More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5174 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_5174  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
456 aa  907    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5703  FAD dependent oxidoreductase  78.37 
 
 
472 aa  695    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563172  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5086  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
456 aa  907    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.973879  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1109  FAD dependent oxidoreductase  75.88 
 
 
457 aa  695    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.921836 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5464  FAD dependent oxidoreductase  98.68 
 
 
456 aa  896    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1987  FAD dependent oxidoreductase  61.54 
 
 
465 aa  530  1e-149  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129488  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2906  FAD dependent oxidoreductase  61.04 
 
 
474 aa  513  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000261915  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1113  FAD dependent oxidoreductase  60.31 
 
 
473 aa  513  1e-144  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6023  hypothetical protein  57.02 
 
 
466 aa  480  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3857  FAD dependent oxidoreductase  55.73 
 
 
462 aa  481  1e-134  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3062  FAD dependent oxidoreductase  55.08 
 
 
482 aa  474  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30158  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2058  hypothetical protein  55.87 
 
 
480 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00793169  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5713  FAD dependent oxidoreductase  56.03 
 
 
460 aa  431  1e-119  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2026  FAD dependent oxidoreductase  52.4 
 
 
460 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.721167  normal  0.721714 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0253  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  52.17 
 
 
460 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1896  FAD dependent oxidoreductase  51.72 
 
 
460 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117344  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1549  FAD dependent oxidoreductase  49.56 
 
 
472 aa  391  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3231  FAD dependent oxidoreductase  51.69 
 
 
466 aa  390  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.749546  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0622  FAD dependent oxidoreductase  50.82 
 
 
463 aa  378  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1280  FAD dependent oxidoreductase  49.45 
 
 
462 aa  377  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00857441  normal  0.15279 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0950  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 
466 aa  346  4e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.230558  normal  0.1985 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0908  FAD dependent oxidoreductase  42.79 
 
 
460 aa  335  7.999999999999999e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1492  FAD dependent oxidoreductase  47.19 
 
 
462 aa  331  2e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2617  FAD dependent oxidoreductase  42.25 
 
 
460 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523362  normal  0.489524 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2804  FAD dependent oxidoreductase  44.81 
 
 
464 aa  310  4e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0903  FAD dependent oxidoreductase  42.51 
 
 
454 aa  286  4e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2153  FAD dependent oxidoreductase  42.95 
 
 
475 aa  286  7e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.518095  normal  0.441318 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1702  hypothetical protein  42.23 
 
 
468 aa  276  7e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19770  hypothetical protein  43.06 
 
 
468 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2675  FAD dependent oxidoreductase  40.5 
 
 
468 aa  268  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0496606 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0875  FAD dependent oxidoreductase  38.9 
 
 
476 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.120395  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0919  FAD dependent oxidoreductase  39.46 
 
 
475 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.108527  normal  0.544612 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4303  FAD dependent oxidoreductase  39.36 
 
 
468 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3143  FAD dependent oxidoreductase  38.97 
 
 
491 aa  261  1e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0905  FAD dependent oxidoreductase  38.67 
 
 
468 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.358766 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3244  FAD dependent oxidoreductase  38.81 
 
 
491 aa  259  6e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0879  FAD dependent oxidoreductase  38.97 
 
 
491 aa  249  5e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0780  FAD dependent oxidoreductase  37.94 
 
 
469 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.240885  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3678  hypothetical protein  39.4 
 
 
489 aa  243  5e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2910  hypothetical protein  37.42 
 
 
493 aa  238  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1885  hypothetical protein  32.05 
 
 
464 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7089  FAD dependent oxidoreductase  32.08 
 
 
459 aa  196  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.10152 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0699  FAD dependent oxidoreductase  35.75 
 
 
456 aa  195  1e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5715  FAD dependent oxidoreductase  36.34 
 
 
480 aa  192  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  29.74 
 
 
453 aa  186  7e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3392  FAD dependent oxidoreductase  32.95 
 
 
464 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0284  putative oxidoreductase  32.79 
 
 
473 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0812  FAD dependent oxidoreductase  35.5 
 
 
473 aa  176  5e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5870  FAD dependent oxidoreductase  32.04 
 
