203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1461 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1461  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
416 aa  840    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.719786  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1024  FAD dependent oxidoreductase  75.19 
 
 
403 aa  647    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000324501  unclonable  1.04901e-22 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1527  FAD dependent oxidoreductase  75.72 
 
 
416 aa  632  1e-180  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.246642  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1655  FAD dependent oxidoreductase  76.2 
 
 
415 aa  630  1e-179  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.347417 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  30.5 
 
 
378 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  26.82 
 
 
385 aa  106  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2577  putative FAD dependent oxidoreductase  27.64 
 
 
390 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.119285 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2862  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  27.34 
 
 
394 aa  103  7e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1431  FAD dependent oxidoreductase  27.09 
 
 
394 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0107924 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3229  FAD dependent oxidoreductase  26.88 
 
 
391 aa  102  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267382  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6595  FAD dependent oxidoreductase  26.27 
 
 
390 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.0778916 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  28.28 
 
 
378 aa  94  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5250  FAD dependent oxidoreductase  26.94 
 
 
390 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3417  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 
390 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02147  hypothetical protein  27.99 
 
 
398 aa  89  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  26.99 
 
 
381 aa  88.6  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3884  FAD dependent oxidoreductase  26.15 
 
 
390 aa  88.2  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303875  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5151  FAD dependent oxidoreductase  25.36 
 
 
390 aa  88.2  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.836539  normal  0.719535 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4046  FAD dependent oxidoreductase  25.97 
 
 
390 aa  87.8  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  25.25 
 
 
386 aa  87.4  4e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  27.46 
 
 
385 aa  86.7  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3475  FAD dependent oxidoreductase  25.97 
 
 
390 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2994  FAD dependent oxidoreductase  27.46 
 
 
390 aa  85.1  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  26.53 
 
 
385 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2677  FAD dependent oxidoreductase  26.17 
 
 
390 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2070  FAD dependent oxidoreductase  26.01 
 
 
392 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  25.74 
 
 
394 aa  83.6  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  25.59 
 
 
388 aa  82.8  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  24.81 
 
 
395 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3496  FAD dependent oxidoreductase  22.98 
 
 
405 aa  82  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0177627 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  26.77 
 
 
392 aa  82  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  26.12 
 
 
385 aa  80.1  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  25.37 
 
 
394 aa  80.1  0.00000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  23.02 
 
 
390 aa  77.8  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  25.12 
 
 
382 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4757  FAD dependent oxidoreductase  24.62 
 
 
390 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3293  FAD dependent oxidoreductase  26.12 
 
 
385 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2808  oxidoreductase, FAD-binding family protein  24.16 
 
 
390 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2867  oxidoreductase, FAD-binding family protein  24.16 
 
 
418 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  26.11 
 
 
394 aa  73.9  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1760  oxidoreductase, FAD-binding family protein  23.83 
 
 
390 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2435  oxidoreductase, FAD-binding family protein  24.08 
 
 
390 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0467125  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2845  oxidoreductase, FAD-binding family protein  23.82 
 
 
433 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2748  oxidoreductase, FAD-binding family protein  24.74 
 
 
390 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.252588  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1757  oxidoreductase, FAD-binding family protein  24.08 
 
 
390 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283784  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0571  oxidoreductase, FAD-binding family protein  24.08 
 
 
418 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  24.5 
 
 
382 aa  70.9  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0926  FAD dependent oxidoreductase  24.23 
 
 
393 aa  70.9  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  24.87 
 
 
378 aa  69.7  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  24.39 
 
 
383 aa  69.7  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1296  FAD dependent oxidoreductase  26.29 
 
 
401 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43026  normal  0.445947 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4896  FAD dependent oxidoreductase  24.53 
 
 
398 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4985  FAD dependent oxidoreductase  24.53 
 
 
398 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3929  FAD dependent oxidoreductase  25.65 
 
 
386 aa  65.1  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.371488  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  25.56 
 
 
399 aa  64.3  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5264  FAD dependent oxidoreductase  24.26 
 
 
398 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2112  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 
392 aa  63.9  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0850914  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1686  FAD dependent oxidoreductase  25.9 
 
 
401 aa  63.9  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.470832  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1877  FAD dependent oxidoreductase  24.19 
 
 
378 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  24.58 
 
 
385 aa  62.4  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2246  FAD dependent oxidoreductase  24.31 
 
 
378 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.721245 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0222  FAD dependent oxidoreductase  22.9 
 
 
365 aa  62  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000376254  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3492  FAD dependent oxidoreductase  24.44 
 
 
378 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3340  FAD dependent oxidoreductase  22.94 
 
 
387 aa  60.5  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0285888  normal  0.210627 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1168  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 
372 aa  58.9  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.754644  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2063  FAD dependent oxidoreductase  23.25 
 
 
806 aa  58.9  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  22.36 
 
 
376 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9243  hypothetical protein  23.52 
 
 
455 aa  58.2  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.617372  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  23.82 
 
 
395 aa  58.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2192  FAD dependent oxidoreductase  24.33 
 
 
375 aa  58.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  22.84 
 
 
373 aa  57.8  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3375  sarcosine oxidase beta subunit family protein  23.6 
 
 
416 aa  57.4  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.480932 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4909  sarcosine oxidase beta subunit family protein  23.41 
 
 
416 aa  57  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.315195 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  24.01 
 
 
492 aa  57  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  24.71 
 
 
500 aa  56.6  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  24.71 
 
 
500 aa  56.6  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4107  FAD dependent oxidoreductase  30.61 
 
 
393 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0968917  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39720  putative amino acid oxidase  24.27 
 
 
466 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1558  FAD dependent oxidoreductase  24.57 
 
 
386 aa  55.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120445  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5513  FAD dependent oxidoreductase  26.02 
 
 
398 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.225549 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 
365 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2172  FAD dependent oxidoreductase  22.03 
 
 
380 aa  53.9  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3845  FAD dependent oxidoreductase  24.81 
 
 
381 aa  53.9  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2431  FAD dependent oxidoreductase  23.04 
 
 
379 aa  53.5  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2197  FAD dependent oxidoreductase  23.28 
 
 
815 aa  53.9  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.031847 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2008  FAD dependent oxidoreductase  23.63 
 
 
373 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  24.38 
 
 
496 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5112  FAD dependent oxidoreductase  24.54 
 
 
806 aa  52.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0323529 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  25.38 
 
 
365 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1272  N-methyltryptophan oxidase  24.87 
 
 
372 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  24.49 
 
 
375 aa  52  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2625  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 
393 aa  52.4  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0620146  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4036  hydroxyglutarate oxidase  22.42 
 
 
403 aa  52  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1244  FAD dependent oxidoreductase  21.83 
 
 
479 aa  51.6  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0798  glycine cleavage system T protein  28.57 
 
 
822 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0935  FAD dependent oxidoreductase  26.81 
 
 
376 aa  51.6  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.311284  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2794  hydroxyglutarate oxidase  23.86 
 
 
407 aa  50.8  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.553483  normal  0.530212 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3393  N-methyltryptophan oxidase  25.4 
 
 
381 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  25.38 
 
 
365 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2212  N-methyltryptophan oxidase  24.25 
 
 
372 aa  50.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551548  normal  0.375717 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>