More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1013 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1885  hypothetical protein  73.06 
 
 
464 aa  706    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3392  FAD dependent oxidoreductase  67.46 
 
 
464 aa  635    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1013  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
464 aa  929    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.244373 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0284  putative oxidoreductase  67.95 
 
 
473 aa  610  1e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7089  FAD dependent oxidoreductase  64.63 
 
 
459 aa  590  1e-167  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.10152 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5715  FAD dependent oxidoreductase  59.91 
 
 
480 aa  543  1e-153  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2905  FAD dependent oxidoreductase  55.91 
 
 
468 aa  481  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0519998  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2861  FAD dependent oxidoreductase  55.91 
 
 
468 aa  481  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4628  FAD dependent oxidoreductase  55 
 
 
477 aa  478  1e-134  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2891  FAD dependent oxidoreductase  56.85 
 
 
443 aa  478  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556451  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3170  FAD dependent oxidoreductase  55.29 
 
 
477 aa  474  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0540221 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3417  FAD dependent oxidoreductase  54.76 
 
 
471 aa  464  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000555141  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0889  FAD dependent oxidoreductase  52.61 
 
 
487 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0095  hypothetical protein  42.33 
 
 
470 aa  387  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0631849  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3861  FAD dependent oxidoreductase  46.14 
 
 
457 aa  377  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2784  FAD dependent oxidoreductase  41.83 
 
 
483 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1515  FAD dependent oxidoreductase  43.62 
 
 
463 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5196  FAD dependent oxidoreductase  41.89 
 
 
486 aa  356  5e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0390  hypothetical protein  35.38 
 
 
465 aa  318  1e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2810  FAD dependent oxidoreductase  33.9 
 
 
496 aa  206  5e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.73838  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0903  FAD dependent oxidoreductase  36.22 
 
 
454 aa  206  5e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1549  FAD dependent oxidoreductase  34.48 
 
 
472 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3762  hypothetical protein  36.36 
 
 
465 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3231  FAD dependent oxidoreductase  34.59 
 
 
466 aa  197  5.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.749546  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44210  putative glycine/D-amino acid oxidase  35.6 
 
 
465 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.032969  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1492  FAD dependent oxidoreductase  34.51 
 
 
462 aa  190  4e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0950  FAD dependent oxidoreductase  34.77 
 
 
466 aa  187  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.230558  normal  0.1985 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2220  aminophosphonate oxidoreductase  34.12 
 
 
463 aa  187  5e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1280  FAD dependent oxidoreductase  33.57 
 
 
462 aa  186  6e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00857441  normal  0.15279 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2549  hypothetical protein  33.92 
 
 
463 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165188  decreased coverage  0.00741775 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39720  putative amino acid oxidase  32.13 
 
 
466 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1987  FAD dependent oxidoreductase  32.97 
 
 
465 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129488  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0908  FAD dependent oxidoreductase  30.13 
 
 
460 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3166  FAD dependent oxidoreductase  33.26 
 
 
463 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.659262  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3367  aminophosphonate oxidoreductase  33.26 
 
 
463 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.585702  normal  0.425425 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0812  FAD dependent oxidoreductase  34.12 
 
 
473 aa  182  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  28.01 
 
 
453 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2277  FAD dependent oxidoreductase  32.91 
 
 
486 aa  179  7e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3679  FAD dependent oxidoreductase  31.82 
 
 
463 aa  177  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0622  FAD dependent oxidoreductase  31.58 
 
 
463 aa  176  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5174  FAD dependent oxidoreductase  31.6 
 
 
456 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2617  FAD dependent oxidoreductase  30.02 
 
 
460 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523362  normal  0.489524 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5086  FAD dependent oxidoreductase  31.6 
 
 
456 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.973879  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2804  FAD dependent oxidoreductase  32.8 
 
 
464 aa  171  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1109  FAD dependent oxidoreductase  32.81 
 
