 
 
843 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  24.62 
 
 
378 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3566  dimethylglycine dehydrogenase  25 
 
 
831 aa  70.1  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>