More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3231 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3231  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 466 aa  911    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.749546  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1549  FAD dependent oxidoreductase  61.98 
 
 		 472 aa  530  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0622  FAD dependent oxidoreductase  54.44 
 
 		 463 aa  475  1e-133  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0908  FAD dependent oxidoreductase  54.79 
 
 		 460 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2617  FAD dependent oxidoreductase  52.6 
 
 		 460 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523362  normal  0.489524 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0950  FAD dependent oxidoreductase  54.87 
 
 		 466 aa  422  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.230558  normal  0.1985 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1280  FAD dependent oxidoreductase  51.8 
 
 		 462 aa  419  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00857441  normal  0.15279 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1987  FAD dependent oxidoreductase  52.2 
 
 		 465 aa  421  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129488  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1492  FAD dependent oxidoreductase  55.04 
 
 		 462 aa  419  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5713  FAD dependent oxidoreductase  53.44 
 
 		 460 aa  411  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1109  FAD dependent oxidoreductase  50.55 
 
 		 457 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.921836 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2906  FAD dependent oxidoreductase  53.4 
 
 		 474 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000261915  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5174  FAD dependent oxidoreductase  51.69 
 
 		 456 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5086  FAD dependent oxidoreductase  51.69 
 
 		 456 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.973879  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5703  FAD dependent oxidoreductase  51.61 
 
 		 472 aa  382  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1113  FAD dependent oxidoreductase  50.44 
 
 		 473 aa  381  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5464  FAD dependent oxidoreductase  50.99 
 
 		 456 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2058  hypothetical protein  49.1 
 
 		 480 aa  376  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00793169  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6023  hypothetical protein  49.12 
 
 		 466 aa  378  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1896  FAD dependent oxidoreductase  47.63 
 
 		 460 aa  364  2e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117344  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0253  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  47.4 
 
 		 460 aa  361  2e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0903  FAD dependent oxidoreductase  48.04 
 
 		 454 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3857  FAD dependent oxidoreductase  49.31 
 
 		 462 aa  356  5e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2026  FAD dependent oxidoreductase  46.78 
 
 		 460 aa  355  8.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.721167  normal  0.721714 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3062  FAD dependent oxidoreductase  48.83 
 
 		 482 aa  354  2e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2153  FAD dependent oxidoreductase  45.21 
 
 		 475 aa  323  5e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.518095  normal  0.441318 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2675  FAD dependent oxidoreductase  43.79 
 
 		 468 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496606 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19770  hypothetical protein  45.91 
 
 		 468 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1702  hypothetical protein  45 
 
 		 468 aa  318  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0780  FAD dependent oxidoreductase  43.89 
 
 		 469 aa  318  2e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.240885  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0875  FAD dependent oxidoreductase  43.86 
 
 		 476 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.120395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0905  FAD dependent oxidoreductase  43.64 
 
 		 468 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.358766 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4303  FAD dependent oxidoreductase  43.86 
 
 		 468 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0919  FAD dependent oxidoreductase  44.09 
 
 		 475 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.108527  normal  0.544612 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3244  FAD dependent oxidoreductase  43.06 
 
 		 491 aa  299  6e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3143  FAD dependent oxidoreductase  42.3 
 
 		 491 aa  296  5e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0879  FAD dependent oxidoreductase  42.76 
 
 		 491 aa  290  3e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2804  FAD dependent oxidoreductase  44.2 
 
 		 464 aa  289  7e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3678  hypothetical protein  41.57 
 
 		 489 aa  266  4e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0699  FAD dependent oxidoreductase  41.75 
 
 		 456 aa  261  2e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2910  hypothetical protein  41.46 
 
 		 493 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3861  FAD dependent oxidoreductase  37.68 
 
 		 457 aa  216  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3392  FAD dependent oxidoreductase  37.41 
 
 		 464 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0284  putative oxidoreductase  34.55 
 
 		 473 aa  211  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1885  hypothetical protein  34.54 
 
 		 464 aa  206  8e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7089  FAD dependent oxidoreductase  32.96 
 
 		 459 aa  200  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10152 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1013  FAD dependent oxidoreductase  34.74 
 
 		 464 aa  196  8.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.244373 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6498  FAD dependent oxidoreductase  34.64 
 
