More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2910 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2910  hypothetical protein  100 
 
 		 493 aa  996    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3143  FAD dependent oxidoreductase  51 
 
 		 491 aa  457  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3244  FAD dependent oxidoreductase  50.6 
 
 		 491 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0879  FAD dependent oxidoreductase  50.4 
 
 		 491 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3678  hypothetical protein  51.63 
 
 		 489 aa  428  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1702  hypothetical protein  45.34 
 
 		 468 aa  363  3e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19770  hypothetical protein  45.34 
 
 		 468 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2153  FAD dependent oxidoreductase  45.04 
 
 		 475 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.518095  normal  0.441318 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0875  FAD dependent oxidoreductase  43.15 
 
 		 476 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.120395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2675  FAD dependent oxidoreductase  43.78 
 
 		 468 aa  348  1e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496606 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0905  FAD dependent oxidoreductase  42.95 
 
 		 468 aa  347  4e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.358766 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4303  FAD dependent oxidoreductase  43.36 
 
 		 468 aa  346  6e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0919  FAD dependent oxidoreductase  43.15 
 
 		 475 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.108527  normal  0.544612 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0780  FAD dependent oxidoreductase  41.75 
 
 		 469 aa  336  5e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.240885  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3231  FAD dependent oxidoreductase  41.46 
 
 		 466 aa  298  1e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.749546  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1549  FAD dependent oxidoreductase  41.59 
 
 		 472 aa  298  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1987  FAD dependent oxidoreductase  39.96 
 
 		 465 aa  296  5e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129488  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6023  hypothetical protein  38.59 
 
 		 466 aa  285  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1280  FAD dependent oxidoreductase  38.72 
 
 		 462 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00857441  normal  0.15279 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0622  FAD dependent oxidoreductase  35.61 
 
 		 463 aa  279  9e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5174  FAD dependent oxidoreductase  37.63 
 
 		 456 aa  272  1e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5086  FAD dependent oxidoreductase  37.63 
 
 		 456 aa  272  1e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.973879  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2058  hypothetical protein  37.69 
 
 		 480 aa  270  4e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00793169  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1109  FAD dependent oxidoreductase  39.28 
 
 		 457 aa  270  5e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.921836 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5464  FAD dependent oxidoreductase  37.69 
 
 		 456 aa  270  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2906  FAD dependent oxidoreductase  38.13 
 
 		 474 aa  268  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000261915  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5713  FAD dependent oxidoreductase  38.17 
 
 		 460 aa  265  2e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0950  FAD dependent oxidoreductase  39.66 
 
 		 466 aa  264  3e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.230558  normal  0.1985 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3062  FAD dependent oxidoreductase  36.74 
 
 		 482 aa  259  7e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0908  FAD dependent oxidoreductase  37.74 
 
 		 460 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1896  FAD dependent oxidoreductase  37.39 
 
 		 460 aa  249  9e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117344  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0253  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  37.17 
 
 		 460 aa  247  3e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1113  FAD dependent oxidoreductase  35.21 
 
 		 473 aa  245  9.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1492  FAD dependent oxidoreductase  35.54 
 
 		 462 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2026  FAD dependent oxidoreductase  37.55 
 
 		 460 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.721167  normal  0.721714 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3857  FAD dependent oxidoreductase  37.34 
 
 		 462 aa  243  3.9999999999999997e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5703  FAD dependent oxidoreductase  37.19 
 
 		 472 aa  241  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0903  FAD dependent oxidoreductase  36.09 
 
 		 454 aa  237  4e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2617  FAD dependent oxidoreductase  35.53 
 
 		 460 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523362  normal  0.489524 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2804  FAD dependent oxidoreductase  36.49 
 
 		 464 aa  207  4e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0699  FAD dependent oxidoreductase  33.69 
 
 		 456 aa  177  5e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  29.79 
 
 		 453 aa  171  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7089  FAD dependent oxidoreductase  33.75 
 
