More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0253 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0253  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  100 
 
 		 460 aa  908    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1896  FAD dependent oxidoreductase  98.91 
 
 		 460 aa  900    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117344  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2026  FAD dependent oxidoreductase  91.52 
 
 		 460 aa  843    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.721167  normal  0.721714 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1987  FAD dependent oxidoreductase  60.14 
 
 		 465 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129488  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2906  FAD dependent oxidoreductase  55.63 
 
 		 474 aa  462  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000261915  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2058  hypothetical protein  53.75 
 
 		 480 aa  456  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00793169  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6023  hypothetical protein  54.61 
 
 		 466 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1113  FAD dependent oxidoreductase  53.29 
 
 		 473 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3857  FAD dependent oxidoreductase  53.48 
 
 		 462 aa  441  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3062  FAD dependent oxidoreductase  50.96 
 
 		 482 aa  431  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5703  FAD dependent oxidoreductase  52.2 
 
 		 472 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1109  FAD dependent oxidoreductase  51.54 
 
 		 457 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.921836 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5174  FAD dependent oxidoreductase  52.17 
 
 		 456 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5086  FAD dependent oxidoreductase  52.17 
 
 		 456 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.973879  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5464  FAD dependent oxidoreductase  51.95 
 
 		 456 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5713  FAD dependent oxidoreductase  51.85 
 
 		 460 aa  397  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3231  FAD dependent oxidoreductase  47.4 
 
 		 466 aa  361  2e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.749546  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1549  FAD dependent oxidoreductase  45.97 
 
 		 472 aa  356  5.999999999999999e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0950  FAD dependent oxidoreductase  49.64 
 
 		 466 aa  345  1e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.230558  normal  0.1985 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0622  FAD dependent oxidoreductase  45.01 
 
 		 463 aa  338  8e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1280  FAD dependent oxidoreductase  46.05 
 
 		 462 aa  335  7.999999999999999e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00857441  normal  0.15279 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1492  FAD dependent oxidoreductase  44.84 
 
 		 462 aa  316  7e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2617  FAD dependent oxidoreductase  41.69 
 
 		 460 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523362  normal  0.489524 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0908  FAD dependent oxidoreductase  41.94 
 
 		 460 aa  301  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0903  FAD dependent oxidoreductase  41.98 
 
 		 454 aa  292  8e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2153  FAD dependent oxidoreductase  40.69 
 
 		 475 aa  280  5e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.518095  normal  0.441318 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1702  hypothetical protein  41.19 
 
 		 468 aa  269  8e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2675  FAD dependent oxidoreductase  38.29 
 
 		 468 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496606 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19770  hypothetical protein  40.96 
 
 		 468 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0875  FAD dependent oxidoreductase  39.36 
 
 		 476 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.120395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0905  FAD dependent oxidoreductase  39.36 
 
 		 468 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.358766 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0780  FAD dependent oxidoreductase  38.11 
 
 		 469 aa  262  8.999999999999999e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.240885  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2804  FAD dependent oxidoreductase  42.76 
 
 		 464 aa  259  8e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4303  FAD dependent oxidoreductase  39.36 
 
 		 468 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0919  FAD dependent oxidoreductase  39.36 
 
 		 475 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.108527  normal  0.544612 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3143  FAD dependent oxidoreductase  35.55 
 
 		 491 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3244  FAD dependent oxidoreductase  35.76 
 
 		 491 aa  232  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0879  FAD dependent oxidoreductase  35.67 
 
 		 491 aa  226  6e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3678  hypothetical protein  35.04 
 
 		 489 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2910  hypothetical protein  36.88 
 
 		 493 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0812  FAD dependent oxidoreductase  37.19 
 
 		 473 aa  198  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2220  aminophosphonate oxidoreductase  34.02 
 
 		 463 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3679  FAD dependent oxidoreductase  32.88 
 
 		 463 aa  188  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0699  FAD dependent oxidoreductase  35.76 
 
 		 456 aa  188  2e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3367  aminophosphonate oxidoreductase  34.11 
 
 		 463 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.585702  normal  0.425425 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2549  hypothetical protein  34.11 
 
 		 463 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165188  decreased coverage  0.00741775 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3392  FAD dependent oxidoreductase  32.67 
 
 		 464 aa  182  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3166  FAD dependent oxidoreductase  33.87 
 
