More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2153 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0875  FAD dependent oxidoreductase  67.65 
 
 		 476 aa  639    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.120395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2675  FAD dependent oxidoreductase  69.59 
 
 		 468 aa  655    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496606 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4303  FAD dependent oxidoreductase  68.59 
 
 		 468 aa  641    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1702  hypothetical protein  73.08 
 
 		 468 aa  672    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2153  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 475 aa  955    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.518095  normal  0.441318 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0919  FAD dependent oxidoreductase  69.05 
 
 		 475 aa  647    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.108527  normal  0.544612 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0905  FAD dependent oxidoreductase  67.95 
 
 		 468 aa  636    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.358766 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19770  hypothetical protein  73.29 
 
 		 468 aa  676    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3244  FAD dependent oxidoreductase  48.05 
 
 		 491 aa  397  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3143  FAD dependent oxidoreductase  48.06 
 
 		 491 aa  395  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0879  FAD dependent oxidoreductase  47.85 
 
 		 491 aa  385  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3678  hypothetical protein  48.45 
 
 		 489 aa  379  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0780  FAD dependent oxidoreductase  43.79 
 
 		 469 aa  374  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.240885  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1549  FAD dependent oxidoreductase  46.05 
 
 		 472 aa  348  1e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3231  FAD dependent oxidoreductase  45.21 
 
 		 466 aa  339  7e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.749546  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0622  FAD dependent oxidoreductase  41.61 
 
 		 463 aa  324  2e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1987  FAD dependent oxidoreductase  43.08 
 
 		 465 aa  322  7e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129488  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2910  hypothetical protein  45.04 
 
 		 493 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6023  hypothetical protein  43.28 
 
 		 466 aa  316  5e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1280  FAD dependent oxidoreductase  42.96 
 
 		 462 aa  316  7e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00857441  normal  0.15279 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1113  FAD dependent oxidoreductase  41.99 
 
 		 473 aa  312  6.999999999999999e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2906  FAD dependent oxidoreductase  43.24 
 
 		 474 aa  311  1e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000261915  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0950  FAD dependent oxidoreductase  45.65 
 
 		 466 aa  301  2e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.230558  normal  0.1985 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5174  FAD dependent oxidoreductase  42.95 
 
 		 456 aa  300  4e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5086  FAD dependent oxidoreductase  42.95 
 
 		 456 aa  300  4e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.973879  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5713  FAD dependent oxidoreductase  41.85 
 
 		 460 aa  298  1e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0253  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  40.69 
 
 		 460 aa  294  3e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1896  FAD dependent oxidoreductase  40.69 
 
 		 460 aa  294  3e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117344  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2026  FAD dependent oxidoreductase  40.65 
 
 		 460 aa  293  4e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.721167  normal  0.721714 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0903  FAD dependent oxidoreductase  42.52 
 
 		 454 aa  293  4e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1492  FAD dependent oxidoreductase  43.12 
 
 		 462 aa  291  1e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5464  FAD dependent oxidoreductase  43.61 
 
 		 456 aa  290  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3857  FAD dependent oxidoreductase  43.31 
 
 		 462 aa  288  1e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0908  FAD dependent oxidoreductase  39.34 
 
 		 460 aa  288  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1109  FAD dependent oxidoreductase  41.88 
 
 		 457 aa  286  4e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.921836 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2617  FAD dependent oxidoreductase  40.6 
 
 		 460 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523362  normal  0.489524 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5703  FAD dependent oxidoreductase  41.06 
 
 		 472 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2058  hypothetical protein  39.47 
 
 		 480 aa  281  3e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00793169  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3062  FAD dependent oxidoreductase  40.32 
 
 		 482 aa  280  5e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2804  FAD dependent oxidoreductase  40.68 
 
 		 464 aa  244  3e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0699  FAD dependent oxidoreductase  37.84 
 
 		 456 aa  190  4e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44210  putative glycine/D-amino acid oxidase  34.73 
 
 		 465 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.032969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3163  aminophosphonate oxidoreductase  33.99 
 
 		 462 aa  186  9e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0194513 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6498  FAD dependent oxidoreductase  33.19 
 
 		 491 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.438276  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3143  FAD dependent oxidoreductase  34.21 
 
