More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0284 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3392  FAD dependent oxidoreductase  68.25 
 
 		 464 aa  639    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0284  putative oxidoreductase  100 
 
 		 473 aa  960    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1885  hypothetical protein  63.28 
 
 		 464 aa  608  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1013  FAD dependent oxidoreductase  66.31 
 
 		 464 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.244373 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7089  FAD dependent oxidoreductase  62.34 
 
 		 459 aa  584  1.0000000000000001e-165  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10152 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5715  FAD dependent oxidoreductase  56.22 
 
 		 480 aa  510  1e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4628  FAD dependent oxidoreductase  55.7 
 
 		 477 aa  483  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2905  FAD dependent oxidoreductase  53.19 
 
 		 468 aa  475  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0519998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3417  FAD dependent oxidoreductase  56.22 
 
 		 471 aa  478  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000555141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3170  FAD dependent oxidoreductase  53.19 
 
 		 477 aa  476  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540221 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2861  FAD dependent oxidoreductase  53.19 
 
 		 468 aa  475  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2891  FAD dependent oxidoreductase  54.73 
 
 		 443 aa  471  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0889  FAD dependent oxidoreductase  51.17 
 
 		 487 aa  448  1e-125  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0095  hypothetical protein  42.7 
 
 		 470 aa  399  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0631849  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3861  FAD dependent oxidoreductase  44.96 
 
 		 457 aa  370  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2784  FAD dependent oxidoreductase  40.87 
 
 		 483 aa  360  4e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1515  FAD dependent oxidoreductase  41.78 
 
 		 463 aa  352  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5196  FAD dependent oxidoreductase  41.9 
 
 		 486 aa  351  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0390  hypothetical protein  36.36 
 
 		 465 aa  328  1.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1549  FAD dependent oxidoreductase  34.14 
 
 		 472 aa  218  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3231  FAD dependent oxidoreductase  34.55 
 
 		 466 aa  211  3e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.749546  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0950  FAD dependent oxidoreductase  35.52 
 
 		 466 aa  199  7e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.230558  normal  0.1985 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1280  FAD dependent oxidoreductase  32.79 
 
 		 462 aa  199  7.999999999999999e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00857441  normal  0.15279 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0903  FAD dependent oxidoreductase  33.49 
 
 		 454 aa  194  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2906  FAD dependent oxidoreductase  33.03 
 
 		 474 aa  190  4e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000261915  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1113  FAD dependent oxidoreductase  32.8 
 
 		 473 aa  189  8e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3762  hypothetical protein  33.56 
 
 		 465 aa  189  8e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3679  FAD dependent oxidoreductase  33.19 
 
 		 463 aa  189  9e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  29.12 
 
 		 453 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5174  FAD dependent oxidoreductase  33.02 
 
 		 456 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5086  FAD dependent oxidoreductase  33.02 
 
 		 456 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.973879  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2810  FAD dependent oxidoreductase  32.86 
 
 		 496 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.73838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3367  aminophosphonate oxidoreductase  33.49 
 
 		 463 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.585702  normal  0.425425 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1987  FAD dependent oxidoreductase  32.17 
 
 		 465 aa  183  6e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129488  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2549  hypothetical protein  33.18 
 
 		 463 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165188  decreased coverage  0.00741775 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1896  FAD dependent oxidoreductase  32.58 
 
 		 460 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117344  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  34.1 
 
 		 437 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 437 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5713  FAD dependent oxidoreductase  32.31 
 
 		 460 aa  181  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3166  FAD dependent oxidoreductase  32.94 
 
 		 463 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  32.53 
 
 		 436 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5464  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 		 456 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2277  FAD dependent oxidoreductase  31.48 
 
 		 486 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0622  FAD dependent oxidoreductase  30.54 
 
 		 463 aa  179  7e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2220  aminophosphonate oxidoreductase  33.49 
 
 		 463 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0253  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  31.91 
 
