More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1418 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1418  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 381 aa  760    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3091  FAD dependent oxidoreductase  34.47 
 
 		 381 aa  159  8e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.105972  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3550  FAD dependent oxidoreductase  32.3 
 
 		 415 aa  145  9e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1338  FAD dependent oxidoreductase  34.01 
 
 		 415 aa  138  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1969  FAD dependent oxidoreductase  33.79 
 
 		 377 aa  134  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.053713 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  32.11 
 
 		 435 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  31.98 
 
 		 438 aa  132  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1899  oxidoreductase  31.02 
 
 		 449 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.152308 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  24.73 
 
 		 428 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  30.23 
 
 		 439 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  29.31 
 
 		 429 aa  127  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5828  FAD dependent oxidoreductase  32.6 
 
 		 494 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5032  FAD dependent oxidoreductase  32.6 
 
 		 494 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0622047  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0887  putative FAD-binding oxidoreductase  29.65 
 
 		 426 aa  126  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1934  FAD dependent oxidoreductase  29.47 
 
 		 472 aa  127  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1987  FAD dependent oxidoreductase  29.69 
 
 		 465 aa  126  7e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129488  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4572  FAD dependent oxidoreductase  29.92 
 
 		 426 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  29.46 
 
 		 439 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  30.65 
 
 		 433 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4351  FAD dependent oxidoreductase  32.05 
 
 		 494 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3861  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 		 470 aa  122  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  0.682317 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0537  FAD dependent oxidoreductase  31.43 
 
 		 419 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5715  FAD dependent oxidoreductase  31.94 
 
 		 480 aa  122  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3139  aminophosphonate oxidoreductase  29.44 
 
 		 462 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000145397 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0717  D-amino acid oxidase family protein  29.38 
 
 		 428 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3421  FAD dependent oxidoreductase  30.23 
 
 		 404 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.135241 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0770  D-amino acid oxidase family protein  28.73 
 
 		 428 aa  120  6e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451477  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0635  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 370 aa  119  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  29.02 
 
 		 437 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6023  hypothetical protein  29.33 
 
 		 466 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6399  twin-arginine translocation pathway signal  30.83 
 
 		 482 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  33.51 
 
 		 430 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  27.46 
 
 		 433 aa  117  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2291  FAD dependent oxidoreductase  32.79 
 
 		 430 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.394886 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3264  FAD dependent oxidoreductase  25.74 
 
 		 427 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5122  FAD dependent oxidoreductase  29.33 
 
 		 460 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3857  FAD dependent oxidoreductase  30.49 
 
 		 462 aa  117  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  29.4 
 
 		 431 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  30.03 
 
 		 423 aa  116  7.999999999999999e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3597  FAD dependent oxidoreductase  28.94 
 
 		 425 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0903  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 		 454 aa  115  8.999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  29.02 
 
 		 437 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4774  FAD dependent oxidoreductase  26.58 
 
 		 448 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.952242  normal  0.115123 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2227  putative FAD dependent oxidoreductase  30.83 
 
 		 434 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0806459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 		 453 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1124  FAD dependent oxidoreductase  30.73 
 
 		 453 aa  115  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.564615  normal  0.27217 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  25.45 
 
 		 427 aa  114  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0296  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 		 427 aa  114  3e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6842  FAD dependent oxidoreductase  30.79 
 
 		 465 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.133179 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3079  aminophosphonate oxidoreductase  28.42 
 
 		 462 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0471981 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  29.13 
 
 		 431 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  28.72 
 
 		 436 aa  113  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3143  FAD dependent oxidoreductase  28.76 
 
 		 462 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2530  FAD dependent oxidoreductase  28.76 
 
 		 521 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2636  FAD dependent oxidoreductase  30.96 
 
 		 429 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.773353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  26.12 
 
 		 425 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 		 427 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1549  FAD dependent oxidoreductase  30.23 
 
 		 472 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1509  putative FAD dependent oxidoreductase  29.24 
 
 		 445 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166671  normal  0.147012 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0780  FAD dependent oxidoreductase  27.61 
 
 		 469 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.240885  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3163  aminophosphonate oxidoreductase  28.5 
 
 		 462 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0194513 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1779  FAD dependent oxidoreductase  33.06 
 
 		 367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000510083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  28.87 
 
 		 431 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  28.05 
 
 		 431 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  27.62 
 
 		 437 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  29 
 
 		 436 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2617  FAD dependent oxidoreductase  30.33 
 
 		 460 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523362  normal  0.489524 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0826  FAD dependent oxidoreductase  28.86 
 
 		 437 aa  110  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2476  FAD dependent oxidoreductase  29.11 
 
 		 430 aa  110  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.326489  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4822  FAD dependent oxidoreductase  27.37 
 
 		 448 aa  110  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0537727  normal  0.272998 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  27.41 
 
 		 433 aa  110  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6498  FAD dependent oxidoreductase  27.97 
 
 		 491 aa  110  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.438276  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3196  FAD dependent oxidoreductase  28.17 
 
 		 462 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4421  FAD dependent oxidoreductase  27.42 
 
 		 425 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  27.6 
 
 		 427 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  27.6 
 
 		 427 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4199  FAD dependent oxidoreductase  29.26 
 
 		 437 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  27.44 
 
 		 430 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  27.11 
 
 		 428 aa  108  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2946  FAD dependent oxidoreductase  29.33 
 
 		 427 aa  108  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  27.6 
 
 		 427 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  27.11 
 
 		 428 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  27.18 
 
 		 428 aa  108  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5870  FAD dependent oxidoreductase  27.84 
 
 		 463 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.982629  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1019  FAD dependent oxidoreductase  30.59 
 
 		 424 aa  107  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0892  oxidoreductase, FAD-binding  29.94 
 
 		 461 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0231  FAD dependent oxidoreductase  29.92 
 
 		 427 aa  108  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 		 432 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  27.6 
 
 		 427 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  27.11 
 
 		 428 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6151  FAD dependent oxidoreductase  29.77 
 
 		 445 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5325  FAD dependent oxidoreductase  29.46 
 
 		 430 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0381154 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5174  FAD dependent oxidoreductase  29.85 
 
 		 456 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5086  FAD dependent oxidoreductase  29.85 
 
 		 456 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.973879  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4482  FAD dependent oxidoreductase  28.99 
 
 		 437 aa  107  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4676  oxidoreductase, FAD-dependent  25.13 
 
 		 427 aa  106  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  26.49 
 
 		 427 aa  107  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0254  FAD dependent oxidoreductase  27.84 
 
 		 443 aa  107  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  26.9 
 
 		 435 aa  106  6e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  27.37 
 
 		 428 aa  106  6e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>