More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0095 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0095  hypothetical protein  100 
 
 		 470 aa  978    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0631849  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3392  FAD dependent oxidoreductase  44.28 
 
 		 464 aa  419  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7089  FAD dependent oxidoreductase  45.3 
 
 		 459 aa  418  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10152 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1885  hypothetical protein  43.84 
 
 		 464 aa  404  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0284  putative oxidoreductase  42.67 
 
 		 473 aa  393  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1013  FAD dependent oxidoreductase  42.33 
 
 		 464 aa  383  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.244373 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5715  FAD dependent oxidoreductase  43.23 
 
 		 480 aa  364  2e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3417  FAD dependent oxidoreductase  42.63 
 
 		 471 aa  351  2e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000555141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3170  FAD dependent oxidoreductase  41.12 
 
 		 477 aa  348  1e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540221 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0390  hypothetical protein  38.46 
 
 		 465 aa  338  9e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4628  FAD dependent oxidoreductase  39.26 
 
 		 477 aa  336  3.9999999999999995e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0889  FAD dependent oxidoreductase  37.82 
 
 		 487 aa  334  2e-90  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2905  FAD dependent oxidoreductase  38.19 
 
 		 468 aa  333  4e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0519998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2861  FAD dependent oxidoreductase  38.19 
 
 		 468 aa  333  4e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2891  FAD dependent oxidoreductase  39.04 
 
 		 443 aa  331  2e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1515  FAD dependent oxidoreductase  38.34 
 
 		 463 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2784  FAD dependent oxidoreductase  38.36 
 
 		 483 aa  325  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5196  FAD dependent oxidoreductase  39.38 
 
 		 486 aa  324  3e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3861  FAD dependent oxidoreductase  38.05 
 
 		 457 aa  321  1.9999999999999998e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2810  FAD dependent oxidoreductase  31.13 
 
 		 496 aa  199  9e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.73838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1549  FAD dependent oxidoreductase  29.36 
 
 		 472 aa  189  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0903  FAD dependent oxidoreductase  29.52 
 
 		 454 aa  184  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1280  FAD dependent oxidoreductase  30.61 
 
 		 462 aa  182  1e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00857441  normal  0.15279 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0908  FAD dependent oxidoreductase  30.61 
 
 		 460 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3231  FAD dependent oxidoreductase  29.35 
 
 		 466 aa  179  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.749546  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2026  FAD dependent oxidoreductase  30.84 
 
 		 460 aa  177  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.721167  normal  0.721714 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6023  hypothetical protein  29.77 
 
 		 466 aa  176  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1896  FAD dependent oxidoreductase  29.98 
 
 		 460 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117344  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2058  hypothetical protein  30.04 
 
 		 480 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00793169  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0253  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  29.98 
 
 		 460 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1113  FAD dependent oxidoreductase  28.7 
 
 		 473 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3857  FAD dependent oxidoreductase  30.07 
 
 		 462 aa  174  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1987  FAD dependent oxidoreductase  29 
 
 		 465 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129488  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  28.37 
 
 		 453 aa  171  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3062  FAD dependent oxidoreductase  28.38 
 
 		 482 aa  168  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2906  FAD dependent oxidoreductase  27.95 
 
 		 474 aa  167  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000261915  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5713  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 		 460 aa  167  5e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3762  hypothetical protein  30.26 
 
 		 465 aa  163  6e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5703  FAD dependent oxidoreductase  29.08 
 
 		 472 aa  162  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0622  FAD dependent oxidoreductase  29.31 
 
 		 463 aa  162  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3143  FAD dependent oxidoreductase  28.64 
 
 		 491 aa  160  6e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2617  FAD dependent oxidoreductase  27.67 
 
 		 460 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523362  normal  0.489524 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44210  putative glycine/D-amino acid oxidase  29.46 
 
 		 465 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.032969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0950  FAD dependent oxidoreductase  28.77 
 
 		 466 aa  157  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.230558  normal  0.1985 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1109  FAD dependent oxidoreductase  28.96 
 
 		 457 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.921836 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1934  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 		 472 aa  156  6e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2277  FAD dependent oxidoreductase  30.13 
 
 		 486 aa  155  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0780  FAD dependent oxidoreductase  27.9 
 
