More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2558 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2875  FAD-dependent oxidoreductase  99.16 
 
 		 476 aa  951    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2558  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  100 
 
 		 476 aa  957    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1628  FAD dependent oxidoreductase  53.25 
 
 		 478 aa  521  1e-146  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.855011  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1021  FAD dependent oxidoreductase  52.19 
 
 		 500 aa  485  1e-136  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1244  FAD dependent oxidoreductase  50.21 
 
 		 479 aa  460  9.999999999999999e-129  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2643  oxidoreductase, FAD-dependent  47.63 
 
 		 489 aa  450  1e-125  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.292986  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0320  FAD dependent oxidoreductase  47.3 
 
 		 485 aa  440  9.999999999999999e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0930  FAD dependent oxidoreductase  48.64 
 
 		 479 aa  426  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0776869  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0411  oxidoreductase, FAD-binding  47.37 
 
 		 473 aa  415  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0546468  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0021  FAD dependent oxidoreductase  46.35 
 
 		 484 aa  410  1e-113  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0147629  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06270  predicted dehydrogenase  43.95 
 
 		 511 aa  409  1e-113  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1552  FAD dependent oxidoreductase  42.74 
 
 		 494 aa  404  1e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.374477  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08100  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  43.79 
 
 		 503 aa  400  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242125  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0683  FAD dependent oxidoreductase  43.4 
 
 		 496 aa  394  1e-108  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.302039  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1237  FAD dependent oxidoreductase  42.74 
 
 		 965 aa  393  1e-108  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.18893  normal  0.393596 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0620  FAD dependent oxidoreductase  45.3 
 
 		 478 aa  389  1e-107  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1490  FAD dependent oxidoreductase  44.96 
 
 		 473 aa  383  1e-105  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0697  FAD dependent oxidoreductase  42.5 
 
 		 480 aa  377  1e-103  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0293  FAD dependent oxidoreductase  43.4 
 
 		 491 aa  372  1e-101  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000524606  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1324  FAD dependent oxidoreductase  44.12 
 
 		 479 aa  370  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00260762  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1362  FAD dependent oxidoreductase  44.03 
 
 		 479 aa  370  1e-101  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1532  FAD dependent oxidoreductase  40.86 
 
 		 493 aa  347  3e-94  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0283  FAD dependent oxidoreductase  40.5 
 
 		 475 aa  332  8e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3394  FAD dependent oxidoreductase  38.93 
 
 		 576 aa  323  4e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.513559  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0134  oxidoreductase, FAD-dependent  36.59 
 
 		 508 aa  298  1e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00168414  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7847  oxidoreductase, FAD-binding protein  35.22 
 
 		 472 aa  293  5e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3539  FAD dependent oxidoreductase  32.18 
 
 		 470 aa  266  8.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3534  FAD dependent oxidoreductase  31.75 
 
 		 473 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0951864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3607  FAD dependent oxidoreductase  31.75 
 
 		 473 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2649  FAD dependent oxidoreductase  31.86 
 
 		 465 aa  257  3e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3930  FAD dependent oxidoreductase  31.64 
 
 		 461 aa  257  4e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.130124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0219  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, putative  38.86 
 
 		 387 aa  229  6e-59  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1678  FAD dependent oxidoreductase  30.32 
 
 		 464 aa  223  7e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0012  FAD-dependent oxidoreductase  29.85 
 
 		 464 aa  203  4e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0012  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  29.85 
 
 		 464 aa  202  8e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1375  FAD dependent oxidoreductase  30.67 
 
 		 461 aa  192  1e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.575431  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38067  predicted protein  36.16 
 
 		 698 aa  187  4e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00714206  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2696  FAD dependent oxidoreductase  28.44 
 
 		 465 aa  187  5e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0111401  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45170  putative oxidoreductase  28.17 
 
 		 396 aa  167  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.381756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  32.23 
 
 		 409 aa  143  5e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6841  NAD binding site FAD dependent oxidoreductase  29.2 
 
 		 367 aa  143  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50137  predicted protein  29.1 
 
 		 437 aa  142  9.999999999999999e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.563801  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2794  hydroxyglutarate oxidase  32.27 
 
 		 407 aa  139  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.553483  normal  0.530212 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  31.29 
 
 		 402 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  31.29 
 
 		 402 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2799  FAD dependent oxidoreductase  30.52 
 
 		 380 aa  138  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2518  FAD dependent oxidoreductase  29.14 
 
 		 374 aa  137  6.0000000000000005e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.355851  normal  0.0110864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5628  FAD dependent oxidoreductase  32.67 
 
