More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2675 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0875  FAD dependent oxidoreductase  75.43 
 
 		 476 aa  721    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.120395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2153  FAD dependent oxidoreductase  69.59 
 
 		 475 aa  655    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.518095  normal  0.441318 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19770  hypothetical protein  71.31 
 
 		 468 aa  677    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2675  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 468 aa  961    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496606 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4303  FAD dependent oxidoreductase  74.57 
 
 		 468 aa  714    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0919  FAD dependent oxidoreductase  74.57 
 
 		 475 aa  711    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.108527  normal  0.544612 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0905  FAD dependent oxidoreductase  75.21 
 
 		 468 aa  718    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.358766 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1702  hypothetical protein  70.24 
 
 		 468 aa  665    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3143  FAD dependent oxidoreductase  48.15 
 
 		 491 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3244  FAD dependent oxidoreductase  48.51 
 
 		 491 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0780  FAD dependent oxidoreductase  43.94 
 
 		 469 aa  395  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.240885  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0879  FAD dependent oxidoreductase  47.74 
 
 		 491 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3678  hypothetical protein  48.55 
 
 		 489 aa  382  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3231  FAD dependent oxidoreductase  43.79 
 
 		 466 aa  336  5e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.749546  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2910  hypothetical protein  42.95 
 
 		 493 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1549  FAD dependent oxidoreductase  40.91 
 
 		 472 aa  311  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0622  FAD dependent oxidoreductase  40.27 
 
 		 463 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0950  FAD dependent oxidoreductase  42.82 
 
 		 466 aa  300  4e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.230558  normal  0.1985 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1113  FAD dependent oxidoreductase  40.77 
 
 		 473 aa  300  4e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1987  FAD dependent oxidoreductase  40.96 
 
 		 465 aa  300  5e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129488  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6023  hypothetical protein  40.68 
 
 		 466 aa  297  3e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1280  FAD dependent oxidoreductase  40.61 
 
 		 462 aa  292  9e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00857441  normal  0.15279 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5713  FAD dependent oxidoreductase  41.15 
 
 		 460 aa  288  2e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2058  hypothetical protein  40.04 
 
 		 480 aa  286  7e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00793169  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0908  FAD dependent oxidoreductase  38.66 
 
 		 460 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2906  FAD dependent oxidoreductase  39.41 
 
 		 474 aa  282  7.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000261915  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5174  FAD dependent oxidoreductase  40.5 
 
 		 456 aa  282  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5086  FAD dependent oxidoreductase  40.5 
 
 		 456 aa  282  1e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.973879  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0903  FAD dependent oxidoreductase  39.66 
 
 		 454 aa  280  3e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2026  FAD dependent oxidoreductase  38.51 
 
 		 460 aa  279  6e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.721167  normal  0.721714 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0253  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  38.07 
 
 		 460 aa  279  1e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5464  FAD dependent oxidoreductase  40.5 
 
 		 456 aa  276  7e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1896  FAD dependent oxidoreductase  37.64 
 
 		 460 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117344  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1492  FAD dependent oxidoreductase  40.18 
 
 		 462 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3857  FAD dependent oxidoreductase  37.58 
 
 		 462 aa  272  1e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1109  FAD dependent oxidoreductase  37.95 
 
 		 457 aa  269  7e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.921836 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5703  FAD dependent oxidoreductase  37.28 
 
 		 472 aa  268  1e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563172  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3062  FAD dependent oxidoreductase  37.76 
 
 		 482 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2617  FAD dependent oxidoreductase  38.53 
 
 		 460 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523362  normal  0.489524 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2804  FAD dependent oxidoreductase  37.56 
 
 		 464 aa  239  9e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0699  FAD dependent oxidoreductase  35.35 
 
 		 456 aa  196  8.000000000000001e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7089  FAD dependent oxidoreductase  29.98 
 
 		 459 aa  181  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10152 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6498  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 		 491 aa  172  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.438276  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0284  putative oxidoreductase  29.59 
 
 		 473 aa  171  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3367  aminophosphonate oxidoreductase  32.1 
 
 		 463 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.585702  normal  0.425425 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5715  FAD dependent oxidoreductase  31.39 
 
 		 480 aa  171  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  31.54 
 
 		 453 aa  169  9e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2549  hypothetical protein  32.52 
 
