More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2895 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2895  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 432 aa  874    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2743  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  34.81 
 
 		 455 aa  253  7e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0233618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6399  twin-arginine translocation pathway signal  34.26 
 
 		 482 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6396  FAD dependent oxidoreductase  35.09 
 
 		 482 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0152469  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4351  FAD dependent oxidoreductase  36.02 
 
 		 494 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6842  FAD dependent oxidoreductase  35.01 
 
 		 465 aa  231  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.133179 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4439  FAD dependent oxidoreductase  33.26 
 
 		 453 aa  224  3e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal  0.839002 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4329  FAD dependent oxidoreductase  33.26 
 
 		 453 aa  224  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.112213 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5828  FAD dependent oxidoreductase  35.77 
 
 		 494 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5032  FAD dependent oxidoreductase  35.77 
 
 		 494 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0622047  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2808  oxidoreductase, putative  31.71 
 
 		 455 aa  216  7e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.479983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0254  FAD dependent oxidoreductase  32.9 
 
 		 443 aa  202  9e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0775  putative FAD dependent oxidoreductase  30.95 
 
 		 425 aa  155  9e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.476626 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 		 453 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  30.47 
 
 		 444 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  28.02 
 
 		 427 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  28.28 
 
 		 427 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  28.28 
 
 		 427 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  28.28 
 
 		 427 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  28.28 
 
 		 427 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6675  FAD dependent oxidoreductase  29.59 
 
 		 444 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411958  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  28.28 
 
 		 427 aa  144  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6440  FAD dependent oxidoreductase  29.34 
 
 		 444 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  29.85 
 
 		 425 aa  142  8e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  28.64 
 
 		 427 aa  142  9e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  28.53 
 
 		 427 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  28.22 
 
 		 430 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6091  FAD dependent oxidoreductase  29.61 
 
 		 424 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5908  FAD dependent oxidoreductase  29.88 
 
 		 425 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6273  FAD dependent oxidoreductase  29.08 
 
 		 425 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106536 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  28.39 
 
 		 427 aa  139  7e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  27.98 
 
 		 430 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  27.98 
 
 		 430 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  27.02 
 
 		 428 aa  138  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1148  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 		 433 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0510844 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  28.64 
 
 		 433 aa  138  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1494  FAD dependent oxidoreductase  29.61 
 
 		 424 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250769  hitchhiker  0.00298171 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  29.02 
 
 		 438 aa  137  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  27.75 
 
 		 427 aa  137  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20380  FAD-dependent oxidoreductase  29.6 
 
 		 427 aa  137  5e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  27.02 
 
 		 428 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  27.02 
 
 		 428 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  27.86 
 
 		 428 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1135  FAD dependent oxidoreductase  27.89 
 
 		 428 aa  136  9e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0770  D-amino acid oxidase family protein  28.16 
 
 		 428 aa  135  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451477  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5715  FAD dependent oxidoreductase  31.56 
 
 		 480 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0717  D-amino acid oxidase family protein  28.16 
 
 		 428 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  28.91 
 
 		 441 aa  135  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  26.77 
 
 		 428 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2376  FAD dependent oxidoreductase  28.83 
 
 		 427 aa  134  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  28.32 
 
 		 429 aa  134  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  26.49 
 
 		 428 aa  134  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4331  putative FAD dependent oxidoreductase  29.01 
 
 		 436 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.588243 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  27 
 
 		 426 aa  133  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  28.83 
 
 		 430 aa  133  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  26.52 
 
 		 428 aa  133  6e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0826  FAD dependent oxidoreductase  27.74 
 
 		 437 aa  133  6e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  28.06 
 
 		 435 aa  133  6e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4967  FAD dependent oxidoreductase  30.5 
 
 		 425 aa  133  6.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0475952 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2291  FAD dependent oxidoreductase  29.08 
 
 		 430 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.394886 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  28.84 
 
 		 430 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1019  FAD dependent oxidoreductase  29.63 
 
 		 424 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1037  FAD dependent oxidoreductase  29.29 
 
 		 433 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2032  FAD dependent oxidoreductase  28.08 
 
 		 433 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3113  FAD dependent oxidoreductase  27.88 
 
 		 427 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1839  FAD dependent oxidoreductase  29.16 
 
 		 436 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.131772  normal  0.38658 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0969  FAD dependent oxidoreductase  28.3 
 
 		 434 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1885  hypothetical protein  28.35 
 
 		 464 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  27.67 
 
 		 430 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2810  FAD dependent oxidoreductase  28.79 
 
 		 496 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.73838  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  28.75 
 
 		 437 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0284  putative oxidoreductase  28.68 
 
 		 473 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2946  FAD dependent oxidoreductase  28.78 
 
 		 427 aa  130  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  27.6 
 
 		 433 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0977  FAD dependent oxidoreductase  25.9 
 
 		 428 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  29.1 
 
 		 433 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  27 
 
 		 428 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0812  FAD dependent oxidoreductase  31.16 
 
 		 473 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  27 
 
 		 428 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  27.98 
 
 		 437 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2910  FAD dependent oxidoreductase  29.61 
 
 		 434 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.451548  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1013  FAD dependent oxidoreductase  30.75 
 
 		 464 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.244373 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0378  hypothetical protein  28.08 
 
 		 433 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.18492  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  28.27 
 
 		 433 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4114  FAD dependent oxidoreductase  30.13 
 
 		 427 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.776855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  27.48 
 
 		 428 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  27 
 
 		 428 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  26.52 
 
 		 428 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  25.48 
 
 		 425 aa  128  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  28.12 
 
 		 439 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1274  hypothetical protein  27 
 
 		 428 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  27.93 
 
 		 433 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0347  FAD dependent oxidoreductase  26.9 
 
 		 433 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  25.96 
 
 		 440 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0892  oxidoreductase, FAD-binding  29.36 
 
 		 461 aa  127  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  28.27 
 
 		 433 aa  126  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4676  oxidoreductase, FAD-dependent  26.09 
 
 		 427 aa  125  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4658  FAD dependent oxidoreductase  27.48 
 
 		 449 aa  126  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  28.44 
 
 		 435 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2528  FAD dependent oxidoreductase  27.43 
 
 		 429 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.642393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>