More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6595 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2577  putative FAD dependent oxidoreductase  96.15 
 
 		 390 aa  697    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.119285 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6595  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 390 aa  801    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.0778916 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3884  FAD dependent oxidoreductase  85.79 
 
 		 390 aa  627  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5151  FAD dependent oxidoreductase  81.79 
 
 		 390 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.836539  normal  0.719535 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3475  FAD dependent oxidoreductase  81.54 
 
 		 390 aa  594  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4046  FAD dependent oxidoreductase  81.54 
 
 		 390 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2677  FAD dependent oxidoreductase  81.03 
 
 		 390 aa  592  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5250  FAD dependent oxidoreductase  81.28 
 
 		 390 aa  594  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3417  FAD dependent oxidoreductase  81.03 
 
 		 390 aa  594  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2867  oxidoreductase, FAD-binding family protein  76.67 
 
 		 418 aa  585  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2808  oxidoreductase, FAD-binding family protein  76.67 
 
 		 390 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1760  oxidoreductase, FAD-binding family protein  76.15 
 
 		 390 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0571  oxidoreductase, FAD-binding family protein  76.67 
 
 		 418 aa  578  1e-164  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2435  oxidoreductase, FAD-binding family protein  76.67 
 
 		 390 aa  577  1e-164  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0467125  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1757  oxidoreductase, FAD-binding family protein  76.67 
 
 		 390 aa  577  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283784  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2845  oxidoreductase, FAD-binding family protein  76.67 
 
 		 433 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2748  oxidoreductase, FAD-binding family protein  76.67 
 
 		 390 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.252588  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3229  FAD dependent oxidoreductase  52.97 
 
 		 391 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267382  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2994  FAD dependent oxidoreductase  57.18 
 
 		 390 aa  427  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4757  FAD dependent oxidoreductase  56.01 
 
 		 390 aa  421  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_003296  RS02147  hypothetical protein  55.59 
 
 		 398 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2070  FAD dependent oxidoreductase  52.12 
 
 		 392 aa  384  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2862  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  47.72 
 
 		 394 aa  354  2e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1431  FAD dependent oxidoreductase  46.7 
 
 		 394 aa  348  7e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0107924 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3496  FAD dependent oxidoreductase  42.07 
 
 		 405 aa  307  2.0000000000000002e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177627 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  35.79 
 
 		 385 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  37.08 
 
 		 385 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  36.91 
 
 		 385 aa  191  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  33.16 
 
 		 378 aa  169  9e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  32.58 
 
 		 385 aa  166  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3293  FAD dependent oxidoreductase  35.5 
 
 		 385 aa  163  6e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  29.85 
 
 		 390 aa  162  1e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  31.66 
 
 		 378 aa  157  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  34.28 
 
 		 386 aa  158  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  31.56 
 
 		 392 aa  135  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 		 373 aa  132  9e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  29.77 
 
 		 383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  32.21 
 
 		 388 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  31.07 
 
 		 395 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  29.19 
 
 		 382 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  30.65 
 
 		 378 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  27.09 
 
 		 382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  30.56 
 
 		 388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  28.31 
 
 		 385 aa  117  3e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  29.27 
 
 		 399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2112  FAD dependent oxidoreductase  28 
 
 		 392 aa  110  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0850914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  27.44 
 
 		 381 aa  109  8.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1461  FAD dependent oxidoreductase  26.46 
 
 		 416 aa  108  1e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.719786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  26.6 
 
 		 394 aa  108  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1024  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 403 aa  107  3e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000324501  unclonable  1.04901e-22 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  26.84 
 
 		 394 aa  106  6e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  29.23 
 
 		 376 aa  106  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1296  FAD dependent oxidoreductase  27.03 
 
 		 401 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43026  normal  0.445947 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4985  FAD dependent oxidoreductase  27.46 
 
 		 398 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4871  FAD dependent oxidoreductase  31.93 
 
 		 825 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862382  normal  0.731807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4896  FAD dependent oxidoreductase  27.46 
 
 		 398 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5264  FAD dependent oxidoreductase  27.46 
 
 		 398 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  28.76 
 
 		 500 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  28.76 
 
 		 496 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1655  FAD dependent oxidoreductase  25.54 
 
 		 415 aa  99.8  7e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.347417 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  28.49 
 
 		 500 aa  99.8  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1985  FAD dependent oxidoreductase  27.75 
 
 		 387 aa  98.6  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.886969  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  27.23 
 
 		 394 aa  98.6  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5513  FAD dependent oxidoreductase  27.2 
 
 		 398 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225549 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  25.86 
 
 		 389 aa  96.7  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  25.53 
 
 		 816 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  28.39 
 
 		 823 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  25.74 
 
 		 816 aa  94.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3469  FAD dependent oxidoreductase  25.85 
 
 		 835 aa  93.6  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  28.84 
 
 		 492 aa  93.6  6e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4053  FAD dependent oxidoreductase  30.42 
 
 		 389 aa  93.6  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  27.2 
 
 		 819 aa  93.2  7e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  26.03 
 
 		 389 aa  92.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3492  FAD dependent oxidoreductase  27.6 
 
 		 378 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2431  FAD dependent oxidoreductase  28.01 
 
 		 379 aa  92  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1877  FAD dependent oxidoreductase  27.87 
 
 		 378 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1527  FAD dependent oxidoreductase  27.06 
 
 		 416 aa  91.3  3e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.246642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  25.67 
 
 		 799 aa  90.1  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  26.63 
 
 		 378 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5086  FAD dependent oxidoreductase  26.16 
 
 		 385 aa  90.1  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00135818  normal  0.404785 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1837  FAD dependent oxidoreductase  29.23 
 
 		 381 aa  89.4  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  26.94 
 
 		 394 aa  89.7  9e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  27.39 
 
 		 378 aa  89.4  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1558  FAD dependent oxidoreductase  26.72 
 
 		 386 aa  89.4  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120445  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2246  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 		 378 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.721245 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2591  FAD dependent oxidoreductase  28.77 
 
 		 826 aa  87.8  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4841  FAD dependent oxidoreductase  24.27 
 
 		 400 aa  87.8  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  28.97 
 
 		 374 aa  87.8  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0762  FAD dependent oxidoreductase  29.27 
 
 		 812 aa  87  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2198  FAD dependent oxidoreductase  27.5 
 
 		 815 aa  87  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138151  normal  0.0335767 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0222  FAD dependent oxidoreductase  26.46 
 
 		 365 aa  87  5e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000376254  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  26.72 
 
 		 385 aa  86.7  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1168  FAD dependent oxidoreductase  23.41 
 
 		 372 aa  85.9  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.754644  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  27.61 
 
 		 983 aa  85.9  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  24.13 
 
 		 395 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1830  SoxB protein  28.21 
 
 		 377 aa  85.1  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.260331 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3310  FAD dependent oxidoreductase  26.96 
 
 		 816 aa  84.7  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4985  FAD dependent oxidoreductase  27 
 
 		 831 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0450258 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3225  hypothetical protein  27.61 
 
 		 368 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3246  FAD dependent oxidoreductase  28.8 
 
 		 368 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.548374  normal  0.597493 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>