 		 463 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165188  decreased coverage  0.00741775 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3139  aminophosphonate oxidoreductase  32.74 
 
 		 462 aa  169  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000145397 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3166  FAD dependent oxidoreductase  32.52 
 
 		 463 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3163  aminophosphonate oxidoreductase  33.19 
 
 		 462 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0194513 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2784  FAD dependent oxidoreductase  30.54 
 
 		 483 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2530  FAD dependent oxidoreductase  32.84 
 
 		 521 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2220  aminophosphonate oxidoreductase  31.24 
 
 		 463 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0390  hypothetical protein  29.48 
 
 		 465 aa  163  5.0000000000000005e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3143  FAD dependent oxidoreductase  33.63 
 
 		 462 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1934  FAD dependent oxidoreductase  30.19 
 
 		 472 aa  162  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3392  FAD dependent oxidoreductase  30.86 
 
 		 464 aa  161  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3762  hypothetical protein  32.37 
 
 		 465 aa  160  7e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3679  FAD dependent oxidoreductase  31.48 
 
 		 463 aa  159  8e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1885  hypothetical protein  29.15 
 
 		 464 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3196  FAD dependent oxidoreductase  32.52 
 
 		 462 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3946  hypothetical protein  30.17 
 
 		 470 aa  158  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44210  putative glycine/D-amino acid oxidase  32.15 
 
 		 465 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.032969  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0095  hypothetical protein  30.4 
 
 		 470 aa  157  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0631849  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3861  FAD dependent oxidoreductase  30.96 
 
 		 457 aa  157  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3079  aminophosphonate oxidoreductase  31.84 
 
 		 462 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0471981 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0892  oxidoreductase, FAD-binding  33.51 
 
 		 461 aa  155  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  30.65 
 
 		 425 aa  152  8.999999999999999e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0770  D-amino acid oxidase family protein  30.2 
 
 		 428 aa  152  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451477  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0717  D-amino acid oxidase family protein  30.2 
 
 		 428 aa  152  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2910  FAD dependent oxidoreductase  30.38 
 
 		 434 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  30.9 
 
 		 425 aa  151  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2032  FAD dependent oxidoreductase  30.87 
 
 		 433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1013  FAD dependent oxidoreductase  30.22 
 
 		 464 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.244373 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2235  FAD dependent oxidoreductase  31.76 
 
 		 447 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.622258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2015  oxidoreductase  32.21 
 
 		 468 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5599  FAD dependent oxidoreductase  32.89 
 
 		 424 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.637375 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2995  FAD dependent oxidoreductase  30.79 
 
 		 433 aa  147  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0378  hypothetical protein  30.61 
 
 		 433 aa  147  5e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.18492  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2387  FAD dependent oxidoreductase  30.49 
 
 		 434 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356658  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3001  FAD dependent oxidoreductase  30.49 
 
 		 434 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  30.19 
 
 		 433 aa  147  5e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0721  oxidoreductase  32.21 
 
 		 468 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.625822  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  32.51 
 
 		 424 aa  146  8.000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0812  FAD dependent oxidoreductase  30.04 
 
 		 473 aa  146  9e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5196  FAD dependent oxidoreductase  29.05 
 
 		 486 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3020  FAD dependent oxidoreductase  30.49 
 
 		 434 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5870  FAD dependent oxidoreductase  29.49 
 
 		 463 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.982629  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6350  FAD dependent oxidoreductase  30.75 
 
 		 434 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0629  oxidoreductase  32.21 
 
 		 468 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1515  FAD dependent oxidoreductase  28.51 
 
 		 463 aa  145  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3048  FAD dependent oxidoreductase  30.08 
 
 		 439 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  31.19 
 
 		 424 aa  143  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2636  FAD dependent oxidoreductase  29.93 
 
 		 429 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.773353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  30.63 
 
 		 423 aa  142  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2891  FAD dependent oxidoreductase  27.96 
 
 		 443 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3417  FAD dependent oxidoreductase  28.96 
 
 		 471 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000555141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6396  FAD dependent oxidoreductase  29.8 
 
 		 482 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0152469  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4967  FAD dependent oxidoreductase  32.35 
 
 		 425 aa  141  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0475952 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>