 		 460 aa  178  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  31.76 
 
 		 430 aa  178  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  34.97 
 
 		 431 aa  177  5e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2026  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 		 460 aa  176  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.721167  normal  0.721714 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44210  putative glycine/D-amino acid oxidase  32.22 
 
 		 465 aa  176  6e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.032969  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  34.97 
 
 		 431 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  32.94 
 
 		 430 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1492  FAD dependent oxidoreductase  32.95 
 
 		 462 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  34.46 
 
 		 431 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3143  FAD dependent oxidoreductase  31.18 
 
 		 491 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  32.63 
 
 		 430 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3857  FAD dependent oxidoreductase  31.53 
 
 		 462 aa  173  7.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0780  FAD dependent oxidoreductase  32.48 
 
 		 469 aa  172  9e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.240885  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3062  FAD dependent oxidoreductase  30.34 
 
 		 482 aa  172  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2617  FAD dependent oxidoreductase  28.99 
 
 		 460 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523362  normal  0.489524 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39720  putative amino acid oxidase  30.16 
 
 		 466 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  33.42 
 
 		 439 aa  171  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6023  hypothetical protein  30.51 
 
 		 466 aa  171  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3196  FAD dependent oxidoreductase  31.18 
 
 		 462 aa  170  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  32.91 
 
 		 439 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0812  FAD dependent oxidoreductase  32.71 
 
 		 473 aa  169  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2804  FAD dependent oxidoreductase  31.91 
 
 		 464 aa  168  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0892  oxidoreductase, FAD-binding  35.85 
 
 		 461 aa  168  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5325  FAD dependent oxidoreductase  31.69 
 
 		 430 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0381154 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000757  glycine/D-amino acid oxidase  27.37 
 
 		 466 aa  167  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270345  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3244  FAD dependent oxidoreductase  31.18 
 
 		 491 aa  167  5e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  32.4 
 
 		 437 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6498  FAD dependent oxidoreductase  29.79 
 
 		 491 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.438276  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3079  aminophosphonate oxidoreductase  30.25 
 
 		 462 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0471981 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  34.11 
 
 		 431 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2153  FAD dependent oxidoreductase  32.26 
 
 		 475 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.518095  normal  0.441318 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5870  FAD dependent oxidoreductase  29.7 
 
 		 463 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.982629  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  33.77 
 
 		 430 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3143  FAD dependent oxidoreductase  30.02 
 
 		 462 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2530  FAD dependent oxidoreductase  30.02 
 
 		 521 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0908  FAD dependent oxidoreductase  28.51 
 
 		 460 aa  163  6e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  32.63 
 
 		 430 aa  163  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2058  hypothetical protein  28.95 
 
 		 480 aa  162  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00793169  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  33.01 
 
 		 430 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6399  twin-arginine translocation pathway signal  30.13 
 
 		 482 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0501  oxidoreductase, FAD-binding  35.58 
 
 		 433 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  33.01 
 
 		 430 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  32.99 
 
 		 427 aa  161  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1990  oxidoreductase, FAD-binding  35.58 
 
 		 433 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2086  oxidoreductase, FAD-binding  35.58 
 
 		 433 aa  161  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133623  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3163  aminophosphonate oxidoreductase  29.56 
 
 		 462 aa  161  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0194513 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0879  FAD dependent oxidoreductase  29.74 
 
 		 491 aa  161  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3139  aminophosphonate oxidoreductase  28.64 
 
 		 462 aa  161  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000145397 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6070  FAD dependent oxidoreductase  33.68 
 
 		 430 aa  161  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2743  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  30.8 
 
 		 455 aa  160  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0233618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19770  hypothetical protein  32.79 
 
 		 468 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6842  FAD dependent oxidoreductase  31.54 
 
 		 465 aa  160  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.133179 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0774  oxidoreductase, FAD-binding  35.32 
 
 		 433 aa  160  6e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1109  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 		 457 aa  160  6e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.921836 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0684  oxidoreductase, FAD-binding  35.32 
 
 		 433 aa  160  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>