 		 463 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7089  FAD dependent oxidoreductase  32.56 
 
 		 459 aa  179  9e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10152 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0284  putative oxidoreductase  31.91 
 
 		 473 aa  179  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5715  FAD dependent oxidoreductase  33.63 
 
 		 480 aa  178  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3762  hypothetical protein  32 
 
 		 465 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3946  hypothetical protein  35.21 
 
 		 470 aa  176  9e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0095  hypothetical protein  29.98 
 
 		 470 aa  175  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0631849  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3861  FAD dependent oxidoreductase  33.94 
 
 		 457 aa  175  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44210  putative glycine/D-amino acid oxidase  31.11 
 
 		 465 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.032969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3139  aminophosphonate oxidoreductase  31.61 
 
 		 462 aa  172  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000145397 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6498  FAD dependent oxidoreductase  31.84 
 
 		 491 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.438276  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3143  FAD dependent oxidoreductase  32.29 
 
 		 462 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  31.24 
 
 		 453 aa  171  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3163  aminophosphonate oxidoreductase  32.29 
 
 		 462 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0194513 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2530  FAD dependent oxidoreductase  32.29 
 
 		 521 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3196  FAD dependent oxidoreductase  31.84 
 
 		 462 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3079  aminophosphonate oxidoreductase  31.79 
 
 		 462 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0471981 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1885  hypothetical protein  30.21 
 
 		 464 aa  166  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39720  putative amino acid oxidase  34.42 
 
 		 466 aa  163  6e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2891  FAD dependent oxidoreductase  30.95 
 
 		 443 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556451  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1013  FAD dependent oxidoreductase  31.82 
 
 		 464 aa  159  7e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.244373 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5870  FAD dependent oxidoreductase  30.86 
 
 		 463 aa  160  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.982629  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2277  FAD dependent oxidoreductase  32.4 
 
 		 486 aa  158  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2861  FAD dependent oxidoreductase  30.72 
 
 		 468 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2905  FAD dependent oxidoreductase  30.72 
 
 		 468 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0519998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3417  FAD dependent oxidoreductase  30.09 
 
 		 471 aa  157  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000555141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2784  FAD dependent oxidoreductase  26.94 
 
 		 483 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1934  FAD dependent oxidoreductase  31.38 
 
 		 472 aa  156  6e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2810  FAD dependent oxidoreductase  32.91 
 
 		 496 aa  155  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.73838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3861  FAD dependent oxidoreductase  30.94 
 
 		 470 aa  154  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  0.682317 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4628  FAD dependent oxidoreductase  31.15 
 
 		 477 aa  151  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6399  twin-arginine translocation pathway signal  30.73 
 
 		 482 aa  150  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5196  FAD dependent oxidoreductase  27.03 
 
 		 486 aa  150  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6396  FAD dependent oxidoreductase  31.52 
 
 		 482 aa  149  9e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0152469  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1515  FAD dependent oxidoreductase  27.31 
 
 		 463 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4351  FAD dependent oxidoreductase  31.89 
 
 		 494 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3170  FAD dependent oxidoreductase  27.84 
 
 		 477 aa  146  6e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540221 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0254  FAD dependent oxidoreductase  32.18 
 
 		 443 aa  144  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6842  FAD dependent oxidoreductase  30.89 
 
 		 465 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.133179 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5828  FAD dependent oxidoreductase  32.71 
 
 		 494 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5032  FAD dependent oxidoreductase  32.71 
 
 		 494 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0622047  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0889  FAD dependent oxidoreductase  29.25 
 
 		 487 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2808  oxidoreductase, putative  30.05 
 
 		 455 aa  140  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.479983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  28.21 
 
 		 433 aa  139  8.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  29.53 
 
 		 427 aa  138  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2743  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  30.16 
 
 		 455 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0233618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3646  hypothetical protein  34.57 
 
 		 469 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0271589 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  28.88 
 
 		 428 aa  134  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0390  hypothetical protein  26.86 
 
 		 465 aa  134  5e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  30.25 
 
 		 438 aa  130  6e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  30.52 
 
 		 430 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000757  glycine/D-amino acid oxidase  28.04 
 
 		 466 aa  127  5e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270345  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2227  putative FAD dependent oxidoreductase  32.32 
 
 		 434 aa  127  5e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0806459  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>