270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1527 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1527  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
416 aa  834    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.246642  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1461  FAD dependent oxidoreductase  75.72 
 
 
416 aa  635    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.719786  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1024  FAD dependent oxidoreductase  76.67 
 
 
403 aa  655    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000324501  unclonable  1.04901e-22 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1655  FAD dependent oxidoreductase  74.28 
 
 
415 aa  631  1e-180  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.347417 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  30.34 
 
 
378 aa  117  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2862  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  29.6 
 
 
394 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1431  FAD dependent oxidoreductase  28.86 
 
 
394 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0107924 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  27.55 
 
 
385 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3496  FAD dependent oxidoreductase  27.38 
 
 
405 aa  107  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0177627 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  29.82 
 
 
385 aa  104  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  28.39 
 
 
378 aa  100  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3229  FAD dependent oxidoreductase  28.89 
 
 
391 aa  96.3  8e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267382  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  27.21 
 
 
385 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  27.51 
 
 
386 aa  95.5  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 
385 aa  90.1  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2577  putative FAD dependent oxidoreductase  26.6 
 
 
390 aa  89  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.119285 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  24.82 
 
 
390 aa  87.8  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0222  FAD dependent oxidoreductase  24.52 
 
 
365 aa  84.7  0.000000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000376254  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  24.76 
 
 
381 aa  84.3  0.000000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  24.57 
 
 
382 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2070  FAD dependent oxidoreductase  24.38 
 
 
392 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  26.3 
 
 
392 aa  82  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4757  FAD dependent oxidoreductase  26.68 
 
 
390 aa  82  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2994  FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 
390 aa  81.6  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 
388 aa  81.3  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3417  FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 
390 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6595  FAD dependent oxidoreductase  26.13 
 
 
390 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.0778916 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5250  FAD dependent oxidoreductase  26.36 
 
 
390 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 
383 aa  79  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3293  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 
385 aa  79.7  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02147  hypothetical protein  26.45 
 
 
398 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3340  FAD dependent oxidoreductase  26.2 
 
 
387 aa  78.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0285888  normal  0.210627 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  26.54 
 
 
500 aa  77  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  25.8 
 
 
394 aa  77.4  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  26.54 
 
 
500 aa  76.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2677  FAD dependent oxidoreductase  25.59 
 
 
390 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  24.05 
 
 
382 aa  75.5  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  26.54 
 
 
496 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  25.43 
 
 
394 aa  73.9  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3884  FAD dependent oxidoreductase  24.67 
 
 
390 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303875  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4046  FAD dependent oxidoreductase  25.78 
 
 
390 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1418  FAD dependent oxidoreductase  25.67 
 
 
381 aa  72.8  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2867  oxidoreductase, FAD-binding family protein  24.64 
 
 
418 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2808  oxidoreductase, FAD-binding family protein  24.61 
 
 
390 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 
394 aa  71.6  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  25.18 
 
 
395 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3475  FAD dependent oxidoreductase  25.78 
 
 
390 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5151  FAD dependent oxidoreductase  24.81 
 
 
390 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.836539  normal  0.719535 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2748  oxidoreductase, FAD-binding family protein  24.54 
 
 
390 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.252588  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0571  oxidoreductase, FAD-binding family protein  24.58 
 
 
418 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1757  oxidoreductase, FAD-binding family protein  24.34 
 
 
390 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283784  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2435  oxidoreductase, FAD-binding family protein  24.34 
 
 
390 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0467125  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1760  oxidoreductase, FAD-binding family protein  25.26 
 
 
390 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0926  FAD dependent oxidoreductase  25.9 
 
 
393 aa  69.3  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2845  oxidoreductase, FAD-binding family protein  24.58 
 
 
433 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2246  FAD dependent oxidoreductase  25.56 
 
 
378 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.721245 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  25.19 
 
 
492 aa  67.8  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4896  FAD dependent oxidoreductase  31.28 
 
 
398 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2476  FAD dependent oxidoreductase  23.57 
 
 
430 aa  67  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.326489  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4985  FAD dependent oxidoreductase  31.28 
 
 
398 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3492  FAD dependent oxidoreductase  25.44 
 
 
378 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1296  FAD dependent oxidoreductase  24.54 
 
 
401 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43026  normal  0.445947 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  24.81 
 
 
399 aa  65.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1877  FAD dependent oxidoreductase  25.06 
 
 
378 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5264  FAD dependent oxidoreductase  31.28 
 
 
398 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2431  FAD dependent oxidoreductase  25.71 
 
 
379 aa  64.3  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2192  FAD dependent oxidoreductase  24.34 
 
 
375 aa  63.5  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2112  FAD dependent oxidoreductase  24.23 
 
 
392 aa  63.5  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0850914  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1242  hypothetical protein  25.95 
 
 
375 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14010  putative amino acid oxidase  25.26 
 
 
375 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0341908 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  25.19 
 
 
378 aa  62.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  24.93 
 
 
385 aa  62  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3375  sarcosine oxidase beta subunit family protein  23.54 
 
 
416 aa  60.5  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.480932 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0798  glycine cleavage system T protein  29.96 
 
 
822 aa  60.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  21.49 
 
 
402 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5112  FAD dependent oxidoreductase  26.01 
 
 
806 aa  59.3  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0323529 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  23 
 
 
376 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0935  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 
376 aa  58.5  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.311284  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2625  FAD dependent oxidoreductase  31.5 
 
 
393 aa  58.2  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0620146  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  23.62 
 
 
404 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  21.49 
 
 
402 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3929  FAD dependent oxidoreductase  24.16 
 
 
386 aa  57.4  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.371488  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1985  FAD dependent oxidoreductase  24.55 
 
 
387 aa  57.8  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.886969  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4909  sarcosine oxidase beta subunit family protein  23.66 
 
 
416 aa  57.4  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.315195 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1558  FAD dependent oxidoreductase  23.3 
 
 
386 aa  57  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120445  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2063  FAD dependent oxidoreductase  25.55 
 
 
806 aa  57  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0469  hydroxyglutarate oxidase  27.86 
 
 
406 aa  57  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2121  hydroxyglutarate oxidase  27.86 
 
 
396 aa  56.6  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.110879  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2488  FAD dependent oxidoreductase  25.78 
 
 
806 aa  56.6  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.255163  normal  0.0203493 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1168  FAD dependent oxidoreductase  25.53 
 
 
372 aa  56.6  0.0000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.754644  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  27.71 
 
 
392 aa  55.8  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1426  FAD dependent oxidoreductase  24.06 
 
 
805 aa  55.8  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0785769 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2390  hydroxyglutarate oxidase  26.77 
 
 
396 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0316475  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1244  FAD dependent oxidoreductase  22.25 
 
 
479 aa  55.5  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1686  FAD dependent oxidoreductase  30.1 
 
 
401 aa  55.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.470832  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2315  FAD dependent oxidoreductase  24.16 
 
 
390 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3133  FAD dependent oxidoreductase  24.48 
 
 
407 aa  55.5  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3567  FAD dependent oxidoreductase  23.92 
 
 
381 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.397516 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  24.9 
 
 
396 aa  55.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39720  putative amino acid oxidase  25.24 
 
 
466 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>