 		 469 aa  155  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.240885  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39720  putative amino acid oxidase  31.12 
 
 		 466 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000757  glycine/D-amino acid oxidase  30.5 
 
 		 466 aa  154  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270345  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5464  FAD dependent oxidoreductase  27.83 
 
 		 456 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5174  FAD dependent oxidoreductase  27.89 
 
 		 456 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5086  FAD dependent oxidoreductase  27.89 
 
 		 456 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.973879  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2220  aminophosphonate oxidoreductase  30.07 
 
 		 463 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04889  FAD dependent oxidoreductase  30.51 
 
 		 466 aa  151  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0879  FAD dependent oxidoreductase  27.96 
 
 		 491 aa  149  8e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3244  FAD dependent oxidoreductase  27.74 
 
 		 491 aa  149  8e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3679  FAD dependent oxidoreductase  28.92 
 
 		 463 aa  149  9e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3367  aminophosphonate oxidoreductase  29.85 
 
 		 463 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.585702  normal  0.425425 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6498  FAD dependent oxidoreductase  29.44 
 
 		 491 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.438276  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1492  FAD dependent oxidoreductase  28.18 
 
 		 462 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3166  FAD dependent oxidoreductase  29.57 
 
 		 463 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3678  hypothetical protein  29.86 
 
 		 489 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2549  hypothetical protein  29.72 
 
 		 463 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165188  decreased coverage  0.00741775 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3163  aminophosphonate oxidoreductase  29.44 
 
 		 462 aa  146  9e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0194513 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0875  FAD dependent oxidoreductase  29.91 
 
 		 476 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.120395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2675  FAD dependent oxidoreductase  30.4 
 
 		 468 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496606 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3196  FAD dependent oxidoreductase  28.99 
 
 		 462 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0905  FAD dependent oxidoreductase  30.59 
 
 		 468 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.358766 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3143  FAD dependent oxidoreductase  29.44 
 
 		 462 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3139  aminophosphonate oxidoreductase  28.09 
 
 		 462 aa  143  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000145397 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2530  FAD dependent oxidoreductase  29.64 
 
 		 521 aa  144  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 		 435 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3079  aminophosphonate oxidoreductase  28.7 
 
 		 462 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0471981 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4303  FAD dependent oxidoreductase  29.75 
 
 		 468 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2804  FAD dependent oxidoreductase  28.71 
 
 		 464 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0919  FAD dependent oxidoreductase  29.14 
 
 		 475 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.108527  normal  0.544612 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5870  FAD dependent oxidoreductase  27.56 
 
 		 463 aa  139  8.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.982629  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 		 430 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3223  FAD dependent oxidoreductase  28.63 
 
 		 465 aa  137  5e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.188463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3861  FAD dependent oxidoreductase  26.64 
 
 		 470 aa  137  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  0.682317 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0254  FAD dependent oxidoreductase  27.72 
 
 		 443 aa  136  8e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0812  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 		 473 aa  134  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2153  FAD dependent oxidoreductase  28.87 
 
 		 475 aa  134  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.518095  normal  0.441318 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  28.5 
 
 		 424 aa  134  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19770  hypothetical protein  28.7 
 
 		 468 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 		 425 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6842  FAD dependent oxidoreductase  26.56 
 
 		 465 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.133179 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2743  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  26.53 
 
 		 455 aa  131  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0233618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4439  FAD dependent oxidoreductase  26.12 
 
 		 453 aa  131  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal  0.839002 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4329  FAD dependent oxidoreductase  26.12 
 
 		 453 aa  131  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.112213 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6440  FAD dependent oxidoreductase  24.75 
 
 		 444 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1702  hypothetical protein  28.02 
 
 		 468 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6675  FAD dependent oxidoreductase  24.75 
 
 		 444 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  25.94 
 
 		 424 aa  130  6e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5599  FAD dependent oxidoreductase  26.85 
 
 		 424 aa  130  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.637375 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4351  FAD dependent oxidoreductase  25.92 
 
 		 494 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  25.65 
 
 		 425 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6399  twin-arginine translocation pathway signal  25.77 
 
 		 482 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6273  FAD dependent oxidoreductase  24.43 
 
 		 425 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106536 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>