More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0390 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0390  hypothetical protein  100 
 
 		 465 aa  966    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2784  FAD dependent oxidoreductase  50.88 
 
 		 483 aa  509  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5196  FAD dependent oxidoreductase  51.1 
 
 		 486 aa  500  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1515  FAD dependent oxidoreductase  47.08 
 
 		 463 aa  480  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3392  FAD dependent oxidoreductase  37.36 
 
 		 464 aa  350  2e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7089  FAD dependent oxidoreductase  38.11 
 
 		 459 aa  343  2.9999999999999997e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10152 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5715  FAD dependent oxidoreductase  39.46 
 
 		 480 aa  339  7e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0095  hypothetical protein  38.46 
 
 		 470 aa  338  9e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0631849  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1885  hypothetical protein  36.48 
 
 		 464 aa  331  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2905  FAD dependent oxidoreductase  37.44 
 
 		 468 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0519998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2861  FAD dependent oxidoreductase  37.44 
 
 		 468 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0889  FAD dependent oxidoreductase  36.9 
 
 		 487 aa  326  5e-88  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2891  FAD dependent oxidoreductase  37.22 
 
 		 443 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0284  putative oxidoreductase  36.34 
 
 		 473 aa  323  3e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1013  FAD dependent oxidoreductase  35.38 
 
 		 464 aa  311  1e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.244373 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3170  FAD dependent oxidoreductase  35.67 
 
 		 477 aa  300  4e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540221 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3417  FAD dependent oxidoreductase  35.27 
 
 		 471 aa  291  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000555141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4628  FAD dependent oxidoreductase  35.01 
 
 		 477 aa  290  3e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3861  FAD dependent oxidoreductase  32.96 
 
 		 457 aa  264  3e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0903  FAD dependent oxidoreductase  27.56 
 
 		 454 aa  177  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  30.52 
 
 		 453 aa  176  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6399  twin-arginine translocation pathway signal  30.89 
 
 		 482 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3139  aminophosphonate oxidoreductase  29 
 
 		 462 aa  172  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000145397 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1109  FAD dependent oxidoreductase  30.47 
 
 		 457 aa  171  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.921836 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4439  FAD dependent oxidoreductase  29 
 
 		 453 aa  170  5e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal  0.839002 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4329  FAD dependent oxidoreductase  29 
 
 		 453 aa  170  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.112213 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1934  FAD dependent oxidoreductase  29.36 
 
 		 472 aa  168  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3762  hypothetical protein  29.32 
 
 		 465 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5174  FAD dependent oxidoreductase  29.63 
 
 		 456 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5086  FAD dependent oxidoreductase  29.63 
 
 		 456 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.973879  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3231  FAD dependent oxidoreductase  28.86 
 
 		 466 aa  167  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.749546  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2810  FAD dependent oxidoreductase  27.67 
 
 		 496 aa  167  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.73838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3196  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 462 aa  167  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4351  FAD dependent oxidoreductase  30.18 
 
 		 494 aa  166  8e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3062  FAD dependent oxidoreductase  27.31 
 
 		 482 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3143  FAD dependent oxidoreductase  28.11 
 
 		 462 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2530  FAD dependent oxidoreductase  28.11 
 
 		 521 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2922  FAD dependent oxidoreductase  29.72 
 
 		 435 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1264  oxidoreductase  29.72 
 
 		 435 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3163  aminophosphonate oxidoreductase  27.88 
 
 		 462 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0194513 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3079  aminophosphonate oxidoreductase  28.11 
 
 		 462 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0471981 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3679  FAD dependent oxidoreductase  27.35 
 
 		 463 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1280  FAD dependent oxidoreductase  27.96 
 
 		 462 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00857441  normal  0.15279 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3101  FAD dependent oxidoreductase  29.97 
 
 		 435 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3004  FAD dependent oxidoreductase  29.46 
 
 		 435 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5464  FAD dependent oxidoreductase  29.4 
 
