53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9243 on replicon NC_011984
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011984  Avi_9243  hypothetical protein  100 
 
 		 455 aa  939    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.617372  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2412  FAD dependent oxidoreductase  40.05 
 
 		 456 aa  315  9e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0154  FAD dependent oxidoreductase  40.55 
 
 		 452 aa  305  9.000000000000001e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0436  FAD dependent oxidoreductase  40.93 
 
 		 456 aa  293  5e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0964  FAD dependent oxidoreductase  38.73 
 
 		 449 aa  285  9e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.300235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  24.16 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2112  FAD dependent oxidoreductase  22.86 
 
 		 392 aa  60.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0850914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3496  FAD dependent oxidoreductase  23.67 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177627 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  21.78 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2198  FAD dependent oxidoreductase  22.25 
 
 		 815 aa  55.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138151  normal  0.0335767 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  24.65 
 
 		 385 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2862  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  22.92 
 
 		 394 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  23.02 
 
 		 383 aa  52.8  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1431  FAD dependent oxidoreductase  22.59 
 
 		 394 aa  51.2  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0107924 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  23.94 
 
 		 385 aa  50.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3310  FAD dependent oxidoreductase  21.4 
 
 		 816 aa  50.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1461  FAD dependent oxidoreductase  23.53 
 
 		 416 aa  49.7  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.719786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1760  oxidoreductase, FAD-binding family protein  32.06 
 
 		 390 aa  49.7  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5914  FAD dependent oxidoreductase  24.56 
 
 		 413 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2727  dimethylglycine dehydrogenase  23.81 
 
 		 879 aa  49.3  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0880  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 486 aa  48.5  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0512  sarcosine oxidase beta subunit family protein  22.85 
 
 		 423 aa  48.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0969  sarcosine oxidase beta subunit family protein  33.33 
 
 		 431 aa  48.5  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1324  FAD dependent oxidoreductase  24.14 
 
 		 375 aa  47.4  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2845  oxidoreductase, FAD-binding family protein  33.33 
 
 		 433 aa  47  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0571  oxidoreductase, FAD-binding family protein  33.33 
 
 		 418 aa  47  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  26.1 
 
 		 388 aa  47.4  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2435  oxidoreductase, FAD-binding family protein  33.33 
 
 		 390 aa  47  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0467125  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1757  oxidoreductase, FAD-binding family protein  33.33 
 
 		 390 aa  47  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283784  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2748  oxidoreductase, FAD-binding family protein  33.33 
 
 		 390 aa  47  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.252588  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2867  oxidoreductase, FAD-binding family protein  33.33 
 
 		 418 aa  47  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2808  oxidoreductase, FAD-binding family protein  33.33 
 
 		 390 aa  47  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5250  FAD dependent oxidoreductase  28.78 
 
 		 390 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2558  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  21.12 
 
 		 476 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2875  FAD-dependent oxidoreductase  21.12 
 
 		 476 aa  46.6  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3417  FAD dependent oxidoreductase  28.78 
 
 		 390 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4843  FAD dependent oxidoreductase  24.41 
 
 		 416 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570392  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1877  sarcosine oxidase beta subunit family protein  23.62 
 
 		 415 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294016  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2454  D-amino acid dehydrogenase small subunit  22.46 
 
 		 371 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295637  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1344  sarcosine oxidase beta subunit family protein  30.53 
 
 		 415 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0947006  normal  0.025984 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2183  sarcosine oxidase beta subunit family protein  31.58 
 
 		 414 aa  44.7  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.409819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2686  putative sarcosine oxidase beta subunit  30.53 
 
 		 415 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0604356  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2489  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  22.1 
 
 		 371 aa  44.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000926626  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  26.44 
 
 		 381 aa  44.7  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1481  FAD dependent oxidoreductase  24 
 
 		 801 aa  43.9  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  20 
 
 		 382 aa  43.9  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2728  oxidoreductase, DadA family  22.26 
 
 		 371 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000981681 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2742  DadA family oxidoreductase  22.46 
 
 		 371 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00153462  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1694  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 412 aa  43.5  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2063  FAD dependent oxidoreductase  21.3 
 
 		 806 aa  43.5  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2715  DadA family oxidoreductase  22.26 
 
 		 371 aa  43.5  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2529  DadA family oxidoreductase  22.26 
 
 		 371 aa  43.5  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0933493  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  22.1 
 
 		 376 aa  43.1  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>