More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4757 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4757  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
390 aa  791    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2994  FAD dependent oxidoreductase  60.26 
 
 
390 aa  422  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2808  oxidoreductase, FAD-binding family protein  59.74 
 
 
390 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2867  oxidoreductase, FAD-binding family protein  59.74 
 
 
418 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2435  oxidoreductase, FAD-binding family protein  59.26 
 
 
390 aa  408  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0467125  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0571  oxidoreductase, FAD-binding family protein  59.26 
 
 
418 aa  408  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1757  oxidoreductase, FAD-binding family protein  59.26 
 
 
390 aa  408  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283784  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2748  oxidoreductase, FAD-binding family protein  59.52 
 
 
390 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.252588  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2845  oxidoreductase, FAD-binding family protein  59.26 
 
 
433 aa  408  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3229  FAD dependent oxidoreductase  51.04 
 
 
391 aa  410  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267382  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02147  hypothetical protein  59.04 
 
 
398 aa  404  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1760  oxidoreductase, FAD-binding family protein  57.41 
 
 
390 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6595  FAD dependent oxidoreductase  54.93 
 
 
390 aa  392  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.0778916 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2577  putative FAD dependent oxidoreductase  55.2 
 
 
390 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.119285 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2070  FAD dependent oxidoreductase  55.05 
 
 
392 aa  387  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4046  FAD dependent oxidoreductase  54.13 
 
 
390 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3417  FAD dependent oxidoreductase  54.13 
 
 
390 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5250  FAD dependent oxidoreductase  54.13 
 
 
390 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5151  FAD dependent oxidoreductase  54.13 
 
 
390 aa  383  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.836539  normal  0.719535 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3475  FAD dependent oxidoreductase  53.87 
 
 
390 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2677  FAD dependent oxidoreductase  53.07 
 
 
390 aa  376  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3884  FAD dependent oxidoreductase  52.27 
 
 
390 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303875  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2862  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  49.87 
 
 
394 aa  362  6e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1431  FAD dependent oxidoreductase  49.12 
 
 
394 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0107924 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3496  FAD dependent oxidoreductase  41.27 
 
 
405 aa  300  3e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0177627 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  35.99 
 
 
385 aa  202  6e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  34.18 
 
 
385 aa  192  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  35.35 
 
 
385 aa  183  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  35.86 
 
 
385 aa  182  7e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  34.17 
 
 
378 aa  147  4.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  32.92 
 
 
378 aa  147  5e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  27.99 
 
 
390 aa  140  3.9999999999999997e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3293  FAD dependent oxidoreductase  31.15 
 
 
385 aa  134  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  31.13 
 
 
386 aa  127  5e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 
392 aa  119  7e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  26.05 
 
 
373 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  30.51 
 
 
394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4896  FAD dependent oxidoreductase  30.09 
 
 
398 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4985  FAD dependent oxidoreductase  30.09 
 
 
398 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  27.41 
 
 
382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  28.75 
 
 
394 aa  114  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5264  FAD dependent oxidoreductase  29.79 
 
 
398 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1296  FAD dependent oxidoreductase  28.99 
 
 
401 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43026  normal  0.445947 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  28.83 
 
 
394 aa  109  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  28.49 
 
 
388 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4871  FAD dependent oxidoreductase  30.36 
 
 
825 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862382  normal  0.731807 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  24.56 
 
 
382 aa  106  7e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  28.43 
 
 
395 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  26.58 
 
 
383 aa  105  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  28.79 
 
 
399 aa  104  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  29.53 
 
 
500 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  26.95 
 
 
395 aa  104  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  29.53 
 
 
500 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  28.8 
 
 
378 aa  103  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  27.48 
 
 
823 aa  102  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  26.59 
 
 
385 aa  102  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  28.35 
 
 
388 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2112  FAD dependent oxidoreductase  28.91 
 
 
392 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0850914  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  28.97 
 
 
496 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  25.45 
 
 
816 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  25.19 
 
 
816 aa  96.7  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  27.14 
 
 
376 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5513  FAD dependent oxidoreductase  28.95 
 
 
398 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.225549 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  28.17 
 
 
819 aa  94  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0935  FAD dependent oxidoreductase  28.09 
 
 
376 aa  94  4e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.311284  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  28.09 
 
 
492 aa  92.8  9e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3838  FAD dependent oxidoreductase  27.17 
 
 
827 aa  89  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761233  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0798  glycine cleavage system T protein  30.69 
 
 
822 aa  87.8  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  24 
 
 
381 aa  88.2  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2591  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 
826 aa  87  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1985  FAD dependent oxidoreductase  27.86 
 
 
387 aa  86.7  6e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.886969  normal  0.969169 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1168  FAD dependent oxidoreductase  22.16 
 
 
372 aa  86.3  9e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.754644  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  27.23 
 
 
389 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1024  FAD dependent oxidoreductase  25.6 
 
 
403 aa  84.3  0.000000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000324501  unclonable  1.04901e-22 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4916  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
815 aa  84.7  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  27.6 
 
 
389 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0919  FAD dependent oxidoreductase  25.79 
 
 
837 aa  82.4  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4985  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 
831 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0450258 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  27.79 
 
 
374 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  28.42 
 
 
383 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1655  FAD dependent oxidoreductase  24.37 
 
 
415 aa  81.6  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.347417 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3929  FAD dependent oxidoreductase  26.92 
 
 
386 aa  82  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.371488  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1666  dehydrogenase  26.35 
 
 
831 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0839495 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1461  FAD dependent oxidoreductase  24.62 
 
 
416 aa  79.7  0.00000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.719786  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1527  FAD dependent oxidoreductase  25.66 
 
 
416 aa  79.3  0.00000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.246642  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  26.19 
 
 
394 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0222  FAD dependent oxidoreductase  24.3 
 
 
365 aa  79  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000376254  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  24.29 
 
 
799 aa  79.3  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 
385 aa  78.2  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  26.15 
 
 
378 aa  77.8  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1848  FAD dependent oxidoreductase  23.54 
 
 
373 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.344381  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  25.65 
 
 
378 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6585  FAD dependent oxidoreductase  26.86 
 
 
389 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3311  FAD dependent oxidoreductase  24.49 
 
 
817 aa  76.3  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  28.32 
 
 
376 aa  75.5  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  25.84 
 
 
376 aa  74.3  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0486  FAD dependent oxidoreductase  23.65 
 
 
835 aa  74.3  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0493808  normal  0.0384194 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2197  FAD dependent oxidoreductase  24.23 
 
 
815 aa  73.9  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.031847 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2488  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 
806 aa  73.6  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.255163  normal  0.0203493 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3161  FAD dependent oxidoreductase  27.01 
 
 
827 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>