 		 491 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.438276  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3079  aminophosphonate oxidoreductase  34.86 
 
 		 462 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0471981 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2530  FAD dependent oxidoreductase  35.08 
 
 		 521 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3143  FAD dependent oxidoreductase  35.09 
 
 		 462 aa  189  9e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2891  FAD dependent oxidoreductase  33.18 
 
 		 443 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2861  FAD dependent oxidoreductase  32.74 
 
 		 468 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2905  FAD dependent oxidoreductase  32.74 
 
 		 468 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0519998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3196  FAD dependent oxidoreductase  34.86 
 
 		 462 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3163  aminophosphonate oxidoreductase  34.43 
 
 		 462 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0194513 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5715  FAD dependent oxidoreductase  34.77 
 
 		 480 aa  182  9.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  29.02 
 
 		 453 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2810  FAD dependent oxidoreductase  32.61 
 
 		 496 aa  182  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.73838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3679  FAD dependent oxidoreductase  32.24 
 
 		 463 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0095  hypothetical protein  29.35 
 
 		 470 aa  179  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0631849  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1934  FAD dependent oxidoreductase  34.3 
 
 		 472 aa  178  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3417  FAD dependent oxidoreductase  32.37 
 
 		 471 aa  177  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000555141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0889  FAD dependent oxidoreductase  35.53 
 
 		 487 aa  177  3e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2220  aminophosphonate oxidoreductase  33.33 
 
 		 463 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4628  FAD dependent oxidoreductase  32.56 
 
 		 477 aa  176  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3139  aminophosphonate oxidoreductase  32.52 
 
 		 462 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000145397 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3367  aminophosphonate oxidoreductase  32.84 
 
 		 463 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.585702  normal  0.425425 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1515  FAD dependent oxidoreductase  31.59 
 
 		 463 aa  170  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3170  FAD dependent oxidoreductase  30.52 
 
 		 477 aa  169  8e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540221 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3762  hypothetical protein  33.01 
 
 		 465 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2549  hypothetical protein  32.35 
 
 		 463 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165188  decreased coverage  0.00741775 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0390  hypothetical protein  28.86 
 
 		 465 aa  167  4e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3166  FAD dependent oxidoreductase  32.11 
 
 		 463 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5196  FAD dependent oxidoreductase  30.99 
 
 		 486 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44210  putative glycine/D-amino acid oxidase  31.25 
 
 		 465 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.032969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2784  FAD dependent oxidoreductase  29.77 
 
 		 483 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3946  hypothetical protein  33.19 
 
 		 470 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2277  FAD dependent oxidoreductase  32.24 
 
 		 486 aa  159  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4280  FAD dependent oxidoreductase  33.81 
 
 		 441 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.372193 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0802  FAD dependent oxidoreductase  35.05 
 
 		 429 aa  158  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688851  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3951  FAD dependent oxidoreductase  31.67 
 
 		 434 aa  158  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00431943  normal  0.112468 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3861  FAD dependent oxidoreductase  32.81 
 
 		 470 aa  158  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  0.682317 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4903  FAD dependent oxidoreductase  34.97 
 
 		 429 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.667356 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3463  FAD dependent oxidoreductase  34.97 
 
 		 429 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  37.77 
 
 		 432 aa  157  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  29.9 
 
 		 428 aa  157  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5599  FAD dependent oxidoreductase  33.57 
 
 		 424 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.637375 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5383  FAD dependent oxidoreductase  34.46 
 
 		 429 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.199839  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3113  FAD dependent oxidoreductase  32.66 
 
 		 427 aa  153  5e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3719  FAD dependent oxidoreductase  34.26 
 
 		 429 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477322  normal  0.0527853 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4808  FAD dependent oxidoreductase  33.5 
 
 		 429 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5870  FAD dependent oxidoreductase  30.95 
 
 		 463 aa  153  8e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.982629  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  32.69 
 
 		 438 aa  151  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  32.51 
 
 		 433 aa  150  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  31.28 
 
 		 437 aa  150  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39720  putative amino acid oxidase  31.14 
 
 		 466 aa  150  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000757  glycine/D-amino acid oxidase  29.08 
 
 		 466 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270345  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  31.47 
 
 		 424 aa  149  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  35.77 
 
 		 434 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>