 
463 aa  170  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.982629  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0390  hypothetical protein  29.63 
 
 
465 aa  167  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3367  aminophosphonate oxidoreductase  32.57 
 
 
463 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.585702  normal  0.425425 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1013  FAD dependent oxidoreductase  31.13 
 
 
464 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.244373 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2549  hypothetical protein  32.34 
 
 
463 aa  166  8e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165188  decreased coverage  0.00741775 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3762  hypothetical protein  31.94 
 
 
465 aa  164  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3170  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 
477 aa  164  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0540221 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2891  FAD dependent oxidoreductase  29.86 
 
 
443 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556451  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3139  aminophosphonate oxidoreductase  32.41 
 
 
462 aa  164  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000145397 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  32.42 
 
 
425 aa  164  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3166  FAD dependent oxidoreductase  32.11 
 
 
463 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.659262  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6842  FAD dependent oxidoreductase  31.45 
 
 
465 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.133179 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3143  FAD dependent oxidoreductase  32.48 
 
 
462 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2530  FAD dependent oxidoreductase  32.33 
 
 
521 aa  162  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44210  putative glycine/D-amino acid oxidase  31.25 
 
 
465 aa  161  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.032969  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2810  FAD dependent oxidoreductase  32.43 
 
 
496 aa  160  5e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.73838  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2220  aminophosphonate oxidoreductase  32.11 
 
 
463 aa  160  6e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3861  FAD dependent oxidoreductase  30.34 
 
 
470 aa  159  9e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  0.682317 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6498  FAD dependent oxidoreductase  31.55 
 
 
491 aa  159  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.438276  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2784  FAD dependent oxidoreductase  29.75 
 
 
483 aa  159  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2905  FAD dependent oxidoreductase  29.26 
 
 
468 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0519998  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2861  FAD dependent oxidoreductase  29.26 
 
 
468 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2277  FAD dependent oxidoreductase  31.07 
 
 
486 aa  158  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3163  aminophosphonate oxidoreductase  32.11 
 
 
462 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0194513 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  31.01 
 
 
424 aa  157  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3861  FAD dependent oxidoreductase  31.44 
 
 
457 aa  156  8e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1934  FAD dependent oxidoreductase  30.65 
 
 
472 aa  156  9e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5599  FAD dependent oxidoreductase  30.72 
 
 
424 aa  156  9e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.637375 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39720  putative amino acid oxidase  32.94 
 
 
466 aa  156  9e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6399  twin-arginine translocation pathway signal  29.4 
 
 
482 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1515  FAD dependent oxidoreductase  30.57 
 
 
463 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3946  hypothetical protein  32.74 
 
 
470 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3079  aminophosphonate oxidoreductase  31.4 
 
 
462 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0471981 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3196  FAD dependent oxidoreductase  32.26 
 
 
462 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000757  glycine/D-amino acid oxidase  29.84 
 
 
466 aa  154  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270345  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4967  FAD dependent oxidoreductase  32.76 
 
 
425 aa  153  7e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0475952 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0095  hypothetical protein  27.89 
 
 
470 aa  152  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0631849  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5196  FAD dependent oxidoreductase  30.12 
 
 
486 aa  152  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6396  FAD dependent oxidoreductase  29.89 
 
 
482 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0152469  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3679  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 
463 aa  150  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3417  FAD dependent oxidoreductase  29.06 
 
 
471 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000555141  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  31.15 
 
 
424 aa  147  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2808  oxidoreductase, putative  28.67 
 
 
455 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.479983  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2743  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  29.16 
 
 
455 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0233618  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4628  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 
477 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0254  FAD dependent oxidoreductase  31.44 
 
 
443 aa  144  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0889  FAD dependent oxidoreductase  30.37 
 
 
487 aa  144  3e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4351  FAD dependent oxidoreductase  29.77 
 
 
494 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4439  FAD dependent oxidoreductase  28.51 
 
 
453 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal  0.839002 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4329  FAD dependent oxidoreductase  28.51 
 
 
453 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.112213 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5032  FAD dependent oxidoreductase  30.23 
 
 
494 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0622047  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5828  FAD dependent oxidoreductase  30.23 
 
 
494 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>