More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2994 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2994  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 390 aa  791    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02147  hypothetical protein  71.35 
 
 		 398 aa  521  1e-146  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4757  FAD dependent oxidoreductase  60.26 
 
 		 390 aa  432  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2867  oxidoreductase, FAD-binding family protein  57.74 
 
 		 418 aa  418  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2808  oxidoreductase, FAD-binding family protein  57.74 
 
 		 390 aa  418  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0571  oxidoreductase, FAD-binding family protein  57.26 
 
 		 418 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2748  oxidoreductase, FAD-binding family protein  57.52 
 
 		 390 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.252588  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1757  oxidoreductase, FAD-binding family protein  57.26 
 
 		 390 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283784  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1760  oxidoreductase, FAD-binding family protein  56.73 
 
 		 390 aa  411  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3229  FAD dependent oxidoreductase  50.65 
 
 		 391 aa  414  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267382  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2435  oxidoreductase, FAD-binding family protein  57.26 
 
 		 390 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0467125  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2577  putative FAD dependent oxidoreductase  56.38 
 
 		 390 aa  414  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.119285 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2845  oxidoreductase, FAD-binding family protein  57.26 
 
 		 433 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6595  FAD dependent oxidoreductase  55.32 
 
 		 390 aa  409  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.0778916 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3884  FAD dependent oxidoreductase  56.12 
 
 		 390 aa  403  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3417  FAD dependent oxidoreductase  55.05 
 
 		 390 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5151  FAD dependent oxidoreductase  55.59 
 
 		 390 aa  396  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.836539  normal  0.719535 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5250  FAD dependent oxidoreductase  55.05 
 
 		 390 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2677  FAD dependent oxidoreductase  53.99 
 
 		 390 aa  388  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2070  FAD dependent oxidoreductase  53.32 
 
 		 392 aa  388  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4046  FAD dependent oxidoreductase  53.99 
 
 		 390 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3475  FAD dependent oxidoreductase  53.99 
 
 		 390 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2862  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  42.31 
 
 		 394 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1431  FAD dependent oxidoreductase  41.54 
 
 		 394 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0107924 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3496  FAD dependent oxidoreductase  39.54 
 
 		 405 aa  292  7e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177627 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  34.73 
 
 		 385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  34.46 
 
 		 385 aa  171  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  34.09 
 
 		 385 aa  169  5e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  33.15 
 
 		 378 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  32.66 
 
 		 378 aa  154  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  27.5 
 
 		 390 aa  152  1e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3293  FAD dependent oxidoreductase  32.07 
 
 		 385 aa  149  9e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  29.7 
 
 		 385 aa  149  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  30.73 
 
 		 378 aa  139  7.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  30.37 
 
 		 386 aa  137  4e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  30.19 
 
 		 388 aa  130  6e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  26.32 
 
 		 373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  32.26 
 
 		 392 aa  109  6e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  26.79 
 
 		 382 aa  109  8.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  30.81 
 
 		 388 aa  109  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  27 
 
 		 395 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  30.16 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 		 395 aa  107  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 		 383 aa  107  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1296  FAD dependent oxidoreductase  29.54 
 
 		 401 aa  107  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43026  normal  0.445947 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  26.14 
 
 		 382 aa  106  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  28.3 
 
 		 394 aa  105  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1024  FAD dependent oxidoreductase  28.53 
 
 		 403 aa  105  1e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000324501  unclonable  1.04901e-22 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1655  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 415 aa  104  2e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.347417 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 		 394 aa  102  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5264  FAD dependent oxidoreductase  30.41 
 
 		 398 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5513  FAD dependent oxidoreductase  30.33 
 
 		 398 aa  100  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225549 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4896  FAD dependent oxidoreductase  30.12 
 
 		 398 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4985  FAD dependent oxidoreductase  30.12 
 
 		 398 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1461  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 		 416 aa  99.8  7e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.719786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  27.88 
 
 		 394 aa  98.6  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  28.79 
 
 		 376 aa  97.8  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  26.1 
 
 		 385 aa  96.7  6e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4871  FAD dependent oxidoreductase  30.03 
 
 		 825 aa  95.1  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862382  normal  0.731807 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2112  FAD dependent oxidoreductase  27.79 
 
 		 392 aa  94.4  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0850914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1527  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 		 416 aa  92  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.246642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0222  FAD dependent oxidoreductase  26.21 
 
 		 365 aa  90.9  4e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000376254  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  26.03 
 
 		 823 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  24.14 
 
 		 381 aa  89.4  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0798  glycine cleavage system T protein  29.14 
 
 		 822 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  25.54 
 
 		 500 aa  84.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  25.27 
 
 		 500 aa  83.6  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  25.27 
 
 		 496 aa  83.6  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  26.44 
 
 		 819 aa  82.4  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  25.7 
 
 		 374 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  25.95 
 
 		 394 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  27.2 
 
 		 389 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2591  FAD dependent oxidoreductase  28.22 
 
 		 826 aa  79.7  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1168  FAD dependent oxidoreductase  22.19 
 
 		 372 aa  78.6  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.754644  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  24.66 
 
 		 799 aa  78.6  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2063  FAD dependent oxidoreductase  26.82 
 
 		 806 aa  78.6  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  27.1 
 
 		 389 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  26.65 
 
 		 492 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2488  FAD dependent oxidoreductase  26.53 
 
 		 806 aa  77  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.255163  normal  0.0203493 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1985  FAD dependent oxidoreductase  27.4 
 
 		 387 aa  76.6  0.0000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.886969  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6585  FAD dependent oxidoreductase  27.75 
 
 		 389 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3311  FAD dependent oxidoreductase  25.73 
 
 		 817 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  26.4 
 
 		 378 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0642  FAD dependent oxidoreductase  25.53 
 
 		 815 aa  74.3  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2246  FAD dependent oxidoreductase  27.85 
 
 		 378 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.721245 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3310  FAD dependent oxidoreductase  25.49 
 
 		 816 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  26.72 
 
 		 816 aa  72.8  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1686  FAD dependent oxidoreductase  26.02 
 
 		 401 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.470832  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3492  FAD dependent oxidoreductase  26.76 
 
 		 378 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4841  FAD dependent oxidoreductase  25.89 
 
 		 400 aa  72  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  25.75 
 
 		 816 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4985  FAD dependent oxidoreductase  27.3 
 
 		 831 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0450258 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4916  FAD dependent oxidoreductase  25.33 
 
 		 815 aa  70.9  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  24.63 
 
 		 983 aa  70.5  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  26.22 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3866  FAD dependent oxidoreductase  26.17 
 
 		 843 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  25.32 
 
 		 378 aa  70.1  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  25.27 
 
 		 369 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1481  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 		 801 aa  69.7  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1666  dehydrogenase  27.96 
 
 		 831 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0839495 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>