 
457 aa  168  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.921836 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  35.51 
 
 
431 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3143  FAD dependent oxidoreductase  31.51 
 
 
462 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3196  FAD dependent oxidoreductase  31.89 
 
 
462 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04889  FAD dependent oxidoreductase  27.9 
 
 
466 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2530  FAD dependent oxidoreductase  31.51 
 
 
521 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2026  FAD dependent oxidoreductase  32.15 
 
 
460 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.721167  normal  0.721714 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3139  aminophosphonate oxidoreductase  30.82 
 
 
462 aa  167  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000145397 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000757  glycine/D-amino acid oxidase  29.77 
 
 
466 aa  167  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270345  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5464  FAD dependent oxidoreductase  31.37 
 
 
456 aa  167  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3857  FAD dependent oxidoreductase  31.49 
 
 
462 aa  166  5.9999999999999996e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1896  FAD dependent oxidoreductase  32.3 
 
 
460 aa  166  9e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117344  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  35.25 
 
 
431 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6498  FAD dependent oxidoreductase  31.28 
 
 
491 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.438276  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3223  FAD dependent oxidoreductase  31.45 
 
 
465 aa  166  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.188463  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  35.51 
 
 
431 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3079  aminophosphonate oxidoreductase  30.98 
 
 
462 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0471981 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3163  aminophosphonate oxidoreductase  31.05 
 
 
462 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0194513 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  32.59 
 
 
439 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  32.06 
 
 
430 aa  163  6e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5713  FAD dependent oxidoreductase  32.38 
 
 
460 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  32.56 
 
 
439 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0253  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  31.82 
 
 
460 aa  162  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5870  FAD dependent oxidoreductase  29.86 
 
 
463 aa  160  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.982629  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  34.74 
 
 
431 aa  160  6e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  30.11 
 
 
437 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5703  FAD dependent oxidoreductase  30.4 
 
 
472 aa  159  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563172  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2906  FAD dependent oxidoreductase  31.47 
 
 
474 aa  158  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000261915  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  32.4 
 
 
436 aa  158  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1113  FAD dependent oxidoreductase  30.64 
 
 
473 aa  158  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  31.03 
 
 
437 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  31.09 
 
 
430 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  31.09 
 
 
430 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  30.16 
 
 
430 aa  155  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  32.58 
 
 
438 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3143  FAD dependent oxidoreductase  29.91 
 
 
491 aa  155  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6842  FAD dependent oxidoreductase  32.55 
 
 
465 aa  154  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.133179 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3062  FAD dependent oxidoreductase  30.5 
 
 
482 aa  154  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30158  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  30.86 
 
 
430 aa  154  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0780  FAD dependent oxidoreductase  30.65 
 
 
469 aa  154  5e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.240885  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2743  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  30.68 
 
 
455 aa  153  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0233618  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0919  FAD dependent oxidoreductase  31.6 
 
 
475 aa  153  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.108527  normal  0.544612 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5325  FAD dependent oxidoreductase  30.6 
 
 
430 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0381154 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6399  twin-arginine translocation pathway signal  29.22 
 
 
482 aa  152  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0879  FAD dependent oxidoreductase  29.31 
 
 
491 aa  151  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0139  FAD dependent oxidoreductase  29.84 
 
 
464 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.412915  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3244  FAD dependent oxidoreductase  29.6 
 
 
491 aa  150  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  31.18 
 
 
433 aa  150  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  31.27 
 
 
430 aa  149  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  30.33 
 
 
437 aa  149  8e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  29.4 
 
 
444 aa  149  8e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6675  FAD dependent oxidoreductase  30.49 
 
 
444 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411958  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  30.58 
 
 
425 aa  149  9e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0875  FAD dependent oxidoreductase  30.25 
 
 
476 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.120395  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.35 
 
 
426 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3113  FAD dependent oxidoreductase  29.7 
 
 
427 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110825  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>