More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3845 on replicon NC_013923
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013923  Nmag_3845  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
381 aa  763    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3929  FAD dependent oxidoreductase  48.14 
 
 
386 aa  355  6.999999999999999e-97  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.371488  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3849  FAD dependent oxidoreductase  38.9 
 
 
404 aa  249  8e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.121432  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3868  FAD dependent oxidoreductase  32.98 
 
 
402 aa  166  5.9999999999999996e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0943449  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  31.28 
 
 
392 aa  119  6e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  30.29 
 
 
385 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  25.53 
 
 
382 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 
385 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  28.76 
 
 
394 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  24.38 
 
 
381 aa  105  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3311  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 
817 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2197  FAD dependent oxidoreductase  27.94 
 
 
815 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.031847 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  25.93 
 
 
390 aa  101  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  25.97 
 
 
395 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  27.44 
 
 
385 aa  98.2  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  28.19 
 
 
394 aa  98.2  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  23.45 
 
 
382 aa  97.4  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  28.16 
 
 
823 aa  96.3  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  26.18 
 
 
816 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  27.3 
 
 
385 aa  94.4  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  25.92 
 
 
816 aa  93.2  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4841  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 
400 aa  92.8  9e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  27.17 
 
 
395 aa  92.8  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  26.88 
 
 
388 aa  91.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  24.56 
 
 
819 aa  91.7  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  25.94 
 
 
369 aa  90.9  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  27.81 
 
 
399 aa  91.3  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2112  FAD dependent oxidoreductase  28.37 
 
 
392 aa  90.1  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0850914  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  25.94 
 
 
369 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  29.97 
 
 
492 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  25.07 
 
 
383 aa  89  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4894  FAD dependent oxidoreductase  27.51 
 
 
397 aa  89  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  24.93 
 
 
369 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4916  FAD dependent oxidoreductase  26.82 
 
 
815 aa  88.2  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  27.52 
 
 
388 aa  88.6  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  27.11 
 
 
385 aa  87.8  3e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  27.1 
 
 
500 aa  87  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  26.83 
 
 
500 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  26.01 
 
 
386 aa  84.7  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  26.83 
 
 
496 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  25.4 
 
 
369 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  25.4 
 
 
369 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  25.53 
 
 
369 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  28.41 
 
 
401 aa  84  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  27.2 
 
 
387 aa  83.6  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  27.13 
 
 
394 aa  83.2  0.000000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  26.5 
 
 
376 aa  82.8  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  25 
 
 
369 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  24.26 
 
 
369 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5264  FAD dependent oxidoreductase  30.24 
 
 
398 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1296  FAD dependent oxidoreductase  28.78 
 
 
401 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43026  normal  0.445947 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1686  FAD dependent oxidoreductase  25.06 
 
 
401 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.470832  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  24.46 
 
 
369 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3020  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 
367 aa  80.5  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.393882  normal  0.050284 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  24.46 
 
 
369 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2625  FAD dependent oxidoreductase  28.32 
 
 
393 aa  80.5  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0620146  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  27.34 
 
 
378 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4985  FAD dependent oxidoreductase  29.84 
 
 
398 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4896  FAD dependent oxidoreductase  29.84 
 
 
398 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3866  FAD dependent oxidoreductase  26.36 
 
 
843 aa  79.3  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  25.33 
 
 
376 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0798  glycine cleavage system T protein  28.75 
 
 
822 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5513  FAD dependent oxidoreductase  30.63 
 
 
398 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.225549 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2446  putative glycine oxidase  23.1 
 
 
391 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.602268  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  28.2 
 
 
378 aa  77.4  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  25.52 
 
 
417 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  30.75 
 
 
374 aa  77  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  26.79 
 
 
382 aa  76.6  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4871  FAD dependent oxidoreductase  25.33 
 
 
825 aa  76.3  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862382  normal  0.731807 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2727  dimethylglycine dehydrogenase  25.41 
 
 
879 aa  75.5  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  27.08 
 
 
392 aa  75.9  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  27.03 
 
 
417 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  23.78 
 
 
799 aa  75.1  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  24.15 
 
 
373 aa  74.3  0.000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2591  FAD dependent oxidoreductase  26.74 
 
 
826 aa  74.3  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  28.33 
 
 
652 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2847  putative glycine oxidase  23.96 
 
 
330 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0255303  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  23.47 
 
 
369 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  26.3 
 
 
367 aa  72  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  27.39 
 
 
411 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  27.13 
 
 
405 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2595  sarcosine oxidase, beta subunit  22.55 
 
 
391 aa  72  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  30.25 
 
 
410 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  27.25 
 
 
440 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2886  putative glycine oxidase  22.28 
 
 
391 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8732  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0636  FAD dependent oxidoreductase  28.23 
 
 
433 aa  71.2  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.188486  normal  0.91294 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2560  sarcosine oxidase, beta subunit  22.28 
 
 
391 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  25.34 
 
 
363 aa  70.9  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0919  FAD dependent oxidoreductase  25.81 
 
 
837 aa  69.7  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3393  sarcosine oxidase, beta subunit family  25.19 
 
 
417 aa  69.7  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0208125  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  24.87 
 
 
379 aa  68.9  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  25.27 
 
 
383 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  26.01 
 
 
378 aa  68.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  27.31 
 
 
666 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  25.27 
 
 
383 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  26.91 
 
 
666 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0935  FAD dependent oxidoreductase  26.1 
 
 
376 aa  67.8  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.311284  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3718  FAD dependent oxidoreductase  25.48 
 
 
835 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  26.27 
 
 
386 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2638  FAD dependent oxidoreductase  22.83 
 
 
391 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.071101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>