273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0635 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0635  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
370 aa  757    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02360  oxidoreductase  52.73 
 
 
376 aa  385  1e-106  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.561743  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1926  FAD dependent oxidoreductase  43.39 
 
 
376 aa  318  9e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000171053  normal  0.0881723 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1418  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 
381 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1779  FAD dependent oxidoreductase  27.55 
 
 
367 aa  80.9  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000510083  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3421  FAD dependent oxidoreductase  22.19 
 
 
404 aa  74.7  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.135241 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  23.47 
 
 
435 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  23.73 
 
 
435 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  23.2 
 
 
435 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  23.47 
 
 
435 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0954  FAD dependent oxidoreductase  21.51 
 
 
445 aa  68.6  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.650756  normal  0.921941 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  23.47 
 
 
435 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  24.19 
 
 
438 aa  67.4  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  22.74 
 
 
428 aa  67  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  23.35 
 
 
453 aa  67  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5325  FAD dependent oxidoreductase  23.72 
 
 
430 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0381154 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1264  oxidoreductase  22.22 
 
 
435 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5870  FAD dependent oxidoreductase  23.24 
 
 
463 aa  66.2  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.982629  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6396  FAD dependent oxidoreductase  24.29 
 
 
482 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0152469  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  24.8 
 
 
430 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2227  putative FAD dependent oxidoreductase  23.42 
 
 
434 aa  65.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0806459  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4351  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 
494 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3101  FAD dependent oxidoreductase  22.07 
 
 
435 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1461  putative oxidoreductase  23.08 
 
 
454 aa  65.1  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1934  FAD dependent oxidoreductase  22.31 
 
 
472 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2555  FAD dependent oxidoreductase  25.38 
 
 
429 aa  65.1  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  22.48 
 
 
439 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  23.53 
 
 
425 aa  65.1  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  22.74 
 
 
430 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4055  FAD dependent oxidoreductase  25.58 
 
 
435 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.80988  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2804  FAD dependent oxidoreductase  22.54 
 
 
464 aa  63.9  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3004  FAD dependent oxidoreductase  21.81 
 
 
435 aa  63.9  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917445  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2922  FAD dependent oxidoreductase  22.16 
 
 
435 aa  63.5  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  22.59 
 
 
430 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3316  FAD dependent oxidoreductase  23.16 
 
 
433 aa  63.2  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  22.59 
 
 
430 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3943  FAD dependent oxidoreductase  23.65 
 
 
428 aa  63.2  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0778  FAD dependent oxidoreductase  24.03 
 
 
429 aa  63.2  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0594018  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0390  hypothetical protein  22.92 
 
 
465 aa  62  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4329  FAD dependent oxidoreductase  21.19 
 
 
453 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.112213 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4439  FAD dependent oxidoreductase  21.19 
 
 
453 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal  0.839002 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3014  FAD dependent oxidoreductase  21.73 
 
 
435 aa  62  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1969  FAD dependent oxidoreductase  27.94 
 
 
377 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.053713 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2980  FAD dependent oxidoreductase  22.73 
 
 
435 aa  61.6  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.104228  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  23.36 
 
 
439 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1311  FAD dependent oxidoreductase  21.22 
 
 
420 aa  62  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5273  oxidoreductase, putative  22.64 
 
 
430 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.194713  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5183  FAD dependent oxidoreductase  22.64 
 
 
430 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0718586 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0537  FAD dependent oxidoreductase  22.42 
 
 
419 aa  61.2  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  23.35 
 
 
430 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  21.57 
 
 
433 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6023  hypothetical protein  23.71 
 
 
466 aa  60.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4365  FAD dependent oxidoreductase  25.89 
 
 
437 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  22.08 
 
 
433 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  23.24 
 
 
437 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2142  FAD dependent oxidoreductase  23.1 
 
 
427 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  23.61 
 
 
433 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1866  FAD dependent oxidoreductase  24.29 
 
 
429 aa  60.1  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106095  hitchhiker  0.00126113 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3843  FAD dependent oxidoreductase  24.63 
 
 
435 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4548  FAD dependent oxidoreductase  24.01 
 
 
435 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3679  FAD dependent oxidoreductase  21.54 
 
 
463 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001295  glycine/D-amino acid oxidase  20.9 
 
 
438 aa  59.7  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3091  FAD dependent oxidoreductase  29.68 
 
 
381 aa  59.7  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.105972  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  22.16 
 
 
435 aa  59.7  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1341  FAD dependent oxidoreductase  24.07 
 
 
435 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268345  normal  0.168111 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0153  FAD dependent oxidoreductase  21.98 
 
 
436 aa  58.9  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.185015  hitchhiker  0.000196001 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  21.56 
 
 
433 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6399  twin-arginine translocation pathway signal  20.98 
 
 
482 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  20.41 
 
 
430 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3765  putative oxidoreductase  23 
 
 
452 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1057  FAD dependent oxidoreductase  21.17 
 
 
435 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0770  D-amino acid oxidase family protein  21.83 
 
 
428 aa  58.2  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451477  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  21.73 
 
 
437 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0717  D-amino acid oxidase family protein  22.52 
 
 
428 aa  58.5  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3079  aminophosphonate oxidoreductase  23.04 
 
 
462 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0471981 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5715  FAD dependent oxidoreductase  21.55 
 
 
480 aa  58.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4572  FAD dependent oxidoreductase  23.48 
 
 
426 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  23.47 
 
 
437 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2058  hypothetical protein  23.16 
 
 
480 aa  57.8  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00793169  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  22.89 
 
 
431 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  21.83 
 
 
433 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2530  FAD dependent oxidoreductase  23.04 
 
 
521 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1987  FAD dependent oxidoreductase  22.11 
 
 
465 aa  57.8  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129488  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3143  FAD dependent oxidoreductase  23.04 
 
 
462 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1885  hypothetical protein  22.26 
 
 
464 aa  57.4  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0887  putative FAD-binding oxidoreductase  24.47 
 
 
426 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5032  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 
494 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0622047  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5828  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 
494 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2549  hypothetical protein  21.64 
 
 
463 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165188  decreased coverage  0.00741775 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3166  FAD dependent oxidoreductase  21.11 
 
 
463 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.659262  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0254  FAD dependent oxidoreductase  22.74 
 
 
443 aa  57  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2911  FAD dependent oxidoreductase  21.32 
 
 
433 aa  57  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2722  FAD dependent oxidoreductase  23.93 
 
 
429 aa  56.6  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3762  hypothetical protein  21.75 
 
 
465 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6498  FAD dependent oxidoreductase  22.51 
 
 
491 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.438276  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3163  aminophosphonate oxidoreductase  22.51 
 
 
462 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0194513 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2032  FAD dependent oxidoreductase  20.87 
 
 
433 aa  56.2  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44260  putative oxidoreductase  23.32 
 
 
436 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  20.95 
 
 
425 aa  55.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3196  FAD dependent oxidoreductase  21.93 
 
 
462 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>