More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02147 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02147  hypothetical protein  100 
 
 		 398 aa  811    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2994  FAD dependent oxidoreductase  71.58 
 
 		 390 aa  525  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2867  oxidoreductase, FAD-binding family protein  59.52 
 
 		 418 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2808  oxidoreductase, FAD-binding family protein  59.52 
 
 		 390 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0571  oxidoreductase, FAD-binding family protein  59.04 
 
 		 418 aa  428  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1757  oxidoreductase, FAD-binding family protein  59.04 
 
 		 390 aa  428  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283784  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1760  oxidoreductase, FAD-binding family protein  59.57 
 
 		 390 aa  431  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2435  oxidoreductase, FAD-binding family protein  59.04 
 
 		 390 aa  428  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0467125  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2748  oxidoreductase, FAD-binding family protein  59.31 
 
 		 390 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.252588  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2845  oxidoreductase, FAD-binding family protein  59.04 
 
 		 433 aa  428  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4757  FAD dependent oxidoreductase  59.84 
 
 		 390 aa  425  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3229  FAD dependent oxidoreductase  49.87 
 
 		 391 aa  403  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267382  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3417  FAD dependent oxidoreductase  54.96 
 
 		 390 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2577  putative FAD dependent oxidoreductase  54.69 
 
 		 390 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.119285 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6595  FAD dependent oxidoreductase  54.16 
 
 		 390 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.0778916 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5250  FAD dependent oxidoreductase  54.96 
 
 		 390 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3884  FAD dependent oxidoreductase  55.5 
 
 		 390 aa  393  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5151  FAD dependent oxidoreductase  55.5 
 
 		 390 aa  394  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.836539  normal  0.719535 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2677  FAD dependent oxidoreductase  53.62 
 
 		 390 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4046  FAD dependent oxidoreductase  54.16 
 
 		 390 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3475  FAD dependent oxidoreductase  54.42 
 
 		 390 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2070  FAD dependent oxidoreductase  54.82 
 
 		 392 aa  384  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2862  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  45.13 
 
 		 394 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1431  FAD dependent oxidoreductase  43.85 
 
 		 394 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0107924 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3496  FAD dependent oxidoreductase  42.75 
 
 		 405 aa  308  8e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177627 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  34.26 
 
 		 385 aa  179  9e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  34.08 
 
 		 385 aa  169  9e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  33.75 
 
 		 385 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  32.41 
 
 		 385 aa  162  9e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  28.82 
 
 		 390 aa  153  5.9999999999999996e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 378 aa  152  8e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3293  FAD dependent oxidoreductase  33.15 
 
 		 385 aa  137  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  31.41 
 
 		 378 aa  137  4e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  28.88 
 
 		 373 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  30.75 
 
 		 378 aa  133  6e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  29.97 
 
 		 386 aa  129  8.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  29.27 
 
 		 388 aa  124  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  29.97 
 
 		 392 aa  120  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  27.89 
 
 		 382 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  28.96 
 
 		 394 aa  116  6.9999999999999995e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  27 
 
 		 394 aa  111  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  27.22 
 
 		 394 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  25.81 
 
 		 382 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1296  FAD dependent oxidoreductase  31.43 
 
 		 401 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43026  normal  0.445947 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  30.52 
 
 		 399 aa  106  6e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  24.18 
 
 		 395 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  29.37 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1461  FAD dependent oxidoreductase  27.39 
 
 		 416 aa  101  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.719786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  27.4 
 
 		 395 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  25.08 
 
 		 385 aa  100  6e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5513  FAD dependent oxidoreductase  31.07 
 
 		 398 aa  99.4  9e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225549 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  26.98 
 
 		 383 aa  98.6  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1024  FAD dependent oxidoreductase  26.51 
 
 		 403 aa  96.3  8e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000324501  unclonable  1.04901e-22 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  27.54 
 
 		 823 aa  96.3  9e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4985  FAD dependent oxidoreductase  26.78 
 
 		 398 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 		 388 aa  94.7  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4896  FAD dependent oxidoreductase  26.78 
 
 		 398 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5264  FAD dependent oxidoreductase  26.5 
 
 		 398 aa  93.6  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1655  FAD dependent oxidoreductase  25.67 
 
 		 415 aa  90.1  6e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.347417 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1527  FAD dependent oxidoreductase  26.45 
 
 		 416 aa  87.8  3e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.246642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0222  FAD dependent oxidoreductase  25.64 
 
 		 365 aa  88.2  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000376254  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2112  FAD dependent oxidoreductase  26.82 
 
 		 392 aa  85.9  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0850914  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1168  FAD dependent oxidoreductase  22.8 
 
 		 372 aa  84.3  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.754644  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 		 500 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 		 500 aa  83.6  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  26.98 
 
 		 496 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  23.51 
 
 		 381 aa  82.4  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3340  FAD dependent oxidoreductase  29.32 
 
 		 387 aa  79  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0285888  normal  0.210627 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  26.37 
 
 		 816 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1985  FAD dependent oxidoreductase  26.09 
 
 		 387 aa  78.2  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.886969  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2063  FAD dependent oxidoreductase  28.19 
 
 		 806 aa  79  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4871  FAD dependent oxidoreductase  27.17 
 
 		 825 aa  78.2  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862382  normal  0.731807 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  25.33 
 
 		 394 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0926  FAD dependent oxidoreductase  25.94 
 
 		 393 aa  75.5  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  25.99 
 
 		 376 aa  75.5  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  25.46 
 
 		 816 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1666  dehydrogenase  25.14 
 
 		 831 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0839495 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3246  FAD dependent oxidoreductase  27.81 
 
 		 368 aa  74.3  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.548374  normal  0.597493 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3563  putative FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase protein  27.54 
 
 		 368 aa  73.2  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0935  FAD dependent oxidoreductase  27.22 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.311284  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  25.07 
 
 		 377 aa  72.8  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2591  FAD dependent oxidoreductase  23.98 
 
 		 826 aa  72.4  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  25.19 
 
 		 374 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2431  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 379 aa  72.4  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  24.93 
 
 		 385 aa  72  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4841  FAD dependent oxidoreductase  24.54 
 
 		 400 aa  72  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1877  FAD dependent oxidoreductase  25.74 
 
 		 378 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  25.98 
 
 		 389 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 		 492 aa  70.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4985  FAD dependent oxidoreductase  26.38 
 
 		 831 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0450258 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3492  FAD dependent oxidoreductase  25.47 
 
 		 378 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0798  glycine cleavage system T protein  26.88 
 
 		 822 aa  70.5  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 378 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1686  FAD dependent oxidoreductase  25.19 
 
 		 401 aa  69.7  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.470832  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3225  hypothetical protein  24.8 
 
 		 368 aa  69.7  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  25.94 
 
 		 383 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3849  FAD dependent oxidoreductase  26.54 
 
 		 404 aa  69.3  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.121432  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1558  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 386 aa  68.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120445  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  24.54 
 
 		 378 aa  68.6  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0512  sarcosine oxidase beta subunit family protein  23.72 
 
 		 423 aa  68.6  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>