More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5828 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4351  FAD dependent oxidoreductase  98.17 
 
 		 494 aa  971    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6396  FAD dependent oxidoreductase  71.86 
 
 		 482 aa  694    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0152469  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6842  FAD dependent oxidoreductase  85.33 
 
 		 465 aa  777    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.133179 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5032  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 494 aa  989    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0622047  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5828  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 494 aa  989    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6399  twin-arginine translocation pathway signal  65.84 
 
 		 482 aa  610  1e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2743  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  67.41 
 
 		 455 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0233618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4329  FAD dependent oxidoreductase  62.56 
 
 		 453 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.112213 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4439  FAD dependent oxidoreductase  62.56 
 
 		 453 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal  0.839002 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2808  oxidoreductase, putative  62.64 
 
 		 455 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.479983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0254  FAD dependent oxidoreductase  37.93 
 
 		 443 aa  271  2e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2895  FAD dependent oxidoreductase  35.77 
 
 		 432 aa  219  6e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  37.31 
 
 		 439 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  33.76 
 
 		 435 aa  186  7e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  36.8 
 
 		 439 aa  186  9e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  35.5 
 
 		 437 aa  180  4e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  34.09 
 
 		 428 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  34.54 
 
 		 433 aa  179  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  34.09 
 
 		 428 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  36.69 
 
 		 430 aa  178  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  33.83 
 
 		 428 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  33.84 
 
 		 428 aa  177  4e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  34.34 
 
 		 428 aa  176  7e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  34.34 
 
 		 428 aa  176  9e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  35.36 
 
 		 437 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  33.82 
 
 		 428 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  34.34 
 
 		 428 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  33.58 
 
 		 428 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6273  FAD dependent oxidoreductase  33.9 
 
 		 425 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106536 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6675  FAD dependent oxidoreductase  33.9 
 
 		 444 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0903  FAD dependent oxidoreductase  33.26 
 
 		 454 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  32.63 
 
 		 444 aa  173  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6440  FAD dependent oxidoreductase  33.66 
 
 		 444 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1274  hypothetical protein  33.83 
 
 		 428 aa  171  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  32.68 
 
 		 425 aa  170  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  33.91 
 
 		 428 aa  171  4e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  34.46 
 
 		 431 aa  170  5e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  33.9 
 
 		 435 aa  170  5e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  31.11 
 
 		 453 aa  170  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  34.02 
 
 		 430 aa  170  6e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  34.6 
 
 		 435 aa  170  7e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0390  hypothetical protein  30.65 
 
 		 465 aa  169  8e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1934  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 		 472 aa  169  9e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  34.19 
 
 		 430 aa  169  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  33.9 
 
 		 435 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  32.25 
 
 		 428 aa  169  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  33.76 
 
 		 430 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  33.94 
 
 		 431 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  33.42 
 
 		 427 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  34.51 
 
 		 436 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  34.22 
 
 		 430 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1885  hypothetical protein  31.32 
 
 		 464 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  33.66 
 
 		 435 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  35.26 
 
 		 438 aa  166  5.9999999999999996e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2784  FAD dependent oxidoreductase  30.7 
 
 		 483 aa  166  8e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  34.59 
 
 		 435 aa  166  8e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0721  FAD dependent oxidoreductase  33.91 
 
 		 423 aa  165  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  32.41 
 
 		 428 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  32.49 
 
 		 425 aa  165  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1135  FAD dependent oxidoreductase  32.84 
 
 		 428 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0934  putative oxidoreductase  33.33 
 
 		 440 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0826  FAD dependent oxidoreductase  32.46 
 
 		 437 aa  163  7e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2011  FAD dependent oxidoreductase  34.55 
 
 		 437 aa  162  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5908  FAD dependent oxidoreductase  31.46 
 
 		 425 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  33.16 
 
 		 427 aa  162  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  32.9 
 
 		 431 aa  161  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  32.74 
 
 		 427 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  33.85 
 
 		 433 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5196  FAD dependent oxidoreductase  31.2 
 
 		 486 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5715  FAD dependent oxidoreductase  34.32 
 
 		 480 aa  161  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7089  FAD dependent oxidoreductase  31.18 
 
 		 459 aa  161  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10152 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  35.37 
 
 		 437 aa  160  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  32.74 
 
 		 427 aa  160  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  32.39 
 
 		 430 aa  160  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  30.89 
 
 		 440 aa  160  5e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5183  FAD dependent oxidoreductase  34.26 
 
 		 430 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0718586 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4658  FAD dependent oxidoreductase  32.01 
 
 		 449 aa  160  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0629  oxidoreductase  32.18 
 
 		 468 aa  160  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0721  oxidoreductase  32.18 
 
 		 468 aa  159  8e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.625822  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2015  oxidoreductase  32.18 
 
 		 468 aa  159  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  31.58 
 
 		 426 aa  159  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1264  oxidoreductase  33.16 
 
 		 435 aa  158  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  32.38 
 
 		 431 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3139  aminophosphonate oxidoreductase  30.61 
 
 		 462 aa  158  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000145397 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5273  oxidoreductase, putative  33 
 
 		 430 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.194713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  31.55 
 
 		 427 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  31.3 
 
 		 427 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  33.5 
 
 		 429 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6350  FAD dependent oxidoreductase  32.81 
 
 		 434 aa  156  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3861  FAD dependent oxidoreductase  28.64 
 
 		 470 aa  156  7e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  0.682317 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  32.31 
 
 		 430 aa  156  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  32 
 
 		 441 aa  155  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1953  oxidoreductase, FAD-binding  32.7 
 
 		 443 aa  155  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5713  FAD dependent oxidoreductase  33.26 
 
 		 460 aa  156  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3166  FAD dependent oxidoreductase  31.29 
 
 		 463 aa  156  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2905  FAD dependent oxidoreductase  32.03 
 
 		 468 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0519998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2861  FAD dependent oxidoreductase  32.03 
 
 		 468 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3048  FAD dependent oxidoreductase  32.12 
 
 		 439 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1057  FAD dependent oxidoreductase  32.75 
 
 		 435 aa  155  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0347  FAD dependent oxidoreductase  31.94 
 
 		 433 aa  155  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>