More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4896 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_4985  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 398 aa  795    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4896  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 398 aa  795    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5264  FAD dependent oxidoreductase  99.75 
 
 		 398 aa  793    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1296  FAD dependent oxidoreductase  77.97 
 
 		 401 aa  591  1e-168  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43026  normal  0.445947 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  76.2 
 
 		 399 aa  590  1e-167  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5513  FAD dependent oxidoreductase  79.05 
 
 		 398 aa  565  1e-160  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225549 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  35.11 
 
 		 394 aa  229  9e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  35.11 
 
 		 394 aa  220  3.9999999999999997e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  34.01 
 
 		 394 aa  217  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  34.67 
 
 		 395 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  30.93 
 
 		 383 aa  184  3e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  33.16 
 
 		 376 aa  182  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  28.07 
 
 		 381 aa  176  7e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  28.09 
 
 		 382 aa  175  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 		 382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 385 aa  170  5e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  32.22 
 
 		 500 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  31.48 
 
 		 386 aa  167  2e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  31.7 
 
 		 500 aa  167  4e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  30.69 
 
 		 385 aa  166  5e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  30.93 
 
 		 496 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  32.81 
 
 		 385 aa  163  6e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  31.92 
 
 		 392 aa  160  4e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  30.21 
 
 		 442 aa  152  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  32.57 
 
 		 378 aa  150  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  30.35 
 
 		 388 aa  150  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  30.26 
 
 		 385 aa  149  7e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  26.61 
 
 		 390 aa  148  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  31.96 
 
 		 492 aa  143  5e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4841  FAD dependent oxidoreductase  29.89 
 
 		 400 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3340  FAD dependent oxidoreductase  30.37 
 
 		 387 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0285888  normal  0.210627 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  25.62 
 
 		 373 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4757  FAD dependent oxidoreductase  31.34 
 
 		 390 aa  133  6e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  28.87 
 
 		 819 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  27.51 
 
 		 385 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 		 439 aa  130  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0642  FAD dependent oxidoreductase  30.41 
 
 		 815 aa  127  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3229  FAD dependent oxidoreductase  26.49 
 
 		 391 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267382  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0969  sarcosine oxidase beta subunit family protein  27.46 
 
 		 431 aa  124  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  30.39 
 
 		 378 aa  124  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0512  sarcosine oxidase beta subunit family protein  26.42 
 
 		 423 aa  122  9e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  25.82 
 
 		 816 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  27.91 
 
 		 378 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4894  FAD dependent oxidoreductase  28.42 
 
 		 397 aa  122  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1351  FAD dependent oxidoreductase  28.02 
 
 		 413 aa  120  3e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000108585  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3293  FAD dependent oxidoreductase  29.85 
 
 		 385 aa  121  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 		 395 aa  121  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2104  FAD dependent oxidoreductase  27.58 
 
 		 413 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4916  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 		 815 aa  120  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3472  FAD dependent oxidoreductase  28.42 
 
 		 413 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3393  sarcosine oxidase, beta subunit family  27.76 
 
 		 417 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0208125  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3849  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 		 404 aa  120  4.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.121432  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3595  sarcosine oxidase, beta subunit family  27.44 
 
 		 406 aa  119  7e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2452  sarcosine oxidase, beta subunit  27.13 
 
 		 413 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00527323  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  26.51 
 
 		 460 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18810  sarcosine oxidase, beta subunit family, heterotetrameric form  27.66 
 
 		 412 aa  117  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2224  FAD dependent oxidoreductase  27.13 
 
 		 413 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.175364  normal  0.288847 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0452  FAD dependent oxidoreductase  28.13 
 
 		 413 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000226129  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  25.27 
 
 		 816 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0926  FAD dependent oxidoreductase  31.99 
 
 		 393 aa  116  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3866  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 		 843 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5914  FAD dependent oxidoreductase  27.09 
 
 		 413 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  27.48 
 
 		 823 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2183  sarcosine oxidase beta subunit family protein  27.34 
 
 		 414 aa  115  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.409819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0998  sarcosine oxidase beta subunit family protein  28.09 
 
 		 416 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3704  sarcosine oxidase beta subunit family protein  27.06 
 
 		 406 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2478  sarcosine oxidase, beta subunit  27.62 
 
 		 416 aa  114  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4032  sarcosine oxidase, beta subunit  27.62 
 
 		 416 aa  114  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2849  FAD dependent oxidoreductase  26.84 
 
 		 812 aa  114  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5888  oxidoreductase  28.84 
 
 		 445 aa  114  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2760  sarcosine oxidase beta subunit family protein  27.65 
 
 		 417 aa  113  5e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6338  FAD dependent oxidoreductase  29.29 
 
 		 446 aa  113  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2862  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  28.02 
 
 		 394 aa  113  6e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2494  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 		 413 aa  112  8.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.207468  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1431  FAD dependent oxidoreductase  28.42 
 
 		 394 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0107924 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1694  FAD dependent oxidoreductase  27.81 
 
 		 412 aa  111  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3929  FAD dependent oxidoreductase  30.64 
 
 		 386 aa  110  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.371488  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0229  sarcosine oxidase, beta subunit  27.51 
 
 		 417 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2112  FAD dependent oxidoreductase  27.06 
 
 		 392 aa  110  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0850914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5589  FAD dependent oxidoreductase  29.53 
 
 		 441 aa  110  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.17966 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2197  FAD dependent oxidoreductase  26.68 
 
 		 815 aa  110  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.031847 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5297  oxidoreductase  27.58 
 
 		 443 aa  109  9.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.893259  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8584  sarcosine oxidase, beta subunit family  28.02 
 
 		 417 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.738598  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3736  sarcosine oxidase beta subunit family protein  26.89 
 
 		 417 aa  109  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.42969  normal  0.377029 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  28.31 
 
 		 388 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2117  sarcosine oxidase subunit beta  27.51 
 
 		 417 aa  108  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0935  FAD dependent oxidoreductase  26.47 
 
 		 376 aa  108  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.311284  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3069  FAD dependent oxidoreductase  26.73 
 
 		 441 aa  108  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.211431  hitchhiker  0.00906466 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3991  sarcosine oxidase, beta subunit family  25.85 
 
 		 417 aa  108  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0301  sarcosine oxidase beta subunit family protein  27.51 
 
 		 417 aa  108  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0992  sarcosine oxidase beta subunit family protein  28.03 
 
 		 417 aa  107  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.23749  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  28.51 
 
 		 442 aa  107  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  28.35 
 
 		 386 aa  107  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3838  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 		 827 aa  107  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761233  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0798  glycine cleavage system T protein  28.53 
 
 		 822 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  29.34 
 
 		 385 aa  107  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4031  sarcosine oxidase, beta subunit family  26.37 
 
 		 417 aa  107  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1344  sarcosine oxidase beta subunit family protein  24.35 
 
 		 415 aa  107  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0947006  normal  0.025984 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2686  putative sarcosine oxidase beta subunit  24.35 
 
 		 415 aa  107  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0604356  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  26.72 
 
 		 441 aa  106  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>