 		 456 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0942  FAD dependent oxidoreductase  30.52 
 
 		 435 aa  164  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  29.72 
 
 		 435 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1987  FAD dependent oxidoreductase  29.6 
 
 		 465 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129488  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  29.72 
 
 		 435 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  29.72 
 
 		 435 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6498  FAD dependent oxidoreductase  27.42 
 
 		 491 aa  163  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.438276  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  31.85 
 
 		 436 aa  163  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0969  FAD dependent oxidoreductase  29.53 
 
 		 434 aa  162  9e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  30.79 
 
 		 437 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0622  FAD dependent oxidoreductase  28.26 
 
 		 463 aa  162  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6842  FAD dependent oxidoreductase  28.86 
 
 		 465 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.133179 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  29.67 
 
 		 435 aa  162  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1492  FAD dependent oxidoreductase  28.34 
 
 		 462 aa  162  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0780  FAD dependent oxidoreductase  26.15 
 
 		 469 aa  162  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.240885  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  29.46 
 
 		 435 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  29.55 
 
 		 437 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44210  putative glycine/D-amino acid oxidase  28.41 
 
 		 465 aa  161  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.032969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3014  FAD dependent oxidoreductase  30.5 
 
 		 435 aa  160  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2617  FAD dependent oxidoreductase  27.8 
 
 		 460 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523362  normal  0.489524 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1113  FAD dependent oxidoreductase  30.27 
 
 		 473 aa  159  8e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  30.37 
 
 		 438 aa  159  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  30.29 
 
 		 428 aa  158  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0908  FAD dependent oxidoreductase  27.79 
 
 		 460 aa  158  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6023  hypothetical protein  29.89 
 
 		 466 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0139  FAD dependent oxidoreductase  28.71 
 
 		 464 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.412915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5828  FAD dependent oxidoreductase  30.56 
 
 		 494 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5032  FAD dependent oxidoreductase  30.56 
 
 		 494 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0622047  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5703  FAD dependent oxidoreductase  28.67 
 
 		 472 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2019  FAD dependent oxidoreductase  29.65 
 
 		 473 aa  157  6e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  31.4 
 
 		 427 aa  156  8e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1461  putative oxidoreductase  29.72 
 
 		 454 aa  155  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5870  FAD dependent oxidoreductase  28.28 
 
 		 463 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.982629  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4676  oxidoreductase, FAD-dependent  29.47 
 
 		 427 aa  154  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3503  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 		 466 aa  154  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  29.78 
 
 		 435 aa  154  4e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  29.22 
 
 		 433 aa  154  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  29.12 
 
 		 430 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  29.55 
 
 		 427 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0919  FAD dependent oxidoreductase  29.55 
 
 		 475 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.108527  normal  0.544612 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1549  FAD dependent oxidoreductase  28.01 
 
 		 472 aa  153  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2549  hypothetical protein  29.55 
 
 		 463 aa  153  7e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165188  decreased coverage  0.00741775 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  29.82 
 
 		 427 aa  153  8e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  29.55 
 
 		 427 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04889  FAD dependent oxidoreductase  28.77 
 
 		 466 aa  152  8.999999999999999e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  29.55 
 
 		 427 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 		 435 aa  152  1e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5599  FAD dependent oxidoreductase  29.03 
 
 		 424 aa  152  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.637375 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1127  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 		 435 aa  152  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3861  FAD dependent oxidoreductase  28.02 
 
 		 470 aa  152  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  0.682317 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000757  glycine/D-amino acid oxidase  29.06 
 
 		 466 aa  152  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270345  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6396  FAD dependent oxidoreductase  28.67 
 
 		 482 aa  152  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0152469  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2743  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  27.83 
 
 		 455 aa  151  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0233618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  29.2 
 
 		 436 aa  151  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3166  FAD dependent oxidoreductase  29.55 
 
 		 463 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.659262  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>