More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1280 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1280  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
462 aa  904    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00857441  normal  0.15279 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1549  FAD dependent oxidoreductase  54.05 
 
 
472 aa  454  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0622  FAD dependent oxidoreductase  52.65 
 
 
463 aa  441  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3231  FAD dependent oxidoreductase  51.8 
 
 
466 aa  419  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.749546  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0908  FAD dependent oxidoreductase  49.67 
 
 
460 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0950  FAD dependent oxidoreductase  53.38 
 
 
466 aa  407  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.230558  normal  0.1985 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1987  FAD dependent oxidoreductase  48.93 
 
 
465 aa  395  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129488  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1109  FAD dependent oxidoreductase  51.58 
 
 
457 aa  396  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.921836 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2617  FAD dependent oxidoreductase  47.27 
 
 
460 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523362  normal  0.489524 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5713  FAD dependent oxidoreductase  51.84 
 
 
460 aa  380  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5174  FAD dependent oxidoreductase  49.45 
 
 
456 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5086  FAD dependent oxidoreductase  49.45 
 
 
456 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.973879  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1492  FAD dependent oxidoreductase  52.24 
 
 
462 aa  372  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5703  FAD dependent oxidoreductase  50.47 
 
 
472 aa  363  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563172  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5464  FAD dependent oxidoreductase  49.45 
 
 
456 aa  362  8e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1113  FAD dependent oxidoreductase  46.02 
 
 
473 aa  355  6.999999999999999e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3857  FAD dependent oxidoreductase  47.66 
 
 
462 aa  353  2.9999999999999997e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3062  FAD dependent oxidoreductase  45.49 
 
 
482 aa  350  3e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30158  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2906  FAD dependent oxidoreductase  46.59 
 
 
474 aa  350  3e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000261915  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6023  hypothetical protein  45.01 
 
 
466 aa  346  6e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2058  hypothetical protein  45.43 
 
 
480 aa  344  2e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00793169  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1896  FAD dependent oxidoreductase  46.28 
 
 
460 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117344  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2026  FAD dependent oxidoreductase  46.44 
 
 
460 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.721167  normal  0.721714 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0253  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  46.05 
 
 
460 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0903  FAD dependent oxidoreductase  46.97 
 
 
454 aa  325  9e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2804  FAD dependent oxidoreductase  44.49 
 
 
464 aa  306  5.0000000000000004e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19770  hypothetical protein  43.9 
 
 
468 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2153  FAD dependent oxidoreductase  42.96 
 
 
475 aa  300  3e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.518095  normal  0.441318 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1702  hypothetical protein  43.43 
 
 
468 aa  297  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0780  FAD dependent oxidoreductase  40.14 
 
 
469 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.240885  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0919  FAD dependent oxidoreductase  41.31 
 
 
475 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.108527  normal  0.544612 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0875  FAD dependent oxidoreductase  40.14 
 
 
476 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.120395  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0905  FAD dependent oxidoreductase  40.14 
 
 
468 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.358766 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4303  FAD dependent oxidoreductase  40.38 
 
 
468 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2675  FAD dependent oxidoreductase  40.61 
 
 
468 aa  277  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0496606 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0699  FAD dependent oxidoreductase  42.5 
 
 
456 aa  272  8.000000000000001e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3143  FAD dependent oxidoreductase  36.81 
 
 
491 aa  269  7e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0879  FAD dependent oxidoreductase  36.6 
 
 
491 aa  262  8e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3244  FAD dependent oxidoreductase  35.96 
 
 
491 aa  260  3e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3678  hypothetical protein  36.22 
 
 
489 aa  248  2e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2910  hypothetical protein  38.72 
 
 
493 aa  248  2e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  31.84 
 
 
453 aa  209  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7089  FAD dependent oxidoreductase  32.46 
 
 
459 aa  202  9e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.10152 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2891  FAD dependent oxidoreductase  34.53 
 
 
443 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556451  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0284  putative oxidoreductase  32.79 
 
 
473 aa  199  7e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1885  hypothetical protein  32.63 
 