 		 398 aa  136  7.000000000000001e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00384749  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2910  hydroxyglutarate oxidase  32.11 
 
 		 416 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2781  hydroxyglutarate oxidase  32.11 
 
 		 416 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1005  hydroxyglutarate oxidase  27.94 
 
 		 410 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.127914  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3777  FAD dependent oxidoreductase  28.35 
 
 		 371 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.986155 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0947  hydroxyglutarate oxidase  27.94 
 
 		 410 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1295  hydroxyglutarate oxidase  29.41 
 
 		 409 aa  134  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2873  hydroxyglutarate oxidase  32.11 
 
 		 416 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2496  FAD dependent oxidoreductase  28.3 
 
 		 369 aa  133  6.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0217  oxidoreductase, FAD-binding family protein  30.08 
 
 		 373 aa  131  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.655071  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3093  FAD dependent oxidoreductase  29.68 
 
 		 369 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0434  oxidoreductase, FAD-binding family protein  29.38 
 
 		 373 aa  130  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0953783  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0251  FAD-dependent oxidoreductase  29.38 
 
 		 373 aa  130  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  28.05 
 
 		 404 aa  130  7.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_41947  predicted protein  27.01 
 
 		 383 aa  129  9.000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.856013  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3297  oxidoreductase, FAD-binding family protein  29.11 
 
 		 373 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1005  FAD dependent oxidoreductase  28.69 
 
 		 368 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.179288 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0239  FAD-dependent oxidoreductase  29.11 
 
 		 373 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202342  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2959  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 		 369 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0708  FAD dependent oxidoreductase  28.3 
 
 		 362 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440314  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3382  oxidoreductase, FAD-binding family protein  29.11 
 
 		 373 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2964  oxidoreductase, FAD-binding family protein  29.11 
 
 		 373 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2124  oxidoreductase, FAD-binding family protein  29.11 
 
 		 373 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.646813  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  30.36 
 
 		 404 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3067  FAD dependent oxidoreductase  28.84 
 
 		 369 aa  128  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.41507 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2434  FAD dependent oxidoreductase  28.84 
 
 		 369 aa  128  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3048  FAD dependent oxidoreductase  28.84 
 
 		 369 aa  128  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0222  FAD dependent oxidoreductase  29.03 
 
 		 364 aa  127  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5430  FAD dependent oxidoreductase  27.96 
 
 		 364 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2152  FAD dependent oxidoreductase  30.98 
 
 		 367 aa  127  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2706  FAD dependent oxidoreductase  29.16 
 
 		 364 aa  126  7e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0337061  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1081  FAD dependent oxidoreductase  27.98 
 
 		 367 aa  126  9e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0868948  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4660  hydroxyglutarate oxidase  32.39 
 
 		 399 aa  125  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1646  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  30.14 
 
 		 371 aa  126  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.515375  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1660  dehydrogenase  27.5 
 
 		 625 aa  125  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6395  FAD dependent oxidoreductase  29.33 
 
 		 366 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1995  hydroxyglutarate oxidase  25.69 
 
 		 425 aa  125  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4703  predicted protein  27.49 
 
 		 373 aa  125  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.629805  normal  0.0151489 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0034  hydroxyglutarate oxidase  27.89 
 
 		 408 aa  125  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  29.93 
 
 		 400 aa  125  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2624  FAD dependent oxidoreductase  29.01 
 
 		 442 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2136  FAD dependent oxidoreductase  29.86 
 
 		 371 aa  124  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.471962  normal  0.0129365 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2451  FAD dependent oxidoreductase  28.81 
 
 		 367 aa  124  5e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2640  FAD dependent oxidoreductase  29.35 
 
 		 366 aa  123  8e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3043  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 369 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0106  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  28.84 
 
 		 368 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1916  FAD dependent oxidoreductase  27.88 
 
 		 371 aa  122  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0872909 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2833  FAD dependent oxidoreductase  29.83 
 
 		 364 aa  121  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0535368 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2610  FAD dependent oxidoreductase  29.83 
 
 		 364 aa  121  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  0.198369 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3133  FAD dependent oxidoreductase  29.49 
 
 		 407 aa  120  4.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4590  FAD dependent oxidoreductase  29.45 
 
 		 394 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0628  putative FAD dependent oxidoreductase  25.67 
 
 		 374 aa  120  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.323528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1090  FAD dependent oxidoreductase  27.66 
 
 		 378 aa  120  7e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.151516  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>