More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2070 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2070  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 392 aa  785    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3229  FAD dependent oxidoreductase  51.28 
 
 		 391 aa  414  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267382  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4757  FAD dependent oxidoreductase  55.3 
 
 		 390 aa  398  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2994  FAD dependent oxidoreductase  54.36 
 
 		 390 aa  385  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02147  hypothetical protein  53.83 
 
 		 398 aa  372  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3884  FAD dependent oxidoreductase  52.52 
 
 		 390 aa  366  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2577  putative FAD dependent oxidoreductase  51.99 
 
 		 390 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.119285 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6595  FAD dependent oxidoreductase  51.46 
 
 		 390 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.0778916 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2867  oxidoreductase, FAD-binding family protein  52.36 
 
 		 418 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2808  oxidoreductase, FAD-binding family protein  52.36 
 
 		 390 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2845  oxidoreductase, FAD-binding family protein  52.11 
 
 		 433 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0571  oxidoreductase, FAD-binding family protein  52.11 
 
 		 418 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2435  oxidoreductase, FAD-binding family protein  52.11 
 
 		 390 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0467125  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1757  oxidoreductase, FAD-binding family protein  52.11 
 
 		 390 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283784  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2748  oxidoreductase, FAD-binding family protein  52.11 
 
 		 390 aa  359  4e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.252588  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1760  oxidoreductase, FAD-binding family protein  52.11 
 
 		 390 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1431  FAD dependent oxidoreductase  51.25 
 
 		 394 aa  354  1e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0107924 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2862  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  51 
 
 		 394 aa  352  4e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3417  FAD dependent oxidoreductase  49.6 
 
 		 390 aa  348  9e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5250  FAD dependent oxidoreductase  49.6 
 
 		 390 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3496  FAD dependent oxidoreductase  44.53 
 
 		 405 aa  344  1e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177627 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2677  FAD dependent oxidoreductase  48.81 
 
 		 390 aa  343  4e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5151  FAD dependent oxidoreductase  49.07 
 
 		 390 aa  342  7e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.836539  normal  0.719535 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4046  FAD dependent oxidoreductase  48.01 
 
 		 390 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3475  FAD dependent oxidoreductase  48.01 
 
 		 390 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  37.11 
 
 		 385 aa  192  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  35.82 
 
 		 385 aa  187  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  35.64 
 
 		 385 aa  186  6e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  33.42 
 
 		 385 aa  167  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  29.34 
 
 		 390 aa  157  2e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 		 373 aa  143  5e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3293  FAD dependent oxidoreductase  36.46 
 
 		 385 aa  143  6e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  31.2 
 
 		 378 aa  139  6e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  32.38 
 
 		 392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  32.53 
 
 		 383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  30.69 
 
 		 378 aa  127  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  31.41 
 
 		 386 aa  126  8.000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  28.24 
 
 		 382 aa  124  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  30.75 
 
 		 382 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  30.83 
 
 		 500 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  32.81 
 
 		 378 aa  111  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  30.96 
 
 		 395 aa  111  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  28.38 
 
 		 381 aa  110  6e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  30.31 
 
 		 500 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  30.31 
 
 		 496 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  28.21 
 
 		 394 aa  103  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  29.5 
 
 		 492 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  31.18 
 
 		 388 aa  103  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 394 aa  102  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  28.89 
 
 		 376 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  28.05 
 
 		 385 aa  100  5e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  26.15 
 
 		 395 aa  97.8  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  28.76 
 
 		 816 aa  97.4  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  28.49 
 
 		 394 aa  96.3  8e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  28.25 
 
 		 816 aa  96.3  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 		 823 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1296  FAD dependent oxidoreductase  29.59 
 
 		 401 aa  92.8  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43026  normal  0.445947 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1558  FAD dependent oxidoreductase  27.81 
 
 		 386 aa  92.4  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120445  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  29.61 
 
 		 399 aa  91.3  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2112  FAD dependent oxidoreductase  26.34 
 
 		 392 aa  90.1  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0850914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1024  FAD dependent oxidoreductase  26.47 
 
 		 403 aa  88.2  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000324501  unclonable  1.04901e-22 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0798  glycine cleavage system T protein  29.37 
 
 		 822 aa  88.2  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4985  FAD dependent oxidoreductase  28.85 
 
 		 398 aa  86.7  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1461  FAD dependent oxidoreductase  25.94 
 
 		 416 aa  86.7  6e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.719786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4896  FAD dependent oxidoreductase  28.85 
 
 		 398 aa  86.7  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1655  FAD dependent oxidoreductase  25.5 
 
 		 415 aa  85.5  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.347417 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5264  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 398 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3492  FAD dependent oxidoreductase  29.07 
 
 		 378 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1877  FAD dependent oxidoreductase  28.8 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  27.47 
 
 		 388 aa  83.2  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4871  FAD dependent oxidoreductase  29 
 
 		 825 aa  82  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862382  normal  0.731807 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1527  FAD dependent oxidoreductase  25.07 
 
 		 416 aa  82.8  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.246642  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2246  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 378 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.721245 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3929  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 386 aa  80.5  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.371488  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5086  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 		 385 aa  80.5  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00135818  normal  0.404785 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1242  hypothetical protein  26.84 
 
 		 375 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 819 aa  79  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2063  FAD dependent oxidoreductase  27.55 
 
 		 806 aa  79  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2431  FAD dependent oxidoreductase  27.79 
 
 		 379 aa  79.3  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14010  putative amino acid oxidase  26.19 
 
 		 375 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0341908 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1686  FAD dependent oxidoreductase  31.51 
 
 		 401 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.470832  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1168  FAD dependent oxidoreductase  23.14 
 
 		 372 aa  75.9  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.754644  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2198  FAD dependent oxidoreductase  27.58 
 
 		 815 aa  75.9  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138151  normal  0.0335767 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0222  FAD dependent oxidoreductase  26.02 
 
 		 365 aa  75.1  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000376254  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3567  FAD dependent oxidoreductase  27.44 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.397516 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  25.45 
 
 		 799 aa  74.7  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  27.18 
 
 		 374 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4841  FAD dependent oxidoreductase  26.24 
 
 		 400 aa  74.3  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3310  FAD dependent oxidoreductase  26.56 
 
 		 816 aa  74.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1481  FAD dependent oxidoreductase  26.46 
 
 		 801 aa  73.6  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2197  FAD dependent oxidoreductase  23.94 
 
 		 815 aa  73.6  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.031847 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1837  FAD dependent oxidoreductase  27.02 
 
 		 381 aa  73.6  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0926  FAD dependent oxidoreductase  26.18 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5513  FAD dependent oxidoreductase  26.8 
 
 		 398 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225549 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3311  FAD dependent oxidoreductase  25.25 
 
 		 817 aa  72.8  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1468  FAD dependent oxidoreductase  26.99 
 
 		 375 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.998705 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3838  FAD dependent oxidoreductase  30.52 
 
 		 827 aa  72.8  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761233  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2008  FAD dependent oxidoreductase  25.89 
 
 		 373 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4916  FAD dependent oxidoreductase  26.04 
 
 		 815 aa  70.9  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 385 aa  70.5  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>