 
464 aa  199  9e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2905  FAD dependent oxidoreductase  33.64 
 
 
468 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0519998  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2861  FAD dependent oxidoreductase  33.64 
 
 
468 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3861  FAD dependent oxidoreductase  36.58 
 
 
457 aa  191  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3392  FAD dependent oxidoreductase  34.36 
 
 
464 aa  190  4e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1013  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
464 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.244373 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0095  hypothetical protein  30.61 
 
 
470 aa  182  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0631849  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1934  FAD dependent oxidoreductase  31.87 
 
 
472 aa  178  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3163  aminophosphonate oxidoreductase  32.95 
 
 
462 aa  177  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0194513 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3143  FAD dependent oxidoreductase  33.66 
 
 
462 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3367  aminophosphonate oxidoreductase  33.81 
 
 
463 aa  176  8e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.585702  normal  0.425425 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2530  FAD dependent oxidoreductase  32.72 
 
 
521 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0812  FAD dependent oxidoreductase  35.18 
 
 
473 aa  176  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2784  FAD dependent oxidoreductase  30.73 
 
 
483 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2220  aminophosphonate oxidoreductase  33.49 
 
 
463 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3861  FAD dependent oxidoreductase  30.77 
 
 
470 aa  173  6.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  0.682317 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3166  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 
463 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.659262  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3079  aminophosphonate oxidoreductase  33.17 
 
 
462 aa  171  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0471981 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  32.66 
 
 
427 aa  171  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  32.91 
 
 
427 aa  171  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  32.66 
 
 
427 aa  170  5e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6498  FAD dependent oxidoreductase  32.79 
 
 
491 aa  170  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.438276  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44210  putative glycine/D-amino acid oxidase  32.55 
 
 
465 aa  169  6e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.032969  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  32.66 
 
 
427 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2549  hypothetical protein  32.93 
 
 
463 aa  169  8e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165188  decreased coverage  0.00741775 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1515  FAD dependent oxidoreductase  32.08 
 
 
463 aa  168  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3417  FAD dependent oxidoreductase  31.37 
 
 
471 aa  168  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000555141  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5196  FAD dependent oxidoreductase  31.29 
 
 
486 aa  168  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5715  FAD dependent oxidoreductase  31.53 
 
 
480 aa  167  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3170  FAD dependent oxidoreductase  31.04 
 
 
477 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0540221 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0717  D-amino acid oxidase family protein  33.5 
 
 
428 aa  167  4e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2235  FAD dependent oxidoreductase  32.29 
 
 
447 aa  167  4e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.622258  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2810  FAD dependent oxidoreductase  31.1 
 
 
496 aa  167  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.73838  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0770  D-amino acid oxidase family protein  33.5 
 
 
428 aa  167  5e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451477  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3762  hypothetical protein  32.55 
 
 
465 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2946  FAD dependent oxidoreductase  35.17 
 
 
427 aa  166  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0390  hypothetical protein  27.96 
 
 
465 aa  165  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5870  FAD dependent oxidoreductase  31.83 
 
 
463 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.982629  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  35.84 
 
 
432 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  33.87 
 
 
435 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3196  FAD dependent oxidoreductase  32.69 
 
 
462 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  32.66 
 
 
427 aa  163  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3139  aminophosphonate oxidoreductase  32.03 
 
 
462 aa  162  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000145397 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  32.16 
 
 
427 aa  161  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  34.41 
 
 
425 aa  160  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  32.23 
 
 
427 aa  159  7e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  34.1 
 
 
424 aa  158  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5908  FAD dependent oxidoreductase  32.66 
 
 
425 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  32.29 
 
 
427 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  29.19 
 
 
433 aa  157  4e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  36.04 
 
 
434 aa  156  7e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  33.33 
 
 
424 aa  155  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  31.46 
 
 
427 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3951  FAD dependent oxidoreductase  31.39 
 
 
434 aa  155  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00431943  normal  0.112468 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  29.22 
 
 
428 aa  155  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>