More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2808 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2808  oxidoreductase, putative  100 
 
 		 455 aa  931    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.479983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2743  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  67.59 
 
 		 455 aa  615  1e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0233618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6399  twin-arginine translocation pathway signal  61.22 
 
 		 482 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6396  FAD dependent oxidoreductase  61.31 
 
 		 482 aa  569  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0152469  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6842  FAD dependent oxidoreductase  61.8 
 
 		 465 aa  565  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.133179 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4351  FAD dependent oxidoreductase  62.64 
 
 		 494 aa  551  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4439  FAD dependent oxidoreductase  59.91 
 
 		 453 aa  544  1e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal  0.839002 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4329  FAD dependent oxidoreductase  59.91 
 
 		 453 aa  544  1e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.112213 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5828  FAD dependent oxidoreductase  62.64 
 
 		 494 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5032  FAD dependent oxidoreductase  62.64 
 
 		 494 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0622047  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0254  FAD dependent oxidoreductase  37.9 
 
 		 443 aa  290  2e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2895  FAD dependent oxidoreductase  31.6 
 
 		 432 aa  205  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  29.77 
 
 		 453 aa  173  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  31.39 
 
 		 435 aa  166  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1113  FAD dependent oxidoreductase  31.75 
 
 		 473 aa  161  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0903  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 		 454 aa  160  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0826  FAD dependent oxidoreductase  32.41 
 
 		 437 aa  160  5e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6023  hypothetical protein  30.66 
 
 		 466 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  32.05 
 
 		 428 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  32.05 
 
 		 428 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1987  FAD dependent oxidoreductase  29.9 
 
 		 465 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129488  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  32.05 
 
 		 428 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  31.71 
 
 		 428 aa  156  9e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  31.97 
 
 		 428 aa  155  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  32.01 
 
 		 439 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7089  FAD dependent oxidoreductase  30.29 
 
 		 459 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10152 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  31.79 
 
 		 428 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  31.76 
 
 		 439 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  32.24 
 
 		 428 aa  152  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1274  hypothetical protein  32.49 
 
 		 428 aa  151  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  32.24 
 
 		 428 aa  151  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  32.24 
 
 		 428 aa  151  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5174  FAD dependent oxidoreductase  28.67 
 
 		 456 aa  151  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5715  FAD dependent oxidoreductase  29.88 
 
 		 480 aa  151  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0934  putative oxidoreductase  31.67 
 
 		 440 aa  151  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  31.74 
 
 		 428 aa  150  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5086  FAD dependent oxidoreductase  28.67 
 
 		 456 aa  151  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.973879  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  32.66 
 
 		 429 aa  150  4e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5464  FAD dependent oxidoreductase  29.37 
 
 		 456 aa  150  6e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  32.14 
 
 		 437 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  31.75 
 
 		 438 aa  148  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0390  hypothetical protein  27.56 
 
 		 465 aa  147  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1885  hypothetical protein  27.33 
 
 		 464 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  28.18 
 
 		 424 aa  147  5e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0629  oxidoreductase  32.61 
 
 		 468 aa  147  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0721  oxidoreductase  32.6 
 
 		 468 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.625822  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3143  FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 		 462 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5870  FAD dependent oxidoreductase  27.86 
 
 		 463 aa  146  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.982629  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2015  oxidoreductase  32.6 
 
 		 468 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4658  FAD dependent oxidoreductase  30.67 
 
 		 449 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  31.75 
 
 		 436 aa  146  9e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3163  aminophosphonate oxidoreductase  27.12 
 
 		 462 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0194513 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2530  FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 		 521 aa  146  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  31.74 
 
 		 430 aa  145  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  29.6 
 
 		 428 aa  145  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1896  FAD dependent oxidoreductase  30.02 
 
 		 460 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117344  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2026  FAD dependent oxidoreductase  31.08 
 
 		 460 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.721167  normal  0.721714 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0347  FAD dependent oxidoreductase  30.48 
 
 		 433 aa  144  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0908  FAD dependent oxidoreductase  28.8 
 
 		 460 aa  144  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1934  FAD dependent oxidoreductase  28.64 
 
 		 472 aa  144  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2906  FAD dependent oxidoreductase  29.27 
 
 		 474 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000261915  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0253  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  29.78 
 
 		 460 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6498  FAD dependent oxidoreductase  26.9 
 
 		 491 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.438276  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0721  FAD dependent oxidoreductase  30.79 
 
 		 423 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  29.22 
 
 		 428 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  28.54 
 
 		 440 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3139  aminophosphonate oxidoreductase  26.59 
 
 		 462 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000145397 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0284  putative oxidoreductase  28.36 
 
 		 473 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  30.69 
 
 		 428 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2011  FAD dependent oxidoreductase  31.94 
 
 		 437 aa  141  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5599  FAD dependent oxidoreductase  28.01 
 
 		 424 aa  141  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.637375 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  32.83 
 
 		 423 aa  140  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3857  FAD dependent oxidoreductase  28.81 
 
 		 462 aa  140  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3196  FAD dependent oxidoreductase  26.5 
 
 		 462 aa  140  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  30.67 
 
 		 427 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2458  FAD dependent oxidoreductase  29.81 
 
 		 442 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2387  FAD dependent oxidoreductase  30.64 
 
 		 434 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356658  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2617  FAD dependent oxidoreductase  28.94 
 
 		 460 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523362  normal  0.489524 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3001  FAD dependent oxidoreductase  30.64 
 
 		 434 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  29.16 
 
 		 427 aa  138  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2784  FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 		 483 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  29.85 
 
 		 441 aa  138  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3079  aminophosphonate oxidoreductase  26.06 
 
 		 462 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0471981 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3392  FAD dependent oxidoreductase  26.53 
 
 		 464 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2910  FAD dependent oxidoreductase  31.8 
 
 		 434 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6350  FAD dependent oxidoreductase  31.6 
 
 		 434 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3020  FAD dependent oxidoreductase  30.64 
 
 		 434 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  31.03 
 
 		 427 aa  137  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1899  oxidoreductase  28.27 
 
 		 449 aa  137  4e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.152308 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  30.28 
 
 		 437 aa  137  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5196  FAD dependent oxidoreductase  27.58 
 
 		 486 aa  137  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  28.71 
 
 		 427 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  30.96 
 
 		 433 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  29.47 
 
 		 437 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3166  FAD dependent oxidoreductase  27.46 
 
 		 463 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  28.96 
 
 		 427 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1953  oxidoreductase, FAD-binding  31.98 
 
 		 443 aa  136  8e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  28.97 
 
 		 430 aa  136  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  29.72 
 
 		 430 aa  136  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  29.22 
 
 		 427 aa  136  8e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>