More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_44210 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2549  hypothetical protein  80.22 
 
 		 463 aa  728    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165188  decreased coverage  0.00741775 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3166  FAD dependent oxidoreductase  80.67 
 
 		 463 aa  733    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3367  aminophosphonate oxidoreductase  80 
 
 		 463 aa  730    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.585702  normal  0.425425 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3679  FAD dependent oxidoreductase  81.11 
 
 		 463 aa  764    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3762  hypothetical protein  96.22 
 
 		 465 aa  879    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2220  aminophosphonate oxidoreductase  80.89 
 
 		 463 aa  739    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44210  putative glycine/D-amino acid oxidase  100 
 
 		 465 aa  940    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.032969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6498  FAD dependent oxidoreductase  66.45 
 
 		 491 aa  615  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.438276  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3223  FAD dependent oxidoreductase  69.23 
 
 		 465 aa  617  1e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.188463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3163  aminophosphonate oxidoreductase  66.45 
 
 		 462 aa  617  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0194513 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2530  FAD dependent oxidoreductase  66.52 
 
 		 521 aa  616  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3143  FAD dependent oxidoreductase  66.67 
 
 		 462 aa  617  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3196  FAD dependent oxidoreductase  65.66 
 
 		 462 aa  608  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3139  aminophosphonate oxidoreductase  65.23 
 
 		 462 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000145397 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3079  aminophosphonate oxidoreductase  64.67 
 
 		 462 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0471981 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5870  FAD dependent oxidoreductase  62.42 
 
 		 463 aa  560  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.982629  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000757  glycine/D-amino acid oxidase  54.96 
 
 		 466 aa  506  9.999999999999999e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270345  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04889  FAD dependent oxidoreductase  53.45 
 
 		 466 aa  489  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39720  putative amino acid oxidase  44.3 
 
 		 466 aa  341  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2277  FAD dependent oxidoreductase  43.79 
 
 		 486 aa  325  1e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0812  FAD dependent oxidoreductase  43.11 
 
 		 473 aa  306  5.0000000000000004e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3946  hypothetical protein  41.43 
 
 		 470 aa  286  5e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0634  FAD dependent oxidoreductase  38.01 
 
 		 476 aa  271  2e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3646  hypothetical protein  39.44 
 
 		 469 aa  232  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0271589 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1885  hypothetical protein  32.31 
 
 		 464 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1549  FAD dependent oxidoreductase  32.71 
 
 		 472 aa  195  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1492  FAD dependent oxidoreductase  35.91 
 
 		 462 aa  194  4e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0903  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 454 aa  192  9e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3857  FAD dependent oxidoreductase  34.27 
 
 		 462 aa  192  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7089  FAD dependent oxidoreductase  33.11 
 
 		 459 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10152 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2810  FAD dependent oxidoreductase  35.24 
 
 		 496 aa  190  5e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.73838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3392  FAD dependent oxidoreductase  32.68 
 
 		 464 aa  184  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1013  FAD dependent oxidoreductase  35.6 
 
 		 464 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.244373 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3062  FAD dependent oxidoreductase  34.57 
 
 		 482 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0622  FAD dependent oxidoreductase  32.52 
 
 		 463 aa  180  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5715  FAD dependent oxidoreductase  34.01 
 
 		 480 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1515  FAD dependent oxidoreductase  32.08 
 
 		 463 aa  177  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0284  putative oxidoreductase  32.22 
 
 		 473 aa  177  5e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2784  FAD dependent oxidoreductase  30.45 
 
 		 483 aa  177  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2617  FAD dependent oxidoreductase  31.55 
 
 		 460 aa  176  8e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523362  normal  0.489524 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1896  FAD dependent oxidoreductase  31.11 
 
 		 460 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117344  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2026  FAD dependent oxidoreductase  31.47 
 
 		 460 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.721167  normal  0.721714 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4676  oxidoreductase, FAD-dependent  31.38 
 
 		 427 aa  175  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0950  FAD dependent oxidoreductase  33.49 
 
 		 466 aa  175  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.230558  normal  0.1985 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2906  FAD dependent oxidoreductase  32.75 
 
 		 474 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000261915  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0253  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  31.11 
 
 		 460 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2153  FAD dependent oxidoreductase  34.73 
 
 		 475 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.518095  normal  0.441318 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6023  hypothetical protein  32.33 
 
 		 466 aa  172  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1987  FAD dependent oxidoreductase  31.81 
 
 		 465 aa  172  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129488  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0908  FAD dependent oxidoreductase  29.46 
 
 		 460 aa  172  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0875  FAD dependent oxidoreductase  32.59 
 
 		 476 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.120395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  29.89 
 
 		 433 aa  170  6e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1113  FAD dependent oxidoreductase  32.23 
 
 		 473 aa  170  6e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1280  FAD dependent oxidoreductase  32.55 
 
 		 462 aa  169  8e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00857441  normal  0.15279 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4303  FAD dependent oxidoreductase  32.81 
 
 		 468 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0905  FAD dependent oxidoreductase  32.29 
 
 		 468 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.358766 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2804  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 		 464 aa  168  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  30.92 
 
 		 439 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1934  FAD dependent oxidoreductase  30.42 
 
 		 472 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  30.68 
 
 		 439 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  30.32 
 
 		 427 aa  166  6.9999999999999995e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0919  FAD dependent oxidoreductase  32.58 
 
 		 475 aa  166  8e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.108527  normal  0.544612 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  28.67 
 
 		 453 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5196  FAD dependent oxidoreductase  29.45 
 
 		 486 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1109  FAD dependent oxidoreductase  31.49 
 
 		 457 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.921836 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3231  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 		 466 aa  163  7e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.749546  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  31.74 
 
 		 441 aa  163  8.000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  30.15 
 
 		 427 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  30.15 
 
 		 427 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  30.15 
 
 		 427 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  31.12 
 
 		 428 aa  162  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  30.15 
 
 		 427 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5174  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 		 456 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0390  hypothetical protein  28.41 
 
 		 465 aa  161  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  31.92 
 
 		 433 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5086  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 		 456 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.973879  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  31.07 
 
 		 426 aa  160  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  30.16 
 
 		 427 aa  160  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0254  FAD dependent oxidoreductase  30.87 
 
 		 443 aa  159  7e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  30.41 
 
 		 437 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  30.48 
 
 		 427 aa  158  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0095  hypothetical protein  29.46 
 
 		 470 aa  158  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0631849  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  29.55 
 
 		 427 aa  157  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1135  FAD dependent oxidoreductase  29.87 
 
 		 428 aa  157  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2032  FAD dependent oxidoreductase  32.2 
 
 		 433 aa  157  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  31.04 
 
 		 431 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  30.81 
 
 		 431 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0889  FAD dependent oxidoreductase  31.94 
 
 		 487 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2058  hypothetical protein  31.41 
 
 		 480 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00793169  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0378  hypothetical protein  32.2 
 
 		 433 aa  157  6e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.18492  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5703  FAD dependent oxidoreductase  30.51 
 
 		 472 aa  156  7e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  29.52 
 
 		 427 aa  156  8e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0778  FAD dependent oxidoreductase  32.11 
 
 		 429 aa  156  8e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0594018  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  30.33 
 
 		 426 aa  156  9e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  30.81 
 
 		 431 aa  156  9e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  29.89 
 
 		 427 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  30.08 
 
 		 426 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  30.08 
 
 		 426 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  30.08 
 
 		 426 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3861  FAD dependent oxidoreductase  29.29 
 
 		 470 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  0.682317 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>