More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_2808 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_1757  oxidoreductase, FAD-binding family protein  99.49 
 
 
390 aa  780    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283784  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0571  oxidoreductase, FAD-binding family protein  99.49 
 
 
418 aa  779    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2867  oxidoreductase, FAD-binding family protein  100 
 
 
418 aa  781    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2748  oxidoreductase, FAD-binding family protein  99.49 
 
 
390 aa  780    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.252588  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1760  oxidoreductase, FAD-binding family protein  93.59 
 
 
390 aa  698    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2435  oxidoreductase, FAD-binding family protein  99.49 
 
 
390 aa  780    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0467125  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2808  oxidoreductase, FAD-binding family protein  100 
 
 
390 aa  781    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2845  oxidoreductase, FAD-binding family protein  99.49 
 
 
433 aa  778    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6595  FAD dependent oxidoreductase  76.67 
 
 
390 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.0778916 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2577  putative FAD dependent oxidoreductase  76.41 
 
 
390 aa  559  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.119285 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3884  FAD dependent oxidoreductase  76.41 
 
 
390 aa  546  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303875  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5151  FAD dependent oxidoreductase  74.8 
 
 
390 aa  543  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.836539  normal  0.719535 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3417  FAD dependent oxidoreductase  75.07 
 
 
390 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5250  FAD dependent oxidoreductase  75.34 
 
 
390 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2677  FAD dependent oxidoreductase  74.26 
 
 
390 aa  532  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4046  FAD dependent oxidoreductase  74.53 
 
 
390 aa  531  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3475  FAD dependent oxidoreductase  74.8 
 
 
390 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02147  hypothetical protein  59.31 
 
 
398 aa  426  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4757  FAD dependent oxidoreductase  59.74 
 
 
390 aa  426  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2994  FAD dependent oxidoreductase  57.69 
 
 
390 aa  415  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3229  FAD dependent oxidoreductase  49.61 
 
 
391 aa  403  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267382  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2070  FAD dependent oxidoreductase  52.25 
 
 
392 aa  369  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2862  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  48.72 
 
 
394 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1431  FAD dependent oxidoreductase  47.96 
 
 
394 aa  340  2e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0107924 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3496  FAD dependent oxidoreductase  39.95 
 
 
405 aa  301  1e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0177627 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  34.68 
 
 
385 aa  188  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  34.64 
 
 
385 aa  178  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  35.06 
 
 
385 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  32 
 
 
385 aa  157  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  29.5 
 
 
390 aa  156  5.0000000000000005e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  32.83 
 
 
378 aa  154  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3293  FAD dependent oxidoreductase  36.39 
 
 
385 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  32.25 
 
 
383 aa  150  3e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  32.81 
 
 
386 aa  143  7e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  30.85 
 
 
378 aa  140  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 
373 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  32.2 
 
 
378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  32.8 
 
 
392 aa  126  7e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  27.48 
 
 
382 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 
382 aa  119  7e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  31.79 
 
 
388 aa  118  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  31.65 
 
 
388 aa  114  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  31.54 
 
 
399 aa  112  8.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2112  FAD dependent oxidoreductase  30.13 
 
 
392 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0850914  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1296  FAD dependent oxidoreductase  29.19 
 
 
401 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43026  normal  0.445947 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  29.49 
 
 
395 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  26.4 
 
 
385 aa  108  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  30.51 
 
 
376 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  26.94 
 
 
394 aa  103  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  30.73 
 
 
500 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  30.47 
 
 
500 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  28.07 
 
 
394 aa  102  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  30.41 
 
 
496 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5513  FAD dependent oxidoreductase  29.86 
 
 
398 aa  101  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.225549 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  30.91 
 
 
492 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  26.18 
 
 
816 aa  95.9  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  27.11 
 
 
394 aa  94.4  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5264  FAD dependent oxidoreductase  27.65 
 
 
398 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4896  FAD dependent oxidoreductase  27.65 
 
 
398 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4985  FAD dependent oxidoreductase  27.65 
 
 
398 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  25.94 
 
 
816 aa  93.6  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4871  FAD dependent oxidoreductase  32.33 
 
 
825 aa  93.2  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862382  normal  0.731807 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  28.25 
 
 
378 aa  91.7  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  28.76 
 
 
389 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  25.82 
 
 
823 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  24.59 
 
 
381 aa  89.7  7e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  27.56 
 
 
389 aa  89.7  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  27.37 
 
 
385 aa  89  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2488  FAD dependent oxidoreductase  27.97 
 
 
806 aa  88.6  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.255163  normal  0.0203493 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1024  FAD dependent oxidoreductase  24.48 
 
 
403 aa  88.2  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000324501  unclonable  1.04901e-22 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1461  FAD dependent oxidoreductase  24.49 
 
 
416 aa  85.5  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.719786  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1655  FAD dependent oxidoreductase  25.18 
 
 
415 aa  84.7  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.347417 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2591  FAD dependent oxidoreductase  29.9 
 
 
826 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  25.4 
 
 
799 aa  84.3  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4894  FAD dependent oxidoreductase  30.59 
 
 
397 aa  84  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4841  FAD dependent oxidoreductase  24.41 
 
 
400 aa  83.6  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2198  FAD dependent oxidoreductase  27.88 
 
 
815 aa  83.2  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138151  normal  0.0335767 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  26.16 
 
 
378 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0222  FAD dependent oxidoreductase  23.36 
 
 
365 aa  82.8  0.000000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000376254  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  27.01 
 
 
376 aa  82.4  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1985  FAD dependent oxidoreductase  26.34 
 
 
387 aa  81.6  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.886969  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  26.73 
 
 
819 aa  80.9  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  27.18 
 
 
388 aa  78.2  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1830  SoxB protein  28.65 
 
 
377 aa  77.8  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.260331 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1527  FAD dependent oxidoreductase  24.35 
 
 
416 aa  77  0.0000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.246642  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  26.94 
 
 
377 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  28.24 
 
 
376 aa  76.6  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0798  glycine cleavage system T protein  29.44 
 
 
822 aa  76.6  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2063  FAD dependent oxidoreductase  27.23 
 
 
806 aa  77  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  28.72 
 
 
383 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  28.72 
 
 
383 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0935  FAD dependent oxidoreductase  26.59 
 
 
376 aa  76.3  0.0000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.311284  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  22.83 
 
 
395 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1877  FAD dependent oxidoreductase  27.12 
 
 
378 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  25.32 
 
 
394 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  27.54 
 
 
984 aa  74.7  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  26.44 
 
 
376 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  27.36 
 
 
391 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0926  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
393 aa  74.7  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1429  FAD dependent oxidoreductase  28.45 
 
 
383 aa  74.7  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00860523 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>