More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2743 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2743  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  100 
 
 		 455 aa  930    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0233618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6396  FAD dependent oxidoreductase  69.61 
 
 		 482 aa  624  1e-178  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0152469  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6399  twin-arginine translocation pathway signal  67.82 
 
 		 482 aa  624  1e-177  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6842  FAD dependent oxidoreductase  68.6 
 
 		 465 aa  608  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.133179 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2808  oxidoreductase, putative  67.59 
 
 		 455 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.479983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4351  FAD dependent oxidoreductase  68.17 
 
 		 494 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5828  FAD dependent oxidoreductase  67.95 
 
 		 494 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5032  FAD dependent oxidoreductase  67.95 
 
 		 494 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0622047  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4329  FAD dependent oxidoreductase  62.64 
 
 		 453 aa  568  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.112213 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4439  FAD dependent oxidoreductase  62.64 
 
 		 453 aa  568  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal  0.839002 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0254  FAD dependent oxidoreductase  38.37 
 
 		 443 aa  289  7e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2895  FAD dependent oxidoreductase  34.81 
 
 		 432 aa  235  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  30.75 
 
 		 453 aa  187  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  32.02 
 
 		 435 aa  182  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6091  FAD dependent oxidoreductase  34.36 
 
 		 424 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1494  FAD dependent oxidoreductase  33.85 
 
 		 424 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250769  hitchhiker  0.00298171 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  32.48 
 
 		 428 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0903  FAD dependent oxidoreductase  31.52 
 
 		 454 aa  173  5.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  29.56 
 
 		 424 aa  170  5e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5599  FAD dependent oxidoreductase  30.55 
 
 		 424 aa  169  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.637375 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  32.45 
 
 		 428 aa  168  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  31.79 
 
 		 428 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  32.28 
 
 		 428 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  32.05 
 
 		 428 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  32.05 
 
 		 428 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  31.79 
 
 		 428 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  32.48 
 
 		 444 aa  163  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  31.51 
 
 		 427 aa  163  6e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1885  hypothetical protein  30.9 
 
 		 464 aa  162  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0284  putative oxidoreductase  30.8 
 
 		 473 aa  160  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1113  FAD dependent oxidoreductase  31.46 
 
 		 473 aa  160  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  31.52 
 
 		 428 aa  160  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  32.28 
 
 		 435 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  31.52 
 
 		 428 aa  160  4e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0826  FAD dependent oxidoreductase  30.62 
 
 		 437 aa  160  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  31.52 
 
 		 428 aa  160  5e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  32.28 
 
 		 435 aa  160  6e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  31.94 
 
 		 427 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  32.98 
 
 		 439 aa  159  7e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  32.53 
 
 		 425 aa  159  8e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  32.81 
 
 		 435 aa  159  8e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  32.12 
 
 		 427 aa  159  9e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  31.25 
 
 		 427 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  32.51 
 
 		 439 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  30.69 
 
 		 440 aa  159  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5715  FAD dependent oxidoreductase  31.76 
 
 		 480 aa  159  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  30.21 
 
 		 424 aa  159  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  32.12 
 
 		 427 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  31.87 
 
 		 427 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6675  FAD dependent oxidoreductase  32.26 
 
 		 444 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 		 428 aa  158  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1274  hypothetical protein  31.27 
 
 		 428 aa  157  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7089  FAD dependent oxidoreductase  29.73 
 
 		 459 aa  157  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10152 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  32.02 
 
 		 435 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  30.79 
 
 		 428 aa  157  4e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0934  putative oxidoreductase  32.16 
 
 		 440 aa  157  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6440  FAD dependent oxidoreductase  31.99 
 
 		 444 aa  156  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  31.56 
 
 		 427 aa  156  7e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0775  putative FAD dependent oxidoreductase  33.24 
 
 		 425 aa  156  8e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.476626 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  31.68 
 
 		 427 aa  155  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2946  FAD dependent oxidoreductase  33.42 
 
 		 427 aa  155  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6273  FAD dependent oxidoreductase  31.72 
 
 		 425 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106536 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0057  FAD dependent oxidoreductase  31.12 
 
 		 429 aa  154  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.610383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4421  FAD dependent oxidoreductase  31.35 
 
 		 425 aa  154  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  30.89 
 
 		 427 aa  153  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5713  FAD dependent oxidoreductase  31.2 
 
 		 460 aa  153  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6592  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 		 424 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0721  FAD dependent oxidoreductase  30.21 
 
 		 423 aa  152  8e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  31.76 
 
 		 427 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  32.21 
 
 		 429 aa  152  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  32.26 
 
 		 431 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1549  FAD dependent oxidoreductase  29.66 
 
 		 472 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0390  hypothetical protein  27.83 
 
 		 465 aa  151  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4658  FAD dependent oxidoreductase  30.9 
 
 		 449 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2922  FAD dependent oxidoreductase  32.28 
 
 		 435 aa  151  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  31.01 
 
 		 435 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1784  FAD dependent oxidoreductase  29.29 
 
 		 429 aa  150  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 		 427 aa  150  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0908  FAD dependent oxidoreductase  29.12 
 
 		 460 aa  150  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1013  FAD dependent oxidoreductase  30.68 
 
 		 464 aa  150  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.244373 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2052  oxidoreductase  29.44 
 
 		 429 aa  150  5e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2015  oxidoreductase  32.42 
 
 		 468 aa  150  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2011  FAD dependent oxidoreductase  31.93 
 
 		 437 aa  150  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0721  oxidoreductase  32.42 
 
 		 468 aa  150  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.625822  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1264  oxidoreductase  30.97 
 
 		 435 aa  150  6e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0629  oxidoreductase  32.43 
 
 		 468 aa  150  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  31.73 
 
 		 430 aa  150  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  29.58 
 
 		 426 aa  149  7e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  31.99 
 
 		 437 aa  149  8e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2458  FAD dependent oxidoreductase  31.88 
 
 		 442 aa  149  8e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2193  FAD dependent oxidoreductase  29.29 
 
 		 429 aa  149  8e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5908  FAD dependent oxidoreductase  30.77 
 
 		 425 aa  149  9e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3075  FAD dependent oxidoreductase  31.12 
 
 		 425 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.769709  normal  0.0446875 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  32.32 
 
 		 438 aa  149  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2186  FAD dependent oxidoreductase  31.1 
 
 		 429 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1835  FAD dependent oxidoreductase  29.29 
 
 		 429 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508691 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  28.7 
 
 		 428 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0778  FAD dependent oxidoreductase  28.93 
 
 		 429 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0594018  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3004  FAD dependent oxidoreductase  31.76 
 
 		 435 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  31.05 
 
 		 435 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>