 		 462 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2530  FAD dependent oxidoreductase  34.62 
 
 		 521 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3139  aminophosphonate oxidoreductase  34.62 
 
 		 462 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000145397 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3762  hypothetical protein  34.96 
 
 		 465 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2549  hypothetical protein  33.78 
 
 		 463 aa  181  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165188  decreased coverage  0.00741775 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1885  hypothetical protein  31.09 
 
 		 464 aa  180  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3166  FAD dependent oxidoreductase  33.11 
 
 		 463 aa  179  9e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0284  putative oxidoreductase  32.26 
 
 		 473 aa  178  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5870  FAD dependent oxidoreductase  32.52 
 
 		 463 aa  179  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.982629  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3079  aminophosphonate oxidoreductase  33.94 
 
 		 462 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0471981 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2220  aminophosphonate oxidoreductase  33.11 
 
 		 463 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3367  aminophosphonate oxidoreductase  33.78 
 
 		 463 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.585702  normal  0.425425 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3196  FAD dependent oxidoreductase  33.77 
 
 		 462 aa  177  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7089  FAD dependent oxidoreductase  31.9 
 
 		 459 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10152 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3679  FAD dependent oxidoreductase  32.1 
 
 		 463 aa  172  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2891  FAD dependent oxidoreductase  32.88 
 
 		 443 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2905  FAD dependent oxidoreductase  32.88 
 
 		 468 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0519998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2861  FAD dependent oxidoreductase  32.88 
 
 		 468 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5715  FAD dependent oxidoreductase  32.63 
 
 		 480 aa  167  5e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4628  FAD dependent oxidoreductase  32.65 
 
 		 477 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3946  hypothetical protein  32.68 
 
 		 470 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  30.81 
 
 		 453 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04889  FAD dependent oxidoreductase  31.36 
 
 		 466 aa  164  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3392  FAD dependent oxidoreductase  32.18 
 
 		 464 aa  162  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000757  glycine/D-amino acid oxidase  30.51 
 
 		 466 aa  159  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39720  putative amino acid oxidase  31.4 
 
 		 466 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1934  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 		 472 aa  158  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3861  FAD dependent oxidoreductase  29.6 
 
 		 470 aa  157  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  0.682317 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5196  FAD dependent oxidoreductase  31.07 
 
 		 486 aa  157  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2784  FAD dependent oxidoreductase  30.58 
 
 		 483 aa  156  9e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1515  FAD dependent oxidoreductase  29.79 
 
 		 463 aa  156  9e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0390  hypothetical protein  26.29 
 
 		 465 aa  155  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2277  FAD dependent oxidoreductase  31.06 
 
 		 486 aa  155  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3417  FAD dependent oxidoreductase  30.54 
 
 		 471 aa  154  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000555141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3861  FAD dependent oxidoreductase  31.54 
 
 		 457 aa  154  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3951  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 434 aa  153  5.9999999999999996e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00431943  normal  0.112468 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0717  D-amino acid oxidase family protein  32.81 
 
 		 428 aa  153  7e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  34.97 
 
 		 437 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0770  D-amino acid oxidase family protein  32.81 
 
 		 428 aa  152  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451477  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1124  FAD dependent oxidoreductase  32.11 
 
 		 453 aa  152  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.564615  normal  0.27217 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3170  FAD dependent oxidoreductase  29.91 
 
 		 477 aa  150  6e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540221 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0378  hypothetical protein  32.81 
 
 		 433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.18492  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  34.43 
 
 		 433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1839  FAD dependent oxidoreductase  33.57 
 
 		 436 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.131772  normal  0.38658 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2032  FAD dependent oxidoreductase  32.8 
 
 		 433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  34.42 
 
 		 439 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0095  hypothetical protein  28.87 
 
 		 470 aa  148  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0631849  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  34.02 
 
 		 427 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  31.63 
 
 		 427 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  32.25 
 
 		 435 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  34.46 
 
 		 439 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  32.25 
 
 		 435 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  32 
 
 		 435 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1013  FAD dependent oxidoreductase  30.2 
 
 		 464 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.244373 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2297  FAD dependent oxidoreductase  32.35 
 
 		 446 aa  147  6e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  31.38 
 
 		 427 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>