 		 459 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10152 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0284  putative oxidoreductase  32.93 
 
 		 473 aa  162  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3392  FAD dependent oxidoreductase  32.85 
 
 		 464 aa  159  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  32.37 
 
 		 427 aa  156  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1885  hypothetical protein  30.45 
 
 		 464 aa  157  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  30.7 
 
 		 435 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2891  FAD dependent oxidoreductase  30.73 
 
 		 443 aa  154  5e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  30.55 
 
 		 435 aa  154  5e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  29.83 
 
 		 435 aa  154  5e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3014  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 		 435 aa  154  5e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  30.55 
 
 		 435 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1264  oxidoreductase  30.79 
 
 		 435 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5715  FAD dependent oxidoreductase  32.13 
 
 		 480 aa  153  8e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0390  hypothetical protein  28.75 
 
 		 465 aa  153  8.999999999999999e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2905  FAD dependent oxidoreductase  31.38 
 
 		 468 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0519998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2861  FAD dependent oxidoreductase  31.38 
 
 		 468 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3101  FAD dependent oxidoreductase  30.46 
 
 		 435 aa  151  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2810  FAD dependent oxidoreductase  30.3 
 
 		 496 aa  152  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.73838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2922  FAD dependent oxidoreductase  30.46 
 
 		 435 aa  152  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3004  FAD dependent oxidoreductase  29.98 
 
 		 435 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  31.48 
 
 		 435 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3139  aminophosphonate oxidoreductase  32.15 
 
 		 462 aa  147  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000145397 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  32.77 
 
 		 436 aa  146  8.000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3196  FAD dependent oxidoreductase  31.77 
 
 		 462 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2784  FAD dependent oxidoreductase  31.17 
 
 		 483 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  30.21 
 
 		 427 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 		 427 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  30.21 
 
 		 427 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  30.21 
 
 		 427 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  30.31 
 
 		 435 aa  145  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3143  FAD dependent oxidoreductase  31.59 
 
 		 462 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2910  FAD dependent oxidoreductase  30.86 
 
 		 434 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6498  FAD dependent oxidoreductase  31.37 
 
 		 491 aa  144  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.438276  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3861  FAD dependent oxidoreductase  31.76 
 
 		 457 aa  144  5e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3079  aminophosphonate oxidoreductase  32.81 
 
 		 462 aa  144  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0471981 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  32.75 
 
 		 433 aa  143  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3943  FAD dependent oxidoreductase  31.05 
 
 		 428 aa  143  6e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2530  FAD dependent oxidoreductase  31.59 
 
 		 521 aa  143  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  29.75 
 
 		 428 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  32.87 
 
 		 429 aa  142  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  31.28 
 
 		 427 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3001  FAD dependent oxidoreductase  29.64 
 
 		 434 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2387  FAD dependent oxidoreductase  29.64 
 
 		 434 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356658  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  31.05 
 
 		 427 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6350  FAD dependent oxidoreductase  29.9 
 
 		 434 aa  141  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5870  FAD dependent oxidoreductase  27.94 
 
 		 463 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.982629  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  30.24 
 
 		 427 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  29.33 
 
 		 428 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5196  FAD dependent oxidoreductase  30.73 
 
 		 486 aa  140  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2019  FAD dependent oxidoreductase  30.26 
 
 		 473 aa  140  7e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3417  FAD dependent oxidoreductase  29.29 
 
 		 471 aa  139  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000555141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0934  putative oxidoreductase  30.71 
 
 		 440 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3163  aminophosphonate oxidoreductase  31.15 
 
 		 462 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0194513 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4658  FAD dependent oxidoreductase  29.52 
 
 		 449 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1057  FAD dependent oxidoreductase  28.74 
 
 		 435 aa  138  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  31.18 
 
 		 427 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1934  FAD dependent oxidoreductase  27.53 
 
 		 472 aa  138  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  30.21